BMKCloud Log in
ሰንደቅ-03

ምርቶች

የዝግመተ ለውጥ ጀነቲክስ

የዝግመተ ለውጥ ጀነቲክስ SNPs፣ InDels፣ SVs እና CNVsን ጨምሮ በጄኔቲክ ልዩነቶች ላይ ተመስርተው በተሰጡ ቁሳቁሶች የዝግመተ ለውጥ መረጃ ላይ አጠቃላይ ትርጓሜ ለመስጠት የተነደፈ የታሸገ ተከታታይ አገልግሎት ነው።የዝግመተ ለውጥ ለውጦችን እና የህዝቦችን ጄኔቲክ ባህሪያትን ማለትም እንደ ህዝብ አወቃቀር፣ የዘረመል ልዩነት፣ የሥርዓተ-ፆታ ግንኙነት እና የመሳሰሉትን ለመግለጽ የሚያስፈልጉትን ሁሉንም መሠረታዊ ትንታኔዎች ያቀርባል።


የአገልግሎት ዝርዝሮች

የማሳያ ውጤቶች

የጉዳይ ጥናት

የአገልግሎት ጥቅሞች

1 የዝግመተ ለውጥ ጄኔቲክስ

ታካጊ እና ሌሎች.የእፅዋት መጽሔት, 2013

● በኑክሊዮታይድ እና በአሚኖ አሲድ ደረጃ ላይ ባሉ ልዩነቶች ላይ በመመስረት የዝርያ ልዩነት ጊዜ እና ፍጥነት መገመት
● የተቀናጀ የዝግመተ ለውጥ ተጽዕኖ እና ትይዩ የዝግመተ ለውጥ ተጽዕኖ ባላቸው ዝርያዎች መካከል ይበልጥ አስተማማኝ የሆነ የፊሎጄኔቲክ ግንኙነትን ያሳያል።
● ከባህሪ ጋር የተያያዙ ጂኖችን ለመለየት በዘረመል ለውጦች እና በፍኖታይፕስ መካከል ግንኙነቶችን መፍጠር
● የዝርያዎችን የዝግመተ ለውጥ አቅም የሚያንፀባርቅ የዘረመል ልዩነት መገመት
● ፈጣን የማዞሪያ ጊዜ
● ሰፊ ልምድ፡ BMK ከ12 ዓመታት በላይ በሕዝብ ብዛት እና በዝግመተ ለውጥ ተዛማጅ ፕሮጀክቶች ላይ ከፍተኛ ልምድ ያከማቻል፣ በመቶዎች የሚቆጠሩ ዝርያዎችን ወዘተ የሚሸፍን እና በኔቸር ኮሙኒኬሽንስ፣ ሞለኪውላር ተክሎች፣ ፕላንት ባዮቴክኖሎጂ ጆርናል ወዘተ ላይ በታተሙ ከ80 በላይ ከፍተኛ ፕሮጄክቶችን አበርክቷል።

የአገልግሎት ዝርዝሮች

ቁሶች፡-

በመደበኛነት፣ ቢያንስ ሦስት ንዑስ-ሕዝብ (ለምሳሌ ንዑስ ዝርያዎች ወይም ዝርያዎች) ይመከራል።እያንዳንዱ ንዑስ-ህዝብ ከ 10 ያላነሱ ግለሰቦችን መያዝ አለበት (ተክሎች 15, ብርቅዬ ዝርያዎች ሊቀንስ ይችላል).

የቅደም ተከተል ስልት፡

* WGS ከፍተኛ ጥራት ያለው የማጣቀሻ ጂኖም ላላቸው ዝርያዎች ሊሰራ ይችላል፣ SLAF-Seq ደግሞ ከማጣቀሻ ጂኖም ወይም ከሌላቸው ዝርያዎች ወይም ጥራት የሌለው ጂኖም ጋር ተፈጻሚ ይሆናል።

ለጂኖም መጠን ተፈጻሚ ይሆናል።

WGS

SLAF-መለያዎች (×10,000)

≤ 500 ሜባ

10×/ግለሰብ

WGS የበለጠ ይመከራል

500 ሜባ - 1 ጊባ

10

1 ጊባ - 2 ጊባ

20

≥2 ጊባ

30

ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔዎች

● የዝግመተ ለውጥ ትንተና

● የተመረጠ መጥረግ

● የጂን ፍሰት

● የስነሕዝብ ታሪክ

● የመለያየት ጊዜ

የዝግመተ ለውጥ 2

ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ

የናሙና መስፈርቶች፡

 

ዝርያዎች

 ቲሹ

WGS-NGS

SLAF

እንስሳ

 

  

Visceral ቲሹ

 

0.5-1 ግ

 

 

0.5 ግ

 

 

 የጡንቻ ሕዋስ

የአጥቢ እንስሳት ደም

 

1.5 ሚሊ

 

 

1.5 ሚሊ

 

የዶሮ እርባታ / የዓሳ ደም

ተክል

  

  ትኩስ ቅጠል    

1 ~ 2 ግ

   

0.5-1 ግ

 ፔታል/ግንድ
  ሥር/ ዘር
 

ሕዋሳት

  የዳበረ ሕዋስ    

 

ጂዲኤንኤ

ትኩረት መስጠት
(ng/ul)

መጠን

(አግ)

OD260/OD280

SLAF

≥35

≥1.6

1.6-2.5

WGS-NGS

≥1

≥0.1

-

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

ናሙና QC

የሙከራ ንድፍ

ናሙና መላኪያ

ናሙና መላኪያ

የቤተ መፃህፍት ዝግጅት

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

የውሂብ ትንተና

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች


  • ቀዳሚ፡
  • ቀጣይ፡-

  • *እዚህ የሚታዩት የማሳያ ውጤቶች ሁሉም በ BMKGENE የታተሙ ጂኖም ናቸው።

    1.የዝግመተ ለውጥ ትንተና በጄኔቲክ ልዩነቶች ላይ የተመሰረተ የፋይሎጄኔቲክ ዛፍ, የህዝብ አወቃቀር እና PCA ግንባታ ይዟል.

    የፋይሎኔቲክ ዛፍ የጋራ ቅድመ አያት ባላቸው ዝርያዎች መካከል የታክስኖሚክ እና የዝግመተ ለውጥ ግንኙነቶችን ይወክላል።
    PCA ዓላማው በንዑስ ሕዝብ መካከል ያለውን ቅርበት ለማየት ነው።
    የህዝብ አወቃቀር በጄኔቲክ የተለየ ንዑስ-ሕዝብ በ allele frequencies ውስጥ መኖሩን ያሳያል።

    3-1 ፊሎጄኔቲክ-ዛፍ 3-2 ፒሲኤ 3-3 የህዝብ-መዋቅር

    ቼን ፣ ወዘተ.አል.ፒኤንኤኤስ, 2020

    2.የተመረጠ መጥረግ

    የተመረጠ መጥረግ የሚያመለክተው ጠቃሚ ቦታ የሚመረጥበት እና የተገናኙት ገለልተኛ ጣቢያዎች ድግግሞሾች የሚጨመሩበት እና ያልተገናኙ ድረ-ገጾች የሚቀንሱበት ሂደት ሲሆን ይህም ክልላዊ መቀነስን ያስከትላል።

    በተመረጡ ጠረጋ ክልሎች ላይ ጂኖም-ሰፊ ማወቂያ የሚከናወነው በተወሰነ ደረጃ (10 ኪባ) ውስጥ የሁሉንም SNPs የህዝብ ጀነቲካዊ መረጃ ጠቋሚ (π, Fst, Tajima's D) በማስላት ነው.

    የኑክሊዮታይድ ልዩነት (π)
    4 ኑክሊዮታይድ-ልዩነት (π)

    የታጂማ ዲ
    5ታጂማስ-ዲ

    የመጠገን መረጃ ጠቋሚ (ኤፍኤስ)

    6 መጠገኛ-ኢንዴክስ (Fst)

    Wu፣ et.አል.ሞለኪውላዊ ተክል, 2018

    3.የጂን ፍሰት

    7 የጂን-ፍሰት

    Wu፣ et.አል.ሞለኪውላዊ ተክል, 2018

    4. የስነሕዝብ ታሪክ

    8 የስነሕዝብ-ታሪክ

    ዣንግ፣ ወዘተ.አል.ተፈጥሮ ኢኮሎጂ እና ዝግመተ ለውጥ, 2021

    5.Divergence ጊዜ

    9 የልዩነት ጊዜ

    ዣንግ፣ ወዘተ.አል.ተፈጥሮ ኢኮሎጂ እና ዝግመተ ለውጥ, 2021

    BMK መያዣ

    የጂኖሚክ ልዩነት ካርታ ስለ ስፕሪንግ ቻይንኛ ጎመን (Brassica rapa spp. Pekinensis) ምርጫ የጄኔቲክ መሠረት ግንዛቤዎችን ይሰጣል ።

    የታተመ ሞለኪውላዊ ተክል, 2018

    የቅደም ተከተል ስልት፡

    ተከታይ፡-የቅደም ተከተል ጥልቀት፡10×

    ቁልፍ ውጤቶች

    በዚህ ጥናት 194 የቻይንኛ ጎመን በአማካይ 10× ጥልቀት እንዲሰራ ተደርጎ የተሰራ ሲሆን ይህም 1,208,499 SNPs እና 416,070 Indels አስገኝቷል።በነዚህ 194 መስመሮች ላይ የፋይሎጀኔቲክ ትንታኔ እንደሚያሳየው እነዚህ መስመሮች በሶስት ኢኮታይፕ ማለትም በፀደይ፣ በጋ እና በመጸው ሊከፈሉ ይችላሉ።በተጨማሪም ፣የሕዝብ አወቃቀር እና PCA ትንታኔ እንደሚያመለክተው የፀደይ የቻይና ጎመን በሻንዶንግ ፣ ቻይና ከበልግ ጎመን የተገኘ ነው።እነዚህ በኋላ ኮሪያ እና ጃፓን ጋር ተዋወቀ, በአካባቢው መስመሮች ጋር ተሻገሩ እና አንዳንድ ዘግይቶ-bolting ዝርያዎች ቻይና ተመልሰው አስተዋወቀ እና በመጨረሻም ጸደይ የቻይና ጎመን ሆነዋል.

    በፀደይ የቻይና ጎመን እና በመኸር ጎመን ላይ የተደረገ የጂኖም ሰፊ ቅኝት 23 ጂኖሚክ ሎሲዎች በጠንካራ ምርጫ ውስጥ ያለፉ ሲሆን ከእነዚህ ውስጥ ሁለቱ በ QTL-ካርታ ላይ የተመሰረተ የቦልቲንግ ጊዜ መቆጣጠሪያ ክልል ጋር ተደራራቢ ናቸው።እነዚህ ሁለት ክልሎች አበባን የሚቆጣጠሩ ቁልፍ ጂኖች BrVIN3.1 እና BrFLC1 እንደያዙ ተገኝተዋል።እነዚህ ሁለቱ ጂኖች በትራንስክሪፕት ጥናት እና በትራንስጀኒክ ሙከራዎች ተጨማሪ ጊዜን በማጥፋት ላይ እንደሚሳተፉ ተረጋግጧል።

    ፒቢ-ሙሉ-ርዝመት-አር ኤን ኤ-ቅደም ተከተል-የጉዳይ-ጥናት።

    በቻይና ጎመን ላይ የህዝብ አወቃቀር ትንተና

    ፒቢ-ሙሉ-ርዝመት-አር ኤን ኤ-አማራጭ-ስፕሊሲንግ

    በቻይንኛ ጎመን ምርጫ ላይ የዘረመል መረጃ

     
    ማጣቀሻ

    ቶንቢንግ እና ሌሎች."የጂኖሚክ ልዩነት ካርታ ስለ ስፕሪንግ ቻይንኛ ጎመን (Brassica rapa ssp.pekinensis) ምርጫ የጄኔቲክ መሰረት ግንዛቤን ይሰጣል።"ሞለኪውላዊ ተክሎች,11 (2018): 1360-1376.

    ጥቅስ ያግኙ

    መልእክትህን እዚህ ጻፍ እና ላኩልን።

    መልእክትህን ላክልን፡