BMKCloud Aanmeld

Produkte

DNS/RNA-volgordebepaling – Nanoporie-volgordebepaling

ONT-volgordebepaling is 'n enkele molekule intydse elektriese seinvolgordebepalingstegnologie gebaseer op nanoporieë, die volgordebepalingsbeginsel van elke platform is dieselfde. Dubbelstringige DNS/RNA sal bind aan nanoporieuse proteïene wat in die biofilm ingebed is en afwikkel onder leiding van motorproteïen, onder die werking van spanningsverskil van beide kante van die biofilm, beweeg DNS/RNA-stringe teen 'n sekere tempo deur die nanoporiekanaalproteïen. As gevolg van die verskille in die chemiese eienskappe van die verskillende basisse op die DNS/RNA-string, wanneer 'n enkele basis of DNS-molekule deur die nanoporiekanaal beweeg, sal dit die verandering van verskillende elektriese seine veroorsaak. Deur hierdie seine op te spoor en te korrespondeer, kan die ooreenstemmende basistipes bereken word, en die intydse opsporing van die volgorde kan voltooi word.

Kontak Ons

Diensbesonderhede

Demo-resultaat

Diensbesonderhede Kenmerke

Platform	Biblioteekgrootte	Teoretiese Data-opbrengs (per sel)	Enkelbasis-akkuraatheid	Toepassings
Nanoporie	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralang, cDNA-PCR	70-90 Gb/Sel	85-92%	SV-roeping, De novo, Volledige volgordebepaling, Iso-Seq, Geenannotasie, Opsporing van DNA-metilering

Diensvoordele

● Meer as 5 jaar ondervinding op die PacBio-volgordebepalingsplatform met duisende geslote projekte met verskeie spesies.
● BMKGENE is 'n amptelike vennoot van Oxford Nanopore, met dubbele platform RNA/DNA-sertifisering.
● Daar is hoofstroommodelle van sekwenseerders met volledige toerusting en voldoende sekwensiëringsdeurset.
● Gebaseer op die Nanopore-platform, is meer as 10 dier- en plant-Denovo-navorsings in internasionaal bekende tydskrifte gepubliseer.

Voorbeeldvereistes

Voorbeeldtipe

Bedrag

Konsentrasie (Qubit ®)

Volume

Suiwerheid

Ander

Genomiese DNS

Hang af van datavereiste

≥20 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Duidelike piek by 260 nm, geen kontaminasies nie

Konsentrasie moet gemeet word deur Qubit en Qubit/Nanoporie ≤ 2

Totale RNS

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; geen kontaminasies nie

RIN-waarde ≥7.5

Dienswerkvloei

Monstervoorbereiding

Biblioteekkonstruksie

Volgordebepaling

Data-analise

Projeklewering

Vorige: Illumina voorafgemaakte biblioteke

Volgende: Spesifieke-Lokus Versterkte Fragment Volgordebepaling (SLAF-Seq)

Datakwaliteitsassessering van DNS-monster

Tabel 1. Statistiek oor skoon data.

BMKID	rouVolgnommer	rouSomBasis	skoonVolgnommer	skoonSomBasis	skoonN50Len	skoonN90Len	skoonMeanLen	skoonMaxLen	skoonGemiddeldeKwaliteit
DNA_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25.90	28,014	15 764	23 090	143,181	9