-
የእፅዋት/የእንስሳ ደ ኖቮ ጂኖም ቅደም ተከተል
ደ ኖቮቅደም ተከተል የማመሳከሪያ ጂኖም በሌለበት ሁኔታ ቅደም ተከተል ቴክኖሎጂዎችን በመጠቀም የአንድ ዝርያ ሙሉ ጂኖም መገንባትን ያመለክታል።የሶስተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል ቴክኖሎጂዎች የንባብ ርዝመት አስደናቂ መሻሻል ውስብስብ ጂኖምዎችን በመገጣጠም ረገድ አዳዲስ እድሎችን አምጥቷል ፣ ለምሳሌ ከፍተኛ heterozygosity ፣ ከፍተኛ ተደጋጋሚ ክልሎች ፣ ፖሊፕሎይድ ፣ ወዘተ. ተደጋጋሚ ንጥረ ነገሮችን, ያልተለመዱ የጂ.ሲ.ሲ ይዘቶች እና ሌሎች በጣም ውስብስብ ክልሎችን መፍታት.
መድረክ፡ PacBio Sequel II/Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
-
ሃይ-ሲ የተመሰረተ ጂኖም ጉባኤ
Hi-C የክሮሞሶም ውቅረትን ለመያዝ የተነደፈ ዘዴ ሲሆን በመመርመሪያ ቅርበት ላይ የተመሰረቱ መስተጋብሮችን እና ከፍተኛ ሂደትን በማጣመር ነው።የእነዚህ ግንኙነቶች ጥንካሬ በክሮሞሶም ውስጥ ካለው አካላዊ ርቀት ጋር አሉታዊ በሆነ መልኩ የተዛመደ ነው ተብሎ ይታመናል.ስለዚህ የHi-C መረጃ የተገጣጠሙ ቅደም ተከተሎችን በረቂቅ ጂኖም ውስጥ ማሰባሰብ፣ ማዘዝ እና አቅጣጫ ማስያዝ እና እነዚያን በተወሰኑ የክሮሞሶምች ብዛት ላይ መያያዝ ይችላል።ይህ ቴክኖሎጂ በሕዝብ ላይ የተመሰረተ የዘረመል ካርታ በሌለበት ሁኔታ የክሮሞሶም-ደረጃ ጂኖም ስብሰባን ያበረታታል።እያንዳንዱ ነጠላ ጂኖም ሃይ-ሲ ያስፈልገዋል።
መድረክ: ኢሉሚና NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
የዝግመተ ለውጥ ጀነቲክስ
የዝግመተ ለውጥ ጀነቲክስ SNPs፣ InDels፣ SVs እና CNVsን ጨምሮ በጄኔቲክ ልዩነቶች ላይ ተመስርተው በተሰጡ ቁሳቁሶች የዝግመተ ለውጥ መረጃ ላይ አጠቃላይ ትርጓሜ ለመስጠት የተነደፈ የታሸገ ተከታታይ አገልግሎት ነው።የዝግመተ ለውጥ ለውጦችን እና የህዝቦችን ጄኔቲክ ገፅታዎች ማለትም እንደ የህዝብ ብዛት አወቃቀር፣ የዘረመል ልዩነት፣ የሥርዓተ-ፆታ ግንኙነት እና የመሳሰሉትን ለመግለጽ የሚያስፈልጉትን ሁሉንም መሠረታዊ ትንታኔዎች ያቀርባል።
-
ንፅፅር ጂኖሚክስ
ንጽጽር ጂኖም ማለት በጥሬው የተለያዩ ዝርያዎችን ሙሉ የጂኖም ቅደም ተከተሎችን እና አወቃቀሮችን ማወዳደር ማለት ነው።ይህ ተግሣጽ ዓላማው የዝርያ ዝግመተ ለውጥን፣ የጂን ተግባርን፣ የጂን መቆጣጠሪያ ዘዴን በጂኖም ደረጃ በመለየት የተጠበቁ ወይም የሚለያዩትን ቅደም ተከተሎች አወቃቀሮችን እና አካላትን በመለየት ነው።የተለመደው የንጽጽር ጂኖሚክስ ጥናት በጂን ቤተሰብ፣ በዝግመተ ለውጥ እድገት፣ በጠቅላላ ጂኖም ማባዛት፣ የተመረጠ ግፊት፣ ወዘተ ትንታኔዎችን ያጠቃልላል።
-
የጅምላ ሴግሬጋን ትንታኔ
የጅምላ ሴግሬጋንት ትንተና (BSA) የፍኖታይፕ ተያያዥ የጄኔቲክ ማርከሮችን በፍጥነት ለመለየት ስራ ላይ የሚውል ዘዴ ነው።የቢኤስኤ ዋና የስራ ሂደት እጅግ በጣም ተቃራኒ የሆኑ ፍኖተ-ባህሪዎች ያላቸውን ሁለት ቡድኖች መምረጥ፣ የሁሉንም ግለሰቦች ዲኤንኤ በማዋሃድ ሁለት ግዙፍ ዲኤንኤ እንዲፈጠር ያደርጋል፣ ይህም በሁለት ገንዳዎች መካከል ያለውን ልዩነት ቅደም ተከተል ያሳያል።ይህ ዘዴ በእጽዋት/በእንስሳት ጂኖም ውስጥ በታለሙ ጂኖች በጥብቅ የተቆራኙትን የዘረመል ምልክቶችን ለመለየት በሰፊው ጥቅም ላይ ውሏል።
