Produkte

DNA/RNA-volgordebepaling – Nanopore-volgordebepaling

ONT-volgordebepaling is 'n enkele molekule intydse elektriese seinvolgorde-tegnologie gebaseer op nanopore, die volgordebepalingsbeginsel van elke platform is dieselfde.Dubbelstring DNS/RNA sal bind aan nanoporeuse proteïen wat in die biofilm ingebed is en onder die leiding van motorproteïen afwikkel, onder die werking van spanningsverskil vanaf beide kante van die biofilm, gaan DNS/RNA-stringe deur die nanoporekanaalproteïen op 'n sekere koers.As gevolg van die verskille van die chemiese eienskappe van die verskillende basisse op die DNS/RNA-string, sal dit die verandering van verskillende elektriese seine veroorsaak wanneer 'n enkele basis of DNS-molekule deur die nanopore-kanaal gaan.Deur hierdie seine op te spoor en daarmee ooreenstem, kan die ooreenstemmende basistipes bereken word, en die intydse opsporing van die volgorde kan voltooi word.

Kontak Ons

Diensbesonderhede

Demo resultaat

Diensbesonderhede Kenmerke

Platform	Biblioteekgrootte	Teoretiese data-opbrengs (per sel)	Enkel-basis Akkuraatheid	Aansoeke
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90 Gb/sel	85-92%	SV-roeping, De novo, Vollengte-volgordebepaling, Iso-Seq, Geenannotasie, Opsporing van DNA-metilering

Diensvoordele

● Meer as 5 jaar se ondervinding op PacBio-volgordebepalingsplatform met duisende geslote projekte met verskeie spesies.
● BMKGENE is 'n amptelike vennoot van Oxford Nanopore, met dubbele platform RNA/DNA-sertifisering.
● Daar is hoofstroommodelle van opeenvolgers met volledige toerusting en voldoende opeenvolging deurset.
● Gebaseer op die Nanopore-platform, is meer as 10 diere- en plant-Denovo-navorsings in internasionaal bekende joernale gepubliseer.

Voorbeeldvereistes

Voorbeeld tipe

Bedrag

Konsentrasie (Qubit ®)

Volume

Reinheid

Ander

Genomiese DNA

Hang af van datavereistes

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

Duidelike piek by 260 nm, geen besoedeling nie

Konsentrasie moet gemeet word deur Qubit en Qubit/Nanopore ≤ 2

Totale RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; geen besoedeling nie

RIN-waarde ≥7,5

Dienswerkvloei

Monster voorbereiding

Biblioteek konstruksie

Opeenvolging

Data-analise

Projek aflewering

Vorige: DNA/RNA-volgordebepaling – Illumina-volgordebepaling

Volgende: Spesifieke-lokus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Data Kwaliteit Assessering van DNA Monster

Tabel 1. Statistiek oor skoon data.

BMKID	rouSeqNum	rawSumBase	skoonSeqNum	cleanSumBase	skoonN50Len	skoonN90Len	skoonMeanLen	skoonMaxLen	skoonMeanQual
DNA_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25,90	28 014	15 764	23 090	143 181	9