ሃይ-ሲ የተመሠረተ ጂኖም ስብሰባ
Hi-C የክሮሞሶም ውቅረትን ለመያዝ የተነደፈ ዘዴ ነው ፕሮቢንግ በቅርበት ላይ የተመሰረቱ መስተጋብሮችን እና ከፍተኛ-ተከታታይ ቅደም ተከተልን በማጣመር። የእነዚህ ግንኙነቶች ጥንካሬ በክሮሞሶም ላይ ካለው አካላዊ ርቀት ጋር አሉታዊ በሆነ መልኩ የተዛመደ ነው ተብሎ ይታመናል. ስለዚህ የHi-C ዳታ የተገጣጠሙ ቅደም ተከተሎችን በረቂቅ ጂኖም ውስጥ ለመሰብሰብ፣ ለማዘዝ እና አቅጣጫ ለማስያዝ እና እነዚያን በተወሰኑ የክሮሞሶምች ብዛት ላይ ለማያያዝ ይጠቅማል። ይህ ቴክኖሎጂ በሕዝብ ላይ የተመሰረተ የዘረመል ካርታ በማይኖርበት ጊዜ የክሮሞሶም-ደረጃ ጂኖም ስብሰባን ያበረታታል። እያንዳንዱ ነጠላ ጂኖም ሃይ-ሲ ያስፈልገዋል።
የአገልግሎት ባህሪዎች
● በኢሉሚና ኖቫሴክ ላይ በPE150 ቅደም ተከተል ማስያዝ።
● አገልግሎት ከፎርማለዳይድ ጋር ለመገናኘት እና የዲኤንኤ እና ፕሮቲን መስተጋብርን ለመጠበቅ ከተመረቱ ኑክሊክ አሲዶች ይልቅ የቲሹ ናሙናዎችን ይፈልጋል።
● የ Hi-C ሙከራ የሚጣበቁትን ጫፎች በባዮቲን መገደብ እና መጨረሻ መጠገንን ያካትታል፣ በመቀጠልም ግንኙነቶቹን በመጠበቅ የተፈጠሩትን ጠፍጣፋ ጫፎች ክብ ማድረግ። ከዚያም ዲ ኤን ኤው በ streptavidin ዶቃዎች ይጎትታል እና ለቀጣይ የቤተመፃህፍት ዝግጅት ይጸዳል።
የአገልግሎት ጥቅሞች
የ Hi-C አጠቃላይ እይታ
(ላይበርማን-አይደን ኢ እና ሌሎች፣ሳይንስ, 2009)
●የጄኔቲክ የህዝብ መረጃን አስፈላጊነት ማስወገድ፡-Hi-C መልህቅን ለመቀጠል የሚያስፈልገውን አስፈላጊ መረጃ ይተካል።
●ከፍተኛ የጠቋሚ ጥግግት;ከ 90% በላይ ወደ ከፍተኛ ኮንቲግ መልህቅ ሬሾ ይመራል.
●ሰፊ ልምድ እና የህትመት መዝገቦች፡-BMKGene ከ 1000 የተለያዩ ዝርያዎች እና የተለያዩ የፈጠራ ባለቤትነት ከ 2000 በላይ የ Hi-C Genome Assembly ጉዳዮች ጋር ሰፊ ልምድ አለው። ከ200 በላይ የታተሙ ጉዳዮች ከ2000 በላይ የሆነ የተጠራቀመ ተፅዕኖ አላቸው።
●ከፍተኛ ችሎታ ያለው የባዮኢንፎርማቲክስ ቡድን፡-በቤት ውስጥ የፈጠራ ባለቤትነት እና የሶፍትዌር የቅጂ መብቶች ለ Hi-C ሙከራዎች እና የውሂብ ትንተና በራሱ የዳበረ ምስላዊ መረጃ ሶፍትዌር በእጅ ማንቀሳቀስን፣ መቀልበስን፣ መሻርን እና መድገምን ያስችላል።
●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ;የእኛ ቁርጠኝነት ከፕሮጀክት መጠናቀቅ ባለፈ ከሽያጭ በኋላ ባለው የ3 ወር የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመፍታት የፕሮጀክት ክትትልን፣ መላ ፍለጋን እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
●አጠቃላይ ማብራሪያ: በርካታ የምርምር ፕሮጀክቶች ላይ ግንዛቤዎችን በመስጠት ጂኖቹን በተግባራዊ ሁኔታ ከተለዩ ልዩነቶች ጋር ለማብራራት እና ተዛማጅ የማበልጸጊያ ትንታኔዎችን ለማድረግ ብዙ የውሂብ ጎታዎችን እንጠቀማለን።
የአገልግሎት ዝርዝሮች
| የቤተ መፃህፍት ዝግጅት | የቅደም ተከተል ስልት | የሚመከር የውሂብ ውፅዓት | የጥራት ቁጥጥር |
| ሃይ-ሲ ቤተ-መጽሐፍት | ኢሉሚና NovaSeq PE150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
ናሙና መስፈርቶች
| ቲሹ | የሚፈለገው መጠን |
| የእንስሳት Viscera | ≥ 2 ግ |
| የእንስሳት ጡንቻ | |
| የአጥቢ እንስሳት ደም | ≥ 2 ሚሊ ሊትር |
| የዶሮ እርባታ / የአሳ ደም | |
| ተክል - ትኩስ ቅጠል | ≥ 3 ግ |
| ያደጉ ሕዋሳት | ≥ 1x107 |
| ነፍሳት | ≥ 2 ግ |
የአገልግሎት ሥራ ፍሰት
የሙከራ ንድፍ
ናሙና መላኪያ
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች
1) ጥሬ መረጃ QC
2) Hi-C ላይብረሪ QC፡ ትክክለኛ የ Hi-C መስተጋብሮች ግምት
3) ሃይ-ሲ ስብሰባ፡- የኮንጊግ ስብስቦችን በቡድን ማሰባሰብ፣ በመቀጠልም በእያንዳንዱ ቡድን ውስጥ ማዘዝ እና የቀጣይ አቅጣጫን መመደብ።
4) የ Hi-C ግምገማ
ሃይ-ሲ ቤተ-መጽሐፍት QC - የ Hi-C ትክክለኛ የግንኙነቶች ጥንዶች ግምት
ሃይ-ሲ ስብሰባ - ስታቲስቲክስ
የድህረ-ስብሰባ ግምገማ - በባንኮች መካከል ያለው የምልክት ጥንካሬ የሙቀት ካርታ
በBMKGene Hi-C የመገጣጠሚያ አገልግሎቶች የተመቻቹ እድገቶችን በተዘጋጁ የሕትመቶች ስብስብ ያስሱ።
ቲያን, ቲ. እና ሌሎች. (2023) 'ጂኖም መሰብሰብ እና ታዋቂ የሆነ ድርቅን የሚቋቋም የበቆሎ ጀርም ዘረመል'፣ Nature Genetics 2023 55:3, 55(3)፣ ገጽ. 496–506። doi: 10.1038 / s41588-023-01297-y.
Wang, ZL እና ሌሎች. (2020) 'የእስያ ሃኒቢ አፒስ cerana ጂኖም የክሮሞዞም-ሚዛን ስብሰባ'፣ በጄኔቲክስ ውስጥ ድንበር፣ 11፣ ገጽ. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
ዣንግ, ኤፍ. እና ሌሎች. (2023) 'በሶላናሴ ቤተሰብ ውስጥ ያሉትን ሁለት ጂኖም በመተንተን የትሮፔን አልካሎይድ ባዮሲንተሲስን እድገት መግለጥ'፣ Nature Communications 2023 14፡1፣ 14(1)፣ ገጽ 1–18። doi: 10.1038 / s41467-023-37133-4.
Zhang, X. እና ሌሎች. (2020) 'የባንያን ዛፍ ጂኖም እና የአበባ ዘር ተርብ ስለ የበለስ-ተርብ Coevolution ግንዛቤን ይሰጣሉ'፣ ሕዋስ፣ 183(4)፣ ገጽ. 875-889.e17. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
