ምርቶች

*እዚህ የሚታዩት የማሳያ ውጤቶች በሙሉ በባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች የታተሙ ጂኖሞች ናቸው

1.የLTR የግቤት ጊዜ ግምት፡- ይህ አሃዝ ከሌሎች ዝርያዎች ጋር ሲነጻጸር በዌይኒንግ አጃ ጂኖም ውስጥ በLTR-RTs የማስገቢያ ጊዜዎች ውስጥ ልዩ የሆነ የሁለትዮሽ ስርጭት አሳይቷል። የቅርብ ጊዜው ጫፍ ከ0.5 ሚሊዮን ዓመታት በፊት ታይቷል።

ሊ ጓንግ እና ሌሎችም፣የተፈጥሮ ጄኔቲክስ, 2021

2. በቻዮቴ (ሴቺየም ኢዱሌ) ላይ ፊሎጀኒ እና የጂን ቤተሰብ ትንተና፡- ቻዮቴ እና ሌሎች 13 ተዛማጅ የጂን ዝርያዎችን በመተንተን፣ ቻዮቴ ከእባብ ጉጉር (ትሪኮሳንቴስ አንጉና) ጋር በጣም የተቆራኘ ሆኖ ተገኝቷል። ከ27-45 ማይ አካባቢ ከእባብ ጉጉር የተገኘ ቻዮቴ እና ሙሉ የጂኖም መባዛት (WGD) በ25±4 ማይ ውስጥ በቻዮቴ ውስጥ ታይቷል፣ ይህም በኩኩቢትሴያ ውስጥ ሦስተኛው የWGD ክስተት ነው።

ፉ ኤ እና ሌሎችም፣የሆርቲካልቸር ምርምር, 2021

3. የሲንቴንቲ ትንተና፡- በፍራፍሬ እድገት ውስጥ ከፋይቶሆርሞን ጋር የተያያዙ አንዳንድ ጂኖች በቻዮት፣ በእባብ ጉንዳን እና በዱባ ውስጥ ተገኝተዋል። በቻዮት እና በዱባ መካከል ያለው ትስስር በቻዮት እና በእባብ ጉንዳን መካከል ካለው ትንሽ ከፍ ያለ ነው።

ፉ ኤ እና ሌሎችም፣የሆርቲካልቸር ምርምር, 2021

4. የጂን ቤተሰብ ትንተና፡- በጂ.ቱርቤሪ እና ጂ.ዳቪድሶኒ ጂኖሞች ውስጥ የጂን ቤተሰብ መስፋፋት እና መኮማተር ላይ የKEGG ማበልጸግ ከስቴሮይድ ባዮሲንተሲስ እና ከብራሲኖስቴሮይድ ባዮሲንተሲስ ጋር የተያያዙ ጂኖች እንደተስፋፉ አሳይቷል።

ያንግ ዚ እና ሌሎችም፣ቢኤምሲ ባዮሎጂ, 2021

5. የሙሉ ጂኖም ድግግሞሽ ትንተና፡- የ4DTV እና የKs ስርጭት ትንተና የሙሉ ጂኖም ድግግሞሽ ክስተትን አሳይቷል። የውስጠ-ዝርያዎች ጫፎች የድግግሞሽ ክስተቶችን አሳይተዋል። የዝርያዎች መካከል ጫፎች የዝርያዎች ልዩነት ክስተቶችን አሳይተዋል። ትንታኔው እንደሚያመለክተው ከሌሎቹ ሦስት የቅርብ ዝምድና ካላቸው ዝርያዎች ጋር ሲነጻጸር፣ ኦ. ዩሮፓያ በቅርብ ጊዜ ውስጥ ትልቅ የጂን ድግግሞሽ እንዳለፈ አመልክቷል።

ራኦ ጂ እና ሌሎችም፣የሆርቲካልቸር ምርምር, 2021

ቢኤምኬ ኬዝ

ሮዝ ያለ መውጊያ፡ ከእርጥበት መላመድ ጋር የተያያዘ የጂኖሚክ ግንዛቤዎች

የታተመው፦ ብሔራዊ የሳይንስ ግምገማ, 2021

የቅደም ተከተል ስትራቴጂ፡

'ባሲ'ስቶርንለስ' (አር.ዊቹራይናን) ጂኖም:
በግምት 93 X PacBio + በግምት 90 X Nanopore + 267 X Illumina

ቁልፍ ውጤቶች

1. ከፍተኛ ጥራት ያለው የR.wichuriana ጂኖም የተገነባው ለረጅም ጊዜ በተነበቡ የቅደም ተከተል ቴክኒኮች ሲሆን ይህም 530.07 Mb ስብስብ ያስገኛል (የተገመተው የጂኖም መጠን በፍሰት ሳይቶሜትሪ በግምት 525.9 Mb እና በጂኖም ጥናት 525.5 ነበር)፤ ሄትሮዚጎሲቲ 1.03% አካባቢ ነበር። BUSCO የተገመተው ውጤት 93.9% ነበር። ከ"ኦልድ ብሉዝ" (haploOB) ጋር ሲነጻጸር፣ የዚህ ጂኖም ጥራት እና ሙሉነት በመሠረት ነጠላ-ቤዝ ትክክለኛነት እና በLTR አሰባሰብ መረጃ ጠቋሚ (LAI=20.03) ተረጋግጧል። የR.wichuriana ጂኖም 32,674 የፕሮቲን ኮድ ጂኖችን ይዟል።

2. የንጽጽር ጂኖሚክስ፣ የትራንስክሪፕቶሚክስ፣ የጄኔቲክ ህዝብ QTL ትንተናን ያካተተ ባለብዙ-ኦሚክስ መገጣጠሚያ ትንተና፣ በR. wichuriana እና በሮዛ ቺኔንሲስ መካከል ያለውን ወሳኝ ልዩነት አሳይቷል። እንዲሁም፣ በQTL ውስጥ ያሉ ተዛማጅ ጂኖች የአገላለጽ ልዩነት ከስቴም ፕሪክል ንድፍ ጋር የተቆራኘ ሊሆን ይችላል።

በባስዬ ቶርንለስ እና በሮዛ ቺኔንሲስ መካከል የተደረገው የንጽጽር ጂኖሚክስ ትንተና፣ የሲንቴኒ ትንተና፣ የጂን ቤተሰብ ክላስተር፣ የማስፋፊያ እና የመወጠር ትንተናን ጨምሮ በርካታ ልዩነቶችን አሳይቷል፣ እነዚህም በጽጌረዳዎች ውስጥ ካሉት ወሳኝ ባህሪያት ጋር የተያያዙ ናቸው። በNAC እና FAR1/FRS የጂን ቤተሰብ ውስጥ ያለው ልዩ መስፋፋት ከጥቁር ቦታ መቋቋም ጋር የተያያዘ ሊሆን ይችላል።

ዞንግ፣ ኤም.፣ እና ሌሎችም። “ያለ እሾህ ጽጌረዳ፡ ከእርጥበት መላመድ ጋር የተያያዙ የጂኖሚክ ግንዛቤዎች”ብሔራዊ የሳይንስ ግምገማ, 2021;, nwab092.