Genoomwye Assosiasie Analise
1.Diensvoordele
● Oorvloedige projekgevalle: sedert sy stigting in 2009 het BMKGENE honderde spesieprojekte in populasie-GWAS-navorsing voltooi, navorsers bygestaan om meer as 100 artikels te publiseer, en die kumulatiewe impakfaktor het 500 bereik.
● Professionele ontleders.
● Kort ontledingsiklus.
● Akkurate data-ontginning.
2. Diensspesifikasies
| Tik | Bevolkingskaal | Opeenvolgingstrategie en diepte |
| SLAF-GWAS | Monsternommer ≥200 | Genoomgrootte < 400M, met ref-genoom, WGS word aanbeveel |
| Genoomgrootte ≤ 1G, 100K Tags en 10X | ||
| 1G ≤ Genoomgrootte ≤ 2G, 200K Tags en 10X | ||
| Genoomgrootte > 2G, 300K Tags en 10X | ||
| WGS-GWAS | Monsternommer ≥200 | 10X vir elke monster |
3. Materiaalkeuse
Verskillende variëteite, subspesies, landrasse/genebanke/gemengde families/wilde hulpbronne
Verskillende variëteite, subspesies, landrasse
Half-sib-gesin/volsib-gesin/wilde hulpbronne
4. Bioinligting Analise
● Genoomwye assosiasie-analise
● Analise en sifting van beduidende SNP
● Funksionele annotasie van kandidaatgeen
5. Dienswerkvloei
Eksperiment ontwerp
Voorbeeld aflewering
RNA-ekstraksie
Biblioteek konstruksie
Opeenvolging
Data-analise
Na-verkope dienste
a.Fenotipe QC
Frekwensie verspreiding histogram
Fenotipe statistieke
b.Assosiasie-analise (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ plot
Manhattan plot
| Jaar | Joernaal | IF | Titel |
| 2022 | NC | 17.69 | Genomiese basis van die giga-chromosome en giga-genoom van boompioen Paeonia ostii |
| 2015 | NP | 7,43 | Huishoudelike voetspore anker genomiese streke van agronomiese belang in sojabone |
| 2018 | MP | 9.32 | Heel-genoom hervolgorde van 'n wêreldwye versameling raapsaad-toetredings onthul die genetiese basis van hul ekotipe divergensie |
| 2022 | HR | 7,29 | Genoomwye assosiasie-analise verskaf molekulêre insigte in die natuurlike variasie van waatlemoensaadgrootte |
