-
PacBio-Vollengte 16S/18S/ITS Amplikon-volgordebepaling
Die Amplicon (16S/18S/ITS) platform is ontwikkel met jare se ondervinding in mikrobiese diversiteitsprojekanalise, wat gestandaardiseerde basiese analise en gepersonaliseerde analise bevat: basiese analise dek die hoofstroomanalise-inhoud van huidige mikrobiese navorsing, die analise-inhoud is ryk en omvattend, en analise-resultate word aangebied in die vorm van projekverslae; Die inhoud van gepersonaliseerde analise is uiteenlopend. Monsters kan gekies word en parameters kan buigsaam ingestel word volgens die basiese analiseverslag en navorsingsdoel, om gepersonaliseerde vereistes te verwesenlik. Windows-bedryfstelsel, eenvoudig en vinnig.
-
PacBio-Volledige Transkriptom (Nie-Verwysing)
Deur Pacific Biosciences (PacBio) isovormvolgordebepalingsdata as invoer te gebruik, kan hierdie toepassing voltydse transkripsievolgordes identifiseer (sonder samestelling). Deur voltydse volgordes teen verwysingsgenoom te karteer, kan transkripsies geoptimaliseer word deur bekende gene, transkripsies, koderingsgebiede, ens. In hierdie geval kan meer akkurate identifikasie van mRNA-strukture, soos alternatiewe splitsing, ens., bereik word. Gesamentlike analise met NGS-transkriptoomvolgordebepalingsdata maak meer omvattende annotasie en meer akkurate kwantifisering in uitdrukking op transkripsievlak moontlik, wat grootliks stroomaf differensiële uitdrukking en funksionele analise bevoordeel.
-
Gereedskapstelle
BMKCloud is 'n toonaangewende bioinformatiese platform wat 'n eenstop-oplossing vir genomiese programme bied, wat wyd vertrou word deur navorsers in verskeie arenas, insluitend medies, landbou, omgewing, ens. BMKCloud is daartoe verbind om geïntegreerde, betroubare en doeltreffende dienste te lewer, insluitend bioinformatiese analiseplatforms en -gereedskap, rekenaarbronne, openbare databasisse, bioinformatiese aanlynkursusse, ens. BMKCloud het verskeie gereeld gebruikte bioinformatiese gereedskap, insluitend geenannotasie, evolusionêre genetiese gereedskap, ncRNA, datakwaliteitsbeheer, samestelling, belyning, data-onttrekking, mutasies, statistieke, figuurgenerator, volgorde-analise, ens.
-
Klein RNS
Klein RNA's is 'n tipe kort, nie-koderende RNA met 'n gemiddelde lengte van 18-30 nt, insluitend miRNA, siRNA en piRNA. Daar is grootliks berig dat hierdie klein RNA's betrokke is by verskeie biologiese prosesse soos mRNA-afbraak, translasie-inhibisie, heterochromatienvorming, ens. Klein RNA-volgordebepalingsanalise is wyd toegepas in studies oor dier-/plantontwikkeling, siektes, virusse, ens. Die klein RNA-volgordebepalingsanaliseplatform bestaan uit standaardanalise en gevorderde data-ontginning. Op grond van RNA-volgordebepalingsdata kan standaardanalise miRNA-identifikasie en -voorspelling, miRNA-teikengeenvoorspelling, annotasie- en ekspressie-analise bewerkstellig. Gevorderde analise maak pasgemaakte miRNA-soektog en -ekstraksie, Venn-diagramgenerering, miRNA- en teikengeennetwerkbou moontlik.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS is 'n platform vir die hervolgordebepaling van die hele genoom, wat ontwikkel is op grond van ryk ervaring in biomerkertegnologieë. Hierdie maklik-om-te-gebruik platform maak dit moontlik om vinnig 'n geïntegreerde ontledingswerkvloei in te dien deur eenvoudig 'n paar basiese parameters in te stel, wat geskik is vir DNS-volgordebepalingsdata wat gegenereer word vanaf beide die Illumina-platform en die BGI-volgordebepalingsplatform. Hierdie platform word op 'n hoëprestasie-rekenaarbediener ontplooi, wat hoogs doeltreffende data-analise in 'n baie beperkte tyd moontlik maak. Gepersonaliseerde data-ontginning is beskikbaar op grond van standaardanalise, insluitend gemuteerde geennavrae, PCR-primerontwerp, ens.
-
mRNA (Verwysing)
Transkriptoom is die skakel tussen genomiese genetiese inligting en die proteoom van biologiese funksie. Transkripsievlakregulering is die belangrikste en mees bestudeerde reguleringsmodus van organismes. Transkriptoomvolgordebepaling kan die transkriptoom op enige tydstip of onder enige toestand orden, met 'n resolusie akkuraat tot 'n enkele nukleotied. Dit kan die vlak van geentranskripsie dinamies weerspieël, gelyktydig skaars en normale transkripsies identifiseer en kwantifiseer, en die strukturele inligting van monsterspesifieke transkripsies verskaf.
Tans word transkriptoomvolgordebepalingstegnologie wyd gebruik in agronomie, medisyne en ander navorsingsvelde, insluitend die regulering van dier- en plantontwikkeling, omgewingsaanpassing, immuuninteraksie, geenlokalisering, spesiegenetiese evolusie en die opsporing van gewasse en genetiese siektes.
-
Metagenomika (NGS)
Hierdie ontledingsplatform is ontwerp vir haelgeweer-metagenomiese data-analise gebaseer op jare se ondervinding. Dit bestaan uit 'n geïntegreerde werkvloei wat verskeie algemeen benodigde metagenomiese ontledings bevat, insluitend dataverwerking, spesievlakstudies, geenfunksievlakstudies, metagenoombinning, ens. Daarbenewens is aangepaste data-ontginningsinstrumente beskikbaar op standaard ontledingswerkvloei, insluitend geen- en spesienavrae, parameterinstelling, gepersonaliseerde figuurgenerering, ens.
-
LncRNA
Lang nie-koderende RNA's (lncRNA) is 'n tipe transkripsies met 'n lengte van langer as 200 nt, wat nie proteïene kan kodeer nie. Akkumulatiewe bewyse dui daarop dat die meeste lncRNA's baie waarskynlik funksioneel is. Hoë-deurset-volgordebepalingstegnologieë en bioinformatiese analise-instrumente bemagtig ons om lncRNA-volgordes en posisioneringsinligting meer doeltreffend te openbaar en lei ons om lncRNA's met belangrike regulatoriese funksies te ontdek. BMKCloud is trots om ons kliënte 'n lncRNA-volgordebepaling-analiseplatform te bied om vinnige, betroubare en buigsame lncRNA-analise te bereik.
-
GWAS
Genoomwye assosiasiestudies (GWAS) is daarop gemik om genetiese variante (genotipe) te identifiseer wat met spesifieke eienskappe (fenotipe) geassosieer word. GWA-studies ondersoek genetiese merkers oor die hele genoom van 'n groot aantal individue en voorspel genotipe-fenotipe-assosiasies deur statistiese analise op populasievlak. Heelgenoom-hervolgordebepaling kan moontlik alle genetiese variante ontdek. Deur fenotipiese data te koppel, kan GWAS verwerk word om fenotipe-verwante SNP's, QTL's en kandidaatgene te identifiseer, wat moderne diere-/plantteling sterk ondersteun. SLAF is 'n selfontwikkelde vereenvoudigde genoomvolgordebepalingstrategie wat genoomwye verspreide merkers, SNP's, ontdek. Hierdie SNP's, as molekulêre genetiese merkers, kan verwerk word vir assosiasiestudies met geteikende eienskappe. Dit is 'n koste-effektiewe strategie om komplekse eienskappe wat met genetiese variasies geassosieer word, te identifiseer.
-
Nanopore Volle lengte transkriptomika
Komplekse en veranderlike alternatiewe isovorme in organismes is belangrike genetiese meganismes vir die regulering van geenekspressie en proteïendiversiteit. Akkurate identifikasie van transkripsiestrukture is die basis vir 'n diepgaande studie van geenekspressie-reguleringspatrone. Die Nanopore-volgordebepalingsplatform het transkriptomiese studies suksesvol na isovormvlak gebring. Hierdie analiseplatform is ontwerp om RNA-Seq-data wat op die Nanopore-platform gegenereer is, te analiseer op grond van die verwysingsgenoom, wat kwalitatiewe en kwantitatiewe analises op beide geenvlak en transkripsievlak bewerkstellig.
-
sirk-RNA
Sirkulêre RNS (sirkulêre RNS) is 'n tipe nie-koderende RNS wat onlangs gevind is om 'n belangrike rol te speel in regulatoriese netwerke wat betrokke is by ontwikkeling, omgewingsweerstand, ens. In teenstelling met lineêre RNS-molekules, bv. mRNA, lncRNA, is die 3'- en 5'-punte van sirkulêre RNS saamgevoeg om 'n sirkelvormige struktuur te vorm, wat hulle beskerm teen vertering van eksonuklease en meer stabiel is as die meeste lineêre RNS. Daar is gevind dat CircRNA uiteenlopende funksies het in die regulering van geenekspressie. CircRNA kan as ceRNA optree, wat mededingend aan miRNA bind, bekend as 'n miRNA-spons. Die CircRNA-volgordebepalingsanaliseplatform bemagtig sirkulêre struktuur- en ekspressie-analise, teikenvoorspelling en gesamentlike analise met ander tipes RNS-molekules.
-
BSA
Die Bulked Segregant Analysis-platform bestaan uit eenstap-standaardanalise en gevorderde analise met aangepaste parameterinstelling. BSA is 'n tegniek wat gebruik word om fenotipe-geassosieerde genetiese merkers vinnig te identifiseer. Die hoofwerkvloei van BSA sluit in: 1. die seleksie van twee groepe individue met uiters teenoorgestelde fenotipes; 2. die samevoeging van die DNA, RNA of SLAF-seq (ontwikkel deur Biomarker) van alle individue om twee bulk DNA te vorm; 3. die identifisering van differensiële volgordes teen die verwysingsgenoom of tussenin, 4. die voorspelling van kandidaat-gekoppelde streke deur die ED- en SNP-indeksalgoritme; 5. Funksionele analise en verryking van gene in kandidaatstreke, ens. Meer gevorderde data-ontginning, insluitend genetiese merkersifting en primerontwerp, is ook beskikbaar.
-
Amplikon (16S/18S/ITS)
Die Amplicon (16S/18S/ITS) platform is ontwikkel met jare se ondervinding in mikrobiese diversiteitsprojekanalise, wat gestandaardiseerde basiese analise en gepersonaliseerde analise bevat: basiese analise dek die hoofstroomanalise-inhoud van huidige mikrobiese navorsing, die analise-inhoud is ryk en omvattend, en analise-resultate word aangebied in die vorm van projekverslae; Die inhoud van gepersonaliseerde analise is uiteenlopend. Monsters kan gekies word en parameters kan buigsaam ingestel word volgens die basiese analiseverslag en navorsingsdoel, om gepersonaliseerde vereistes te verwesenlik. Windows-bedryfstelsel, eenvoudig en vinnig.
