● rRNA-uitputting gevolg deur rigtinggewende mRNA-biblioteekvoorbereiding.
● Opeenvolging op Illumina NovaSeq.
●Bestudeer die veranderinge van komplekse mikrobiese gemeenskappe:Dit gebeur op die transkripsievlak en ondersoek potensiële nuwe gene.
●Verduidelik mikrobiese gemeenskapsinteraksies met die gasheer of omgewing.
●Omvattende bioinformatiese analise: Dit verskaf insigte oor gemeenskapstaksonomiese en funksionele samestellings, sowel as differensiële geenuitdrukking-analise.
●Uitgebreide geenaantekening:Gebruik van bygewerkte geenfunksiedatabasisse vir insiggewende geenuitdrukking-inligting van mikrobiese gemeenskappe.
●Ondersteuning na verkope:Ons verbintenis strek verder as projekvoltooiing met 'n 3-maande na-verkope dienstydperk. Gedurende hierdie tyd bied ons projekopvolging, probleemoplossingshulp en V&A-sessies aan om enige navrae wat met die resultate verband hou, aan te spreek.
Volgorde-platform | Opeenvolgingstrategie | Data aanbeveel | Datakwaliteitbeheer |
Illumina NovaSeq | PE150 | 12 Gb | Q30≥85% |
Konsentrasie (ng/µL) | Totale hoeveelheid (µg) | Volume (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Sluit die volgende ontleding in:
● Opeenvolging van datakwaliteitbeheer
● Transkripsie Vergadering
● Taksonomiese annotasie en oorvloed
● Funksionele annotasie en oorvloed
● Uitdrukkingskwantifisering en Differensiële Analise
Taksonomiese verspreiding van elke monster:
Beta-diversiteitsanalise: UPGMA
Funksionele annotasie – GAAN oorvloed
Differensiële taksonomie oorvloed – LEFSE
Verken die vooruitgang wat deur BMKGene se meta-transkriptomika-volgordebepalingsdienste gefasiliteer word deur 'n saamgestelde versameling publikasies.
Lu, Z. et al. (2023) 'Suurverdraagsaamheid van laktaatgebruikende bakterieë van die orde Bacteroidales dra by tot die voorkoming van ruminale asidose by bokke wat aangepas is vir 'n hoëkonsentraatdieet',Dierevoeding, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) 'Ontwikkeling van kernfunksionele mikrobiota in tradisionele vastestoffermentasie deur hoë-deurset-amplikone en metatranskriptomika-volgordebepaling',Grense in mikrobiologie, 8 (JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/VOL.
Wang, W. et al. (2022) 'Novel Mycoviruses Discovered from a Metatranscriptomics Survey of the Phytopatogenic Alternaria Fungus',Virusse, 14(11), bl. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Parallelle metatranskriptoom-analise onthul die agteruitgang van plant se sekondêre metaboliete deur kewers en hul ingewande simbiote',Molekulêr Ekologie, 31(15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.