DNBSEQ voorafgemaakte biblioteke
Kenmerke
●Platform:MGI-DNBSEQ-T7
●Volgordebepalingsmodusse:PE150
●Oordrag van Illumina-biblioteke naMGI:wat die volgordebepaling van hoë datavolumes teen lae koste moontlik maak.
●Kwaliteitsbeheer van biblioteke voor volgordebepaling.
●Volgordebepaling van data, kwaliteitskontrole en aflewering:aflewering van QC-verslag en rou data in fastq-formaat na demultipleksering en filtering van Q30-lesings.
Voordele
●Veelsydigheid van Volgordebepalingsdienste:Die kliënt kan kies om volgens baan of hoeveelheid data te volgorde.
●Hoë data-uitset:1500 Gb/baan
●Aflewering van volgordebepaling QC-verslag:met kwaliteitsmaatstawwe, data-akkuraatheid en algehele prestasie van die volgordebepalingsprojek.
●Volwasse volgordebepalingsproses:met 'n kort omkeertyd.
●Streng gehaltebeheerOns implementeer streng kwaliteitskontrolevereistes om die lewering van konsekwent hoë gehalte resultate te waarborg.
Voorbeeldvereistes
| Datahoeveelheid (X) | Konsentrasie (qPCR/nM) | Volume | |
| Gedeeltelike baan
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Enkelbaan | Per Laan | ≥ 1.5 nM / Biblioteekpoel | ≥ 25 μl / Biblioteekpoel |
Benewens konsentrasie en totale hoeveelheid, is 'n geskikte piekpatroon ook nodig.
Let wel: Baanvolgordebepaling van lae-diversiteitsbiblioteke vereis PhiX-inskakeling om robuuste basisoproepe te verseker.
Ons beveel aan dat voorafgepoolde biblioteke as voorbeelde ingedien word. Indien u vereis dat BMKGENE biblioteekpoeling uitvoer, verwys asseblief na die
biblioteekvereistes vir gedeeltelike baanvolgordebepaling.
Biblioteekgrootte (Piekkaart)
Die hoofpiek moet tussen 300-450 bp wees.
Biblioteke moet 'n enkele hoofpiek hê, geen adapterkontaminasie en geen primerdimere nie.
Dienswerkvloei
Biblioteek-QC-verslag
'n Verslag oor die kwaliteit van die biblioteek word verskaf voor volgordebepaling, beoordeling van biblioteekhoeveelheid en fragmentering.
Volgordebepaling QC-verslag
Tabel 1. Statistiek oor volgordebepalingsdata.
| Voorbeeld-ID | BMKID | Rou leesstukke | Rou data (bp) | Skoon lesings (%) | K20(%) | K30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figuur 1. Kwaliteitsverspreiding langs lesings in elke monster
Figuur 2. Basisinhoudverspreiding
Figuur 3. Verspreiding van geleesde inhoud in volgordebepalingsdata
