条形banner-03

Produkte

Metatranskriptoomvolgordebepaling

Met behulp van Illumina-volgordebepalingstegnologie, onthul BMKGENE se metatranskriptoomvolgordebepalingsdiens die dinamiese geenuitdrukking van 'n diverse verskeidenheid mikrobes, wat strek van eukariote tot prokariote en virusse, binne natuurlike omgewings soos grond, water, see, stoelgang en die ingewande. Ons omvattende diens bemagtig navorsers om in komplekse mikrobiese gemeenskappe se volledige geenuitdrukkingprofiele te delf. Behalwe vir taksonomiese analise, fasiliteer ons metatranskriptoomvolgordebepalingsdiens verkenning na funksionele verryking, en werp lig op differensieel uitgedrukte gene en hul rolle. Ontbloot 'n magdom biologiese insigte terwyl jy die komplekse landskappe van geenuitdrukking, taksonomiese diversiteit en funksionele dinamika binne hierdie diverse omgewingsnisse navigeer.


Diensbesonderhede

Bioinformatika

Demo resultate

Uitgestalte publikasies

Dienskenmerke

● rRNA-uitputting gevolg deur rigtinggewende mRNA-biblioteekvoorbereiding.

● Opeenvolging op Illumina NovaSeq.

Diensvoordele

Bestudeer die veranderinge van komplekse mikrobiese gemeenskappe:Dit gebeur op die transkripsievlak en ondersoek potensiële nuwe gene.

Verduidelik mikrobiese gemeenskapsinteraksies met die gasheer of omgewing.

Omvattende bioinformatiese analise: Dit verskaf insigte oor gemeenskapstaksonomiese en funksionele samestellings, sowel as differensiële geenuitdrukking-analise.

Uitgebreide geenaantekening:Gebruik van bygewerkte geenfunksiedatabasisse vir insiggewende geenuitdrukking-inligting van mikrobiese gemeenskappe.

Ondersteuning na verkope:Ons verbintenis strek verder as projekvoltooiing met 'n 3-maande na-verkope dienstydperk. Gedurende hierdie tyd bied ons projekopvolging, probleemoplossingshulp en V&A-sessies aan om enige navrae wat met die resultate verband hou, aan te spreek.

Diensspesifikasies

Volgorde-platform

Opeenvolgingstrategie

Data aanbeveel

Datakwaliteitbeheer

Illumina NovaSeq

PE150

12 Gb

Q30≥85%

Voorbeeldvereistes

Konsentrasie (ng/µL)

Totale hoeveelheid (µg)

Volume (µL)

OD260/280

OD260/230

RIN

≥50

≥1,0

≥20

1,8-2,0

1,0-2,5

≥6,5

 

 

 

Dienswerkvloei

monster aflewering

Voorbeeld aflewering

Biblioteekvoorbereiding

Biblioteek konstruksie

Opeenvolging

Opeenvolging

Data-analise

Data-analise

Na verkope Dienste

Na-verkope dienste


  • Vorige:
  • Volgende:

  • 流程图7-01

    Sluit die volgende ontleding in:

    ● Opeenvolging van datakwaliteitbeheer

    ● Transkripsie Vergadering

    ● Taksonomiese annotasie en oorvloed

    ● Funksionele annotasie en oorvloed

    ● Uitdrukkingskwantifisering en Differensiële Analise

    Taksonomiese verspreiding van elke monster:

     

     foto 73

     

    Beta-diversiteitsanalise: UPGMA

     

    foto 74 

     

      

    Funksionele annotasie – GAAN oorvloed

     

    foto 75 

     

    Differensiële taksonomie oorvloed – LEFSE

     

     foto 76

     

    Verken die vooruitgang wat deur BMKGene se meta-transkriptomika-volgordebepalingsdienste gefasiliteer word deur 'n saamgestelde versameling publikasies.

    Lu, Z. et al. (2023) 'Suurverdraagsaamheid van laktaatgebruikende bakterieë van die orde Bacteroidales dra by tot die voorkoming van ruminale asidose by bokke wat aangepas is vir 'n hoëkonsentraatdieet',Dierevoeding, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

    Song, Z. et al. (2017) 'Ontwikkeling van kernfunksionele mikrobiota in tradisionele vastestoffermentasie deur hoë-deurset-amplikone en metatranskriptomika-volgordebepaling',Grense in mikrobiologie, 8 (JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/VOL.

    Wang, W. et al. (2022) 'Novel Mycoviruses Discovered from a Metatranscriptomics Survey of the Phytopatogenic Alternaria Fungus',Virusse, 14(11), bl. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

    Wei, J. et al. (2022) 'Parallelle metatranskriptoom-analise onthul die agteruitgang van plant se sekondêre metaboliete deur kewers en hul ingewande simbiote',Molekulêr Ekologie, 31(15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.

    kry 'n kwotasie

    Skryf jou boodskap hier en stuur dit vir ons

    Stuur jou boodskap aan ons: