ከፍተኛ የመተላለፊያ ቅደም ተከተል ያለው ትራንስፖዛዝ-አዳራሽ ክሮማቲን (ATAC-seq) ምርመራ
የአገልግሎት ባህሪያት
● አገልግሎት የዲኤንኤ-ፕሮቲን መስተጋብርን ለመጠበቅ ከተወጡት የኒውክሊክ አሲዶች ይልቅ የቲሹ ናሙናዎችን ይፈልጋል።
● የኤታክ ዘዴ የቲሹ መበታተንን ያካትታል፣ ከዚያም የኒውክሊየስ ማግለል፣ የTn5 ሕክምና እና ማጥራት፣ የPCR ማጉላት፣ የመጠን ምርጫ እና ቅደም ተከተልን ያካትታል።
● በኢሉሚና ኖቫሴክ ውስጥ ቅደም ተከተል
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ከፍተኛ ስሜታዊነት፦ዝቅተኛ የመነሻ ሴል ብዛት ለቤተ-መጻሕፍት ዝግጅት እና ቅደም ተከተል በቂ ነው።
●ከፍተኛ መረጃ ሰጪ ቴክኒክ፦ በተመሳሳይ ጊዜ የክፍት ክሮማቲን እና እንደ ትራንስክሪፕሽን ፋክተር ማያያዣ ጣቢያዎች ያሉ ንቁ የቁጥጥር አካላት ጂኖሚክ ቦታዎችን ያሳያል።
●ጥሩ የሙከራ ዳግም ማባዛት: ቴክኒካዊ ቅጂዎች እጅግ በጣም ጥሩ ተደጋጋሚነትን ያሳያሉ።
●ሰፊ እውቀት: በመቶዎች የሚቆጠሩ የATAC ቅደም ተከተል ፕሮጀክቶች በተሳካ ሁኔታ በመጠናቀቅ፣ BMKGENE ከአስር አመታት በላይ ልምድ፣ ከፍተኛ ችሎታ ያለው የትንታኔ ቡድን፣ ሁሉን አቀፍ ይዘት እና እጅግ በጣም ጥሩ የድህረ-ሽያጭ ድጋፍን ያመጣል።
●ከትራንስክሪፕቶሚክስ ትንተና ጋር የመቀላቀል እድል: የኤታክ ሴክ (ATAC seq) ከሌሎች የኦሚክስ መረጃዎች ጋር እንደ RNA-seq (RNA-seq) የተቀናጀ ትንተና እንዲኖር ያስችላል።
● አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክ ትንተና፦ የክሮማቲን ክፍት ክልሎችን እና ተዛማጅ ተግባራቸውን (ፕሮሞተሮች፣ ዩቲዎች፣ ኤክሶኖች፣ ኢንትሮኖች) መለየት ብቻ ሳይሆን በናሙናዎች መካከል በክሮማቲን ክፍት ክልሎች መካከል ያለውን ልዩነት መተንተን ያስችላል።
የአገልግሎት ዝርዝር መግለጫዎች
| ቤተ መጻሕፍት | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የሚመከር የውሂብ ውፅዓት | የጥራት ቁጥጥር |
| ATAC-seq | ኢሉሚና PE150 | > 20 ሚሊዮን ንባቦች እንደ ጂኖም መጠን (የሰው ልጅ፡ 50 ሜትሮች ያነባል) | ሩብ 30≥85% |
የናሙና መስፈርቶች
የናሙናዎች አይነት፡ ቲሹዎች፣ ሕያው ወይም የቀዘቀዙ ሴሎች፣ ደም
● የሞባይል ቁጥር፡ ≥ 106ሴሎች
● የቲሹ ክብደት፡ ≥ 200 ሚ.ግ ትኩስ ቲሹ
● ደም፡ ≥ 4 ሚሊ ሊትር
የአገልግሎት የስራ ፍሰት
የሙከራ ንድፍ
የናሙና አቅርቦት
የዲኤንኤ ማውጣት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች
የሚከተለውን ትንታኔ ያካትታል፡
● ጥሬ የውሂብ ጥራት ቁጥጥር፤
● በካርታ ላይ የተመሠረተ ከፍተኛ ጥሪ ወደ ማጣቀሻ ጂኖም፤
● ከፍተኛ ቦታ ላይ የጂን ማብራሪያ፤
● የሞቲፍ ትንተና፡ የትራንስክሪፕሽን ፋክተር ማያያዣ ጣቢያዎችን መለየት (TFBS)፤
● የዲፈረንሻል ፒክ ትንተና እና ማብራሪያ።
1. በATAC ላይ ያለው የሙቀት ካርታ በTSS እና በአጎራባች ክልሎች (±3 ኪ.ባ) ስርጭት ያነባል
2. የክፍት ክሮማቲን ክልል በተለያዩ የጂኖም ክፍሎች ውስጥ ማሰራጨት
3. በቡድኖች መካከል ያለው የልዩነት ከፍተኛ ጥሪ
በBMKGene's ATAC ቅደም ተከተል አገልግሎቶች የተመቻቹ የምርምር እድገቶችን በተዘጋጁ የህትመቶች ስብስብ ያስሱ።
ፉ፣ ኤ.እና ሌሎችም።(2023) 'የመራራ ሐብሐብ ቴሎሜር-ወደ-ቴሎሜር ጂኖም ስብስብ (Momordica charantia L. var. abbreviata Ser.) የፍራፍሬ እድገትን፣ ቅንብርን እና የብስለት ጄኔቲክ ባህሪያትን ያሳያል'፣የሆርቲካልቸር ምርምር፣ 10(1)። doi: 10.1093 / HR / UHAC228.
ጎንግ፣ ቢ.እና ሌሎችም።(2023) 'በግሊዮማ ውስጥ እንደ ኦንኮጂን ሆኖ የሚፈጠረውን የሴክሬተሪ ኪናሴ FAM20C ኤፒጄኔቲክ እና ግልባጭ ማግበር'፣የጄኔቲክስ እና የጂኖሚክስ ጆርናል፣ 50(6)፣ ገጽ. 422-433። doi: 10.1016 / J.JGG.2023.01.008.
እሱ፣ ዋይ።እና ሌሎችም።(2023) 'ቡቲሬት በሲ-ፎስ-ጥገኛ xCT መገደብን በማነሳሳት በኮሎሬክታል ካንሰር ውስጥ የፌሮፕቶሲስን የመቋቋም አቅም ይለውጣል'፣ሬዶክስ ባዮሎጂ, 65, ገጽ 102822. doi: 10.1016/J.REDOX.2023.102822.
