Illumina en BGI
Kenmerke
●Platforms:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten en BGI-DNB-T7
●Volgorde-modusse:PE50, PE100, PE150, PE250
●Gehaltebeheer van biblioteke voor volgordebepaling
●Volgorde-aflewering van data en QC:aflewering van QC verslag en rou data in fastq formaat na demultipleksing en filter Q30 lees.
Diensvoordele
●Veelsydigheid van volgordebepalingdienste:die kliënt kan kies om volgens baan, vloeisel of hoeveelheid data te volgorde.
●Veelsydigheid van platforms:DNB-biblioteke kan na Illumina-platforms oorgedra word
●Uitgebreide ervaring op Illumina-volgordeplatform:met duisende geslote projekte met verskeie spesies.
●Lewering van volgorde QC-verslag:met kwaliteit statistieke, data akkuraatheid en algehele prestasie van die volgordebepaling projek.
●Volwasse volgordebepaling proses:met kort omkeertyd.
●Streng kwaliteitbeheer: ons implementeer streng QC-vereistes om die lewering van konsekwent hoë kwaliteit resultate te waarborg.
Voorbeeldvereistes*
Gedeeltelike baanvolgorde
| Databedrag (X) | Konsentrasie (qPCR/nM) | Volume |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Enkelbaan (Illumina)
| Platform | Konsentrasie (qPCR/nM) | Volume |
| HiSeq X Tien | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Benewens konsentrasie en totale hoeveelheid, word 'n geskikte piekpatroon ook vereis.
Kontak ons asseblief as u monsters nie aan die beginmateriaalvereistes voldoen nie.
Dienswerkvloei
Biblioteek kwaliteit beheer
Opeenvolging
Data kwaliteit beheer
Projek aflewering
Biblioteek QC verslag
'n Verslag oor die kwaliteit van die biblioteek word verskaf voor opeenvolging, assessering van biblioteekhoeveelheid en fragmentering.
Volgorde QC verslag
Tabel 1. Statistiek oor volgordebepalingsdata.
| Voorbeeld ID | BMKID | Rou lees | Rou data (bp) | Skoon lees (%) | Q20(%) | V30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figuur 1. Kwaliteitverspreiding langs leesstukke in elke monster
Figuur 2. Basisinhoudverspreiding
Figuur 3. Verspreiding van leesinhoud in volgordebepalingdata
