የዝግመተ ለውጥ ጄኔቲክስ
የአገልግሎት ጥቅሞች
ታካጊ እና ሌሎችም፣የእፅዋት ጆርናል, 2013
●አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክ ትንተና;የዝርያዎችን የዝግመተ ለውጥ አቅም የሚያንፀባርቀውን የጄኔቲክ ልዩነት ግምትን ያስችላል፣ እና በተለዋዋጭ ዝግመተ ለውጥ እና በትይዩ ዝግመተ ለውጥ ተጽዕኖ ባላቸው ዝርያዎች መካከል አስተማማኝ የፊሎጄኔቲክ ግንኙነትን ያሳያል
●አማራጭ ብጁ ትንተና: እንደ ኑክሊዮታይድ እና አሚኖ አሲዶች ደረጃ ላይ ባሉ ልዩነቶች ላይ በመመስረት የመለየት ጊዜ እና ፍጥነት ግምት።
●ሰፊ የኤክስፐርት እና የህትመት መዝገቦችቢኤምኬጂን ከ15 ዓመታት በላይ በሕዝብ ብዛት እና በዝግመተ ለውጥ ጄኔቲክስ ፕሮጀክቶች ውስጥ ሰፊ ልምድ አከማችቷል፣ በሺዎች የሚቆጠሩ ዝርያዎችን ወዘተ ይሸፍናል፣ እና በኔቸር ኮሙኒኬሽንስ፣ ሞለኪውላር ፕላንትስ፣ የእፅዋት ባዮቴክኖሎጂ ጆርናል፣ ወዘተ ላይ ለታተሙ ከ1000 በላይ ከፍተኛ ደረጃ ያላቸው ፕሮጀክቶችን አበርክቷል።
● ከፍተኛ ችሎታ ያለው የባዮኢንፎርማቲክስ ቡድን እና አጭር የትንታኔ ዑደትየቢኤምኬጂኔ ቡድን በተራቀቀ የጂኖሚክስ ትንተና ጥሩ ልምድ ስላለው፣ ፈጣን የማለፊያ ጊዜ ያለው አጠቃላይ ትንታኔዎችን ያቀርባል።
● የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ፡ቁርጠኝነታችን ከፕሮጀክቱ መጠናቀቅ ባሻገር ከሽያጭ በኋላ ለ3 ወራት የሚቆይ የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ፣ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመመለስ የፕሮጀክት ክትትል፣ የመላ ፍለጋ እርዳታ እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
የአገልግሎት ዝርዝሮች እና መስፈርቶች
| የቅደም ተከተል አይነት | የሚመከር የህዝብ ብዛት መለኪያ | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የኒውክሊዮታይድ መስፈርቶች |
| ሙሉ የጂኖም ቅደም ተከተል | ≥ 30 ግለሰቦች፣ ከእያንዳንዱ ንዑስ ቡድን ≥ 10 ግለሰቦች
| 10x | ማጎሪያ፡ ≥ 1 ng/ µL ጠቅላላ መጠን≥ 30ng የተወሰነ ወይም ምንም መበላሸት ወይም ብክለት የለም |
| ስፔሲፊክ-ሎከስ አምፕሊፋይድ ፍራግመንት (SLAF) | የመለያ ጥልቀት፡ 10x የመለያዎች ብዛት፡ <400 ሜባ፡ WGS ይመከራል <1Gb: 100ሺህ መለያዎች 1ጂቢ >2Gb: 300ሺህ መለያዎች ቢበዛ 500ሺህ መለያዎች | ማጎሪያ ≥ 5 ng/µL ጠቅላላ መጠን ≥ 80 ንግ ናኖድሮፕ OD260/280=1.6-2.5 የአጋሮዝ ጄል፡- ምንም ወይም የተወሰነ መበላሸት ወይም ብክለት የለም
|
የአገልግሎት የስራ ፍሰት
የሙከራ ንድፍ
የናሙና አቅርቦት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች
አገልግሎቱ የሕዝብ አወቃቀር ትንተና (የፊሎጄኔቲክ ዛፍ፣ PCA፣ የሕዝብ ክፍፍል ገበታ)፣ የሕዝብ ብዛት ልዩነት እና የሕዝብ ምርጫ (የግንኙነት አለመመጣጠን፣ ጠቃሚ ቦታዎችን መምረጥ) ያካትታል። አገልግሎቱ ብጁ ትንተናን (ለምሳሌ የመለየት ጊዜ፣ የጂን ፍሰት) ሊያካትት ይችላል።
*እዚህ የሚታዩት የማሳያ ውጤቶች በሙሉ በBMKGENE የታተሙ ጂኖሞች ናቸው
1. የዝግመተ ለውጥ ትንተና የፊሎጄኔቲክ ዛፍ ግንባታ፣ የህዝብ አወቃቀር እና በጄኔቲክ ልዩነቶች ላይ የተመሠረተ PCA ያካትታል።
የፊሎጄኔቲክ ዛፍ ከጋራ ቅድመ አያቶች ጋር ባሉ ዝርያዎች መካከል የታክሶኖሚክ እና የዝግመተ ለውጥ ግንኙነቶችን ይወክላል።
ፒሲኤ በንዑስ ሕዝብ መካከል ያለውን ቅርበት በዓይነ ሕሊናችን ለመሳል ያለመ ነው።
የሕዝብ ብዛት አወቃቀር በአሌል ድግግሞሽ ረገድ በጄኔቲክ የተለዩ ንዑስ ሕዝብ መኖሩን ያሳያል።
ቼን፣ ወዘተ.ፒኤንኤኤስ (PNAS), 2020
2. የተመረጠ ጠራርጎ
የተመረጠ ጥርጊያ ማለት ጠቃሚ የሆነ ጣቢያ የሚመረጥበት እና የተገናኙ ገለልተኛ ጣቢያዎች ድግግሞሽ የሚጨምርበት እና ያልተገናኙ ጣቢያዎች ድግግሞሽ የሚቀንስበት ሂደት ሲሆን ይህም የክልል መቀነስን ያስከትላል።
በተመረጡ የጥልፍ ክልሎች ላይ ጂኖም-አቀፍ ምርመራ የሚከናወነው በተወሰነ ደረጃ (10 ኪ.ባ.) በተንሸራታች መስኮት (100 ኪ.ባ.) ውስጥ ያሉትን ሁሉንም SNPዎች የህዝብ ጄኔቲክ ኢንዴክስ (π፣ Fst፣ Tajima's D) በማስላት ነው።
የኒውክሊዮታይድ ልዩነት(π）)
የታጂማ ዲ
የፊክስ ኢንዴክስ (Fst)
ዉ፣ ወዘተ.ሞለኪውላር ተክል, 2018
3. የጂን ፍሰት
ዉ፣ ወዘተ.ሞለኪውላር ተክል, 2018
4. የስነ-ሕዝብ ታሪክ
ዣንግ፣ ወዘተ.የተፈጥሮ ኢኮሎጂ እና ዝግመተ ለውጥ, 2021
5. የመለያየት ጊዜ
ዣንግ፣ ወዘተ.የተፈጥሮ ኢኮሎጂ እና ዝግመተ ለውጥ, 2021
በBMKGene የዝግመተ ለውጥ ጄኔቲክስ አገልግሎቶች የተመቻቹትን እድገቶች በተዘጋጁ የህትመቶች ስብስብ ያስሱ፡
ሀሰንያር፣ ኤኬ እና ሌሎችም (2023) 'በአፒስ ሴራና ሴራና እጭ ውስጥ በሙሉ-ጂኖም ቅደም ተከተል አማካኝነት የSNP ሞለኪውላር ማርከሮች እና እጩ ጂኖች ግኝት'፣ዓለም አቀፍ የሞለኪውላር ሳይንስ ጆርናል24(7)። doi: 10.3390 / IJMS24076238.
ቻይ፣ ጄ. እና ሌሎች (2022) 'የዱር፣ የጄኔቲክ ንፁህ የቻይና ግዙፍ ሳላማንደር ግኝት አዳዲስ የጥበቃ እድሎችን ይፈጥራል'፣የእንስሳት ጥናት, 2022, ጥራዝ 43, እትም 3, ገጾች: 469-480, 43(3), ገጾች 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
ሃን፣ ኤም. እና ሌሎች (2022) 'የፊሎጎግራፊክ ንድፍ እና የህዝብ ዝግመተ ለውጥ የአገሬው ተወላጅ የኤሊመስ ሲቢሪከስ ኤል. ታሪክ በኪንጋይ-ቲቤታን ፕላቶ'፣በእፅዋት ሳይንስ ውስጥ ያሉ ድንበሮች, 13, ገጽ 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
ዋንግ፣ ጄ. እና ሌሎች (2022) 'ከክሮሞሶም ደረጃ የጂኖም ስብስብ እና የሎንግአን ተደራሽነት የህዝብ ጂኖሚክስ የሎንግአን ዝግመተ ለውጥን በተመለከተ የጂኖሚክ ግንዛቤዎች'፣የሆርቲካልቸር ምርምር, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
