ሙሉ ርዝመት ያለው mRNA ቅደም ተከተል -PacBio
ባህሪያት
● ከፖሊ-ኤ mRNA የ cDNA ውህደት እና የቤተ-መጽሐፍት ዝግጅት ይከተላል
● በሲሲኤስ ሁነታ ቅደም ተከተል ማድረግ፣ የHiFi ንባቦችን ማመንጨት
● የሙሉ ርዝመት ግልባጮች ቅደም ተከተል
● ትንታኔው የማጣቀሻ ጂኖም አያስፈልገውም፤ ሆኖም ግን፣ ጥቅም ላይ ሊውል ይችላል
● ባዮኢንፎርማቲክ ትንተና የአይሶፎርም ኤልኤንሲአርኤንኤ፣ የጂን ፊውዥንሶች፣ ፖሊ-አዴኒሌሽን እና የጂን መዋቅር ግልባጮችን መተንተን ያስችላል
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ከፍተኛ ትክክለኛነት: የHiFi ንባብ ከNGS ጋር ሲነጻጸር ከ99.9% (Q30) ትክክለኛነት ጋር
● አማራጭ የስፒሊንግ ትንተናየሙሉ ትራንስክሪፕቶችን ቅደም ተከተል ማድረግ የኢሶፎርም መለያ እና ባህሪን ያስችላል
●ሰፊ እውቀትቡድናችን ከ1100 በላይ የPacBio ሙሉ ርዝመት ያላቸውን የትራንስክሪፕቶሜ ፕሮጀክቶችን በማጠናቀቅ እና ከ2300 በላይ ናሙናዎችን በማስኬድ ረገድ ልምድ ያለው በመሆኑ ለእያንዳንዱ ፕሮጀክት ብዙ ልምድ ያመጣል።
●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ: ቁርጠኝነታችን ከፕሮጀክቱ መጠናቀቅ ባሻገር ከሽያጭ በኋላ ለ3 ወራት የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ፣ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመመለስ የፕሮጀክት ክትትል፣ የመላ ፍለጋ እርዳታ እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
የናሙና መስፈርቶች እና አቅርቦት
| ቤተ መጻሕፍት | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የሚመከር ውሂብ | የጥራት ቁጥጥር |
| PolyA የበለፀገ mRNA CCS ቤተ-መጽሐፍት | የፓክባዮ ተከታታይ ክፍል II ፓክባዮ ሬቪዮ | 20/40 Gb 5/10 ኤም ሲሲኤስ | ሩብ 30≥85% |
የናሙና መስፈርቶች፡
ኒውክሊዮታይዶች፡
● ተክሎች፡
ሥር፣ ግንድ ወይም አበባ፡ 450 ሚ.ግ.
ቅጠል ወይም ዘር፡ 300 ሚ.ግ.
ፍራፍሬ፡ 1.2 ግ
● እንስሳ፦
ልብ ወይም አንጀት: 300 ሚ.ግ.
ቪሴራ ወይም አንጎል: 240 ሚ.ግ.
ጡንቻ፡ 450 ሚ.ግ.
አጥንት፣ ፀጉር ወይም ቆዳ፡ 1 ግራም
● አርትሮፖዶች፡
ነፍሳት፡ 6 ግ
ክሩስታሲያ፡ 300 ሚ.ግ.
● ሙሉ ደም: 1 ቱቦ
● ሴሎች፡ 106 ሴሎች
| ኮንክ.(ng/μl) | መጠን (μg) | ንጽሕና | ታማኝነት |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 በጄል ላይ የተወሰነ ወይም ምንም የፕሮቲን ወይም የዲኤንኤ ብክለት አይታይም። | ለተክሎች፡ RIN≥7.5፤ ለእንስሳት፡ RIN≥8.0፤ 5.0≥ 28S/18S≥1.0; የተወሰነ ወይም ምንም የመነሻ ከፍታ የለም |
የሚመከር የናሙና አቅርቦት
ኮንቴይነር፦ 2 ሚሊ ሊትር የሴንትሪፉጅ ቱቦ (የቲን ፎይል አይመከርም)
የናሙና መለያ፡ ቡድን+ድግምግሞሽ ለምሳሌ A1፣ A2፣ A3፤ B1፣ B2፣ B3።
ጭነት፡
1. ደረቅ በረዶ፡- ናሙናዎቹ በከረጢቶች ውስጥ መታሸግ እና በደረቅ በረዶ ውስጥ መቀበር አለባቸው።
2. RNA-ሊረጋጉ የሚችሉ ቱቦዎች፡- RNA ናሙናዎች በRNA ማረጋጊያ ቱቦ ውስጥ ሊደርቁ እና በክፍል ሙቀት ውስጥ ሊላኩ ይችላሉ።
የአገልግሎት የስራ ፍሰት
የሙከራ ንድፍ
የናሙና አቅርቦት
አር ኤን ኤ ማውጣት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች
የሚከተለውን ትንታኔ ያካትታል፡
● ጥሬ የውሂብ ጥራት ቁጥጥር
● አማራጭ የፖሊአዴኒሌሽን ትንተና (APA)
● የውህደት ትራንስክሪፕት ትንተና
● አማራጭ የስፒሊንግ ትንተና
● ቤንችማርኪንግ ዩኒቨርሳል ነጠላ-ቅጂ ኦርቶሎጎች (BUSCO) ትንተና
● አዲስ የትራንስክሪፕት ትንተና፡ የኮድ ቅደም ተከተሎችን መገመት (ሲዲኤስ) እና ተግባራዊ ማብራሪያ
● የlncRNA ትንተና፡ የlncRNA እና የዒላማዎች ትንበያ
● የማይክሮሳተላይት መለያ (SSR)
የቡስኮ ትንተና
አማራጭ የስፒኪንግ ትንተና
አማራጭ የፖሊአዴኒሌሽን ትንተና (APA)
የአዳዲስ ግልባጮች ተግባራዊ ማብራሪያ
በዚህ ተለይቶ በቀረበ ህትመት ውስጥ በBMKGene's Nanopore ሙሉ-ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል አገልግሎቶች የተመቻቹትን እድገቶች ያስሱ።
ማ፣ ዋይ. እና ሌሎች (2023) 'የኔሞፒሌማ ኖሙራይ መርዝ ለይቶ ማወቅን በተመለከተ የፓክባዮ እና የኦንቲ ኤን ኤ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ዘዴዎች ንፅፅር ትንተና'፣ ጂኖሚክስ፣ 115(6)፣ ገጽ 110709። doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709።
ቻኦ፣ ኪ. እና ሌሎች (2019) 'የፖፑለስ ግንድ ትራንስክሪፕቶሜ የእድገት ተለዋዋጭነት'፣ የእፅዋት ባዮቴክኖሎጂ ጆርናል፣ 17(1)፣ ገጽ 206–219። doi: 10.1111/PBI.12958።
ዴንግ፣ ኤች. እና ሌሎች (2022) 'በፍራፍሬ እድገት እና በአክቲኒዲያ ላቲፎሊያ (አስኮርባት-የበለፀገ የፍራፍሬ ሰብል) እና በተያያዙ ሞለኪውላዊ ዘዴዎች ወቅት በአስኮርቢክ አሲድ ይዘት ላይ ተለዋዋጭ ለውጦች'፣ ዓለም አቀፍ የሞለኪውላር ሳይንስ ጆርናል፣ 23(10)፣ ገጽ 5808። doi: 10.3390/IJMS23105808/S1።
ሁዋ፣ ኤክስ. እና ሌሎች (2022) 'በፓሪስ ፖሊፊላ ውስጥ በባዮአክቲቭ ፖሊፊሊኖች ውስጥ የተሳተፉ የባዮሲንተቲክ መንገድ ጂኖች ውጤታማ ትንበያ'፣ የኮሙኒኬሽን ባዮሎጂ 2022 5:1, 5(1), ገጽ 1–10. doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
ሊዩ፣ ኤም. እና ሌሎች (2023) 'የተጣመረ የፓክባዮ ኢሶ-ሴክ እና የኢሉሚና አር ኤን ኤ-ሴክ የቱታ አብሶሉታ (ሜይሪክ) ትራንስክሪፕቶሜ እና ሳይቶክሮም P450 ጂኖች ትንተና'፣ ኢንሴክተሮች፣ 14(4)፣ ገጽ 363። doi: 10.3390/INSECTS14040363/S1።
ዋንግ፣ ሊጁን እና ሌሎች (2019) 'በሪሲነስ ኮሚኒስ ውስጥ የሪሲኖሌይክ አሲድ ባዮሲንተሲስን በተሻለ ለመረዳት የፓክባዮ ነጠላ-ሞለኪውል ቅጽበታዊ ትንተናን ከኢሉሚና አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ጋር በማጣመር የትራንስክሪፕቶሜ ውስብስብነት ጥናት'፣ BMC Genomics, 20(1), ገጽ. 1–17. doi: 10.1186/S12864-019-5832-9።
