በሃይ-ሲ ላይ የተመሠረተ የክሮማቲን መስተጋብር
የአገልግሎት ባህሪያት
● በኢሉሚና ኖቫሴክ ላይ በPE150 ቅደም ተከተል ማድረግ።
● አገልግሎት ከተወጡት የኒውክሊክ አሲዶች ይልቅ የቲሹ ናሙናዎች ከፎርማልዴይድ ጋር እንዲገናኙ እና የዲኤንኤ-ፕሮቲን መስተጋብርን እንዲጠብቁ ይጠይቃል።
● የHi-C ሙከራው የሚጣበቁትን ጫፎች በባዮቲን መገደብ እና የመጨረሻ ጥገናን ያካትታል፣ ከዚያም መስተጋብሮቹን በመጠበቅ የተገኙትን ጥርት ያሉ ጫፎች ክብ ቅርጽ መስጠትን ያካትታል። ከዚያም ዲ ኤን ኤው በስትሬፕታቪዲን ዶቃዎች ወደ ታች ይጎተታል እና ለቀጣይ የቤተ-መጻሕፍት ዝግጅት ይጸዳል።
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ምርጥ የገደብ ኢንዛይም ዲዛይንእስከ 93% የሚደርሱ ትክክለኛ የመስተጋብራዊ ጥንዶች ባላቸው የተለያዩ ዝርያዎች ላይ ከፍተኛ የHi-C ቅልጥፍናን ለማረጋገጥ።
●ሰፊ የኤክስፐርት እና የህትመት መዝገቦች፡ቢኤምኬጂን ከ800 የተለያዩ ዝርያዎች እና ከተለያዩ የፈጠራ ባለቤትነት መብቶች የተውጣጡ ከ2000 በላይ የHi-C ቅደም ተከተል ፕሮጀክቶችን በማካሄድ ሰፊ ልምድ አለው። ከ900 በላይ የመጠራቀም ተጽዕኖ ፋክተር ያላቸው ከ100 በላይ የታተሙ ጉዳዮች።
●ከፍተኛ ችሎታ ያለው የባዮኢንፎርማቲክስ ቡድን፡ለHi-C ሙከራዎች እና የውሂብ ትንተና ውስጣዊ የፈጠራ ባለቤትነት እና የሶፍትዌር የቅጂ መብት እና በራስ-ሰር የዳበረ የምስል መረጃ ሶፍትዌር።
●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ፡ቁርጠኝነታችን ከፕሮጀክቱ መጠናቀቅ ባሻገር ከሽያጭ በኋላ ለ3 ወራት የሚቆይ የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ፣ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመመለስ የፕሮጀክት ክትትል፣ የመላ ፍለጋ እርዳታ እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
●አጠቃላይ ማብራሪያ፦ የተለያዩ የውሂብ ጎታዎችን በመጠቀም የተለዩ ልዩነቶች ያላቸውን ጂኖች በተግባራዊነት ለማብራራት እና ተዛማጅ የማበልጸጊያ ትንተና ለማከናወን፣ በተለያዩ የምርምር ፕሮጀክቶች ላይ ግንዛቤዎችን እናቀርባለን።
የአገልግሎት ዝርዝር መግለጫዎች
| ቤተ መጻሕፍት | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የሚመከር የውሂብ ውፅዓት | የከፍተኛ-ሲ ሲግናል ጥራት |
| የሃይ-ሲ ቤተ መጻሕፍት | ኢሉሚና PE150 | የክሮማቲን ዑደት: 150x ታድ: 50x | የክሮማቲን ሉፕ፡ 10 ኪባ TAD: 40 ኪባ |
የአገልግሎት መስፈርቶች
| የናሙና አይነት | የሚፈለገው መጠን |
| የእንስሳት ሕብረ ሕዋስ | ≥2 ግ |
| ሙሉ ደም | ≥2 ሚሊ ሊትር |
| ፈንገሶች | ≥1 ግ |
| የእፅዋት-ወጣት ቲሹ | 1ግ/አሊኮፕት፣ 2-4 አሊኮፕት ይመከራል |
| የተለማመዱ ሴሎች | ≥1x107 |
የሚከተለውን ትንታኔ ያካትታል፡
● ጥሬ ውሂብ QC፤
● የካርታ ስራ እና የHi-C ቤተ-መጽሐፍት QC፡ ትክክለኛ የመስተጋብራዊ ጥንዶች እና የመስተጋብራዊ መበላሸት ኤክስፖነንቶች (IDEs)፤
● ጂኖም-አቀፍ መስተጋብር መገለጫ፡ የሲስ/ትራንስ ትንተና እና የሃይ-ሲ መስተጋብር ካርታ፤
● የኤ/ቢ ክፍል ስርጭት ትንተና፤
● የ TADs እና የክሮማቲን ሉፖችን መለየት፤
● በናሙናዎች እና በተዛማጅ ጂኖች መካከል ባሉ የ3-ልኬት ክሮማቲን መዋቅር ክፍሎች ላይ የሚደረግ ልዩነት ትንተና።
የሲስ እና የትራንስ ፐርሰንት ስርጭት
በናሙናዎች መካከል የክሮሞሶም መስተጋብሮች የሙቀት ካርታ
የኤ/ቢ ክፍሎች ጂኖም-አቀፍ ስርጭት
የክሮማቲን ሉፖች ጂኖም-አቀፍ ስርጭት
የ TADዎችን ምስላዊነት
በBMKGene's Hi-C sequencing አገልግሎቶች የተመቻቹ የምርምር እድገቶችን በተዘጋጁ የህትመቶች ስብስብ ያስሱ።
ሜንግ፣ ቲ. እና ሌሎች (2021) 'ንጽጽራዊ የተቀናጀ ባለብዙ-ኦሚክስ ትንተና CA2ን ለኮርዶማ አዲስ ኢላማ አድርጎ ይለያል'፣የነርቭ-ኦንኮሎጂ, 23 (10), ገጽ. 1709-1722. doi: 10.1093 / NEUONC / NOAB156.
ሹ፣ ኤል. እና ሌሎች (2021) 'የጂኖም 3D መበላሸት እና እንደገና ማዋቀር በተቀናጀ የሂ-ሲ፣ ናኖፖሬ እና አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል አማካኝነት የNAFLD በሽታ አምጪ ተህዋሲያን ግንዛቤዎችን ይሰጣል'፣አክታ ፋርማሴውቲካ ሲኒካ ቢ, 11 (10), ገጽ. 3150-3164. doi: 10.1016 / J.APSB.2021.03.022.
