ምርቶች

ባለሙሉ ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል-ናኖፖር

የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል ለአጠቃላይ የጽሑፍ ግልባጭ ትንተና በዋጋ ሊተመን የማይችል መሳሪያ ነው።ምንም ጥርጥር የለውም፣ ተለምዷዊ የአጭር-ንባብ ቅደም ተከተል እዚህ ውስጥ ብዙ ጠቃሚ እድገቶችን አግኝቷል።ቢሆንም፣ ብዙ ጊዜ በሙሉ ርዝመት አይዞፎርም መለያዎች፣ መጠናዊ፣ PCR አድልዎ ላይ ገደቦች ያጋጥመዋል።

የናኖፖር ቅደም ተከተል እራሱን ከሌሎች ተከታታይ መድረኮች ይለያል, ምክንያቱም ኑክሊዮታይዶች ያለ ዲ ኤን ኤ ውህደት በቀጥታ ይነበባሉ እና በአስር ኪሎባዝ ረጅም ንባብ ያመነጫሉ.ይህ በቀጥታ የተነበበ የሙሉ ርዝመት ግልባጮችን ማቋረጫ እና በአይሶፎርም-ደረጃ ጥናቶች ውስጥ ያሉ ተግዳሮቶችን ለመቋቋም ኃይል ይሰጣል።

መድረክ፦ናኖፖሬ ፕሮሜሽን

ቤተ መጻሕፍት፡ሲዲኤንኤ-PCR

አግኙን

የአገልግሎት ዝርዝሮች

የማሳያ ውጤቶች

የጉዳይ ጥናት

የአገልግሎት ጥቅሞች

● ዝቅተኛ ቅደም ተከተል አድልዎ

● ሙሉ ርዝመት ያላቸው የሲዲኤንኤ ሞለኪውሎች መግለጥ

● ተመሳሳይ የጽሑፍ ግልባጮችን ለመሸፈን ያነሰ መረጃ ያስፈልጋል

● ብዙ አይዞፎርሞችን በአንድ ጂን መለየት

● በአይሶፎርም ደረጃ የመግለፅ መጠን

የአገልግሎት ዝርዝሮች

ቤተ መፃህፍት

መድረክ

የሚመከር የውሂብ ምርት (ጂቢ)

የጥራት ቁጥጥር

cDNA-PCR(ፖሊ-ኤ የበለፀገ)

ናኖፖሬ ፕሮሜትሽን P48

6 ጊባ/ናሙና (እንደ ዝርያው ይወሰናል)

ባለሙሉ ርዝመት ሬሾ -70%

አማካይ የጥራት ነጥብ፡ Q10

ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔዎች

●ጥሬ መረጃ ማቀናበር

● ግልባጭ መለያ

● አማራጭ መሰንጠቅ

● በጂን ደረጃ እና በአይሶፎርም ደረጃ የመግለፅ መጠን

● ልዩነት መግለጫ ትንተና

● የተግባር ማብራሪያ እና ማበልጸግ (DEGs እና DETs)

ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ

የናሙና መስፈርቶች፡

ኑክሊዮታይዶች;

ኮንክ.(ng/μl)

መጠን (μg)

ንጽህና

ታማኝነት

≥ 100

≥ 0.6

OD260/280 = 1.7-2.5

OD260/230 = 0.5-2.5

የተወሰነ ወይም ምንም የፕሮቲን ወይም የዲኤንኤ ብክለት በጄል ላይ አይታይም።

ለእጽዋት፡ RIN≥7.0;

ለእንስሳት፡ RIN≥7.5;

5.0≥28S/18S≥1.0;

የተገደበ ወይም የመነሻ ከፍታ የለውም

ቲሹ፡ ክብደት(ደረቅ)፡ ≥1 ግ

*ከ 5 ሚ.ግ በታች ለሆኑ ቲሹዎች ፍላሽ የቀዘቀዘ (ፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ) ቲሹ ናሙና ለመላክ እንመክራለን።

የሕዋስ መታገድ፡ የሕዋስ ብዛት = 3×10⁶- 1×10⁷

* የቀዘቀዙ የሴል ሊዛትን ለመላክ እንመክራለን።ያ ሕዋስ ከ5×10 ያነሰ ቢቆጠር⁵, በፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ የቀዘቀዘ ብልጭታ ይመከራል, ይህም ለማይክሮ ማውጣት ይመረጣል.

የደም ናሙናዎች: መጠን≥1 ml

የሚመከር ናሙና ማድረስ

መያዣ፡ 2 ሚሊ ሴንትሪፉጅ ቱቦ (ቲን ፎይል አይመከርም)

የናሙና መሰየሚያ፡ ቡድን+ ማባዛት ለምሳሌ A1፣ A2፣ A3;B1፣ B2፣ B3......

ጭነት: 2, ደረቅ-በረዶ: ናሙናዎች በከረጢቶች ውስጥ ተጭነው በደረቅ በረዶ ውስጥ መቀበር አለባቸው.

RNAstable tubes፡ የአር ኤን ኤ ናሙናዎች በአር ኤን ኤ ማረጋጊያ ቱቦ (ለምሳሌ RNAstable®) ውስጥ ይደርቃሉ እና በክፍል ሙቀት ውስጥ ይላካሉ።

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

ኑክሊዮታይዶች;

ናሙና መላኪያ

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

ቲሹ

የሙከራ ንድፍ

ናሙና መላኪያ

አር ኤን ኤ ማውጣት

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች

ቀዳሚ፡ ባለሙሉ ርዝመት mRNA ቅደም ተከተል -PacBio

ቀጣይ፡- 10x ጂኖሚክስ ቪዚየም የቦታ ትራንስክሪፕት

1.ልዩነት መግለጫ ትንተና - የእሳተ ገሞራ ሴራ

የልዩነት አገላለጽ ትንተና በሁለቱም የጂን ደረጃ በልዩ ሁኔታ የተገለጡ ጂኖችን (DEGs) ለመለየት እና በአይሶፎርም ደረጃ ልዩነትን መለየት ይቻላል ።

3(1)

የተገለጡ ግልባጮች (DETs)

2.ተዋረዳዊ ክላስተር ሙቀት ካርታ

3.Alternative splicing መለያ እና ምደባ

አምስት አይነት የአማራጭ ስፕሊንግ ክስተቶች በአስታላቪስታ ሊተነብዩ ይችላሉ።

4.ተለዋጭ ፖሊ-አድኒሌሽን (ኤ.ፒ.ኤ) ክስተቶችን መለየት እና Motif በ 50 ቢፒ ከፍ ፖሊ-A

BMK መያዣ

ተለዋጭ ስፔሊንግ መለየት እና የአይዞፎርም-ደረጃ መጠን በናኖፖር የሙሉ ርዝመት ትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል

የታተመተፈጥሮ ግንኙነቶች፣2020

የቅደም ተከተል ስልት፡

መቧደን፡ 1. CLL-SF3B1(WT);2. CLL-SF3B1 (K700E ሚውቴሽን);3. መደበኛ ቢ-ሴሎች

የቅደም ተከተል ስልት፡ MinION 2D ቤተመፃህፍት ቅደም ተከተል፣ PromethION 1D ቤተመፃህፍት ቅደም ተከተል;አጭር-ተነባቢ ውሂብ ከተመሳሳይ ናሙናዎች

ቅደም ተከተል መድረክ: ናኖፖሬ ሚኒዮን;ናኖፖሬ ፕሮሜሽን;

ቁልፍ ውጤቶች

1.አይሶፎርም-ደረጃ አማራጭ ስፕሊንግ መለያ

ለረጅም ጊዜ የተነበቡ ቅደም ተከተሎች የሚውቴሽን SF3B1 መለየትን ያበረታታል።^K700E-በአይዞፎርም-ደረጃ የተቀየሩ የተከፋፈሉ ቦታዎች።35 አማራጭ 3′SSs እና 10 አማራጭ 5′SSs በSF3B1 መካከል በከፍተኛ ሁኔታ የተከፋፈሉ ሆነው ተገኝተዋል።^K700Eእና SF3B1^WT.ከ35ቱ ለውጦች 33ቱ አዲስ የተገኙት ለረጅም ጊዜ በተነበቡ ቅደም ተከተሎች ነው።

2.Isoform-ደረጃ አማራጭ Splicing quantification

የኢንትሮን ማቆየት (IR) isoforms በ SF3B1 ውስጥ መግለጫ^K700Eእና SF3B1^WTበ SF3B1 ውስጥ የ IR isoforms ዓለም አቀፋዊ የቁጥጥር ቁጥጥርን በማሳየት በናኖፖር ቅደም ተከተሎች ላይ ተመስርቷል ።^K700E.

ማጣቀሻ

ታንግ AD፣ Soulette CM፣ Baren MJV እና ሌሎችም።ሥር በሰደደ የሊምፎይቲክ ሉኪሚያ ውስጥ ያለው የSF3B1 ሚውቴሽን የሙሉ ርዝመት ግልባጭ የተያዙ ኢንትሮኖች[J] መውረድን ያሳያል።የተፈጥሮ ግንኙነቶች.