● ሁለት የኤክሶም ፓነሎች በዒላማ ማበልጸጊያ ላይ የተመሰረቱ እና በምርመራዎች ይገኛሉ፡ SureSelect Human All Exon v6 (Agilent) እና xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)።
- በSureSelect Human All Exon V6 ፓነል ላይ በመመስረት፣ የUTR ክልሎች እና ሙሉ-ርዝመት mtDNA ከዒላማው የመቅረጫ ክልል ጋር ተጨምረዋል።
- በUMI የነቃ የቤተ መፃህፍት ግንባታ ከSureSelect Human All Exon V6 ፓነል ጋር ይገኛል።
● በኢሉሚና ኖቫሴክ ላይ ቅደም ተከተል ማድረግ።
● ወደ በሽታ ትንተና ወይም ወደ ዕጢ ትንተና የሚያመራ ባዮኢንፎርማቲክ ቧንቧ።
●የፕሮቲን ኮድ ክልልን ኢላማ ያደርጋልየፕሮቲን ኮድ ክልሎችን በመያዝ እና በመከተል፣ hWES ከፕሮቲን አወቃቀር ጋር የተያያዙ ልዩነቶችን ለማሳየት ጥቅም ላይ ይውላል።
●ወጪ ቆጣቢ፦hWES ከሰው ልጅ በሽታ ጋር የተያያዙ ሚውቴሽኖችን በግምት 85% የሚሆነውን ከሰው ልጅ ጂኖም 1% ያመነጫል።
●ከፍተኛ ትክክለኛነት፦ ከፍተኛ የቅደም ተከተል ጥልቀት ስላለው፣ hWES ከ1% በታች የሆኑ ድግግሞሽ ያላቸውን የተለመዱ ተለዋዋጮችን እና ብርቅዬ ተለዋዋጮችን ለመለየት ያመቻቻል።
●ጥብቅ የጥራት ቁጥጥር፦ ከናሙና እና ከቤተ-መጽሐፍት ዝግጅት ጀምሮ እስከ ቅደም ተከተል እና ባዮኢንፎርማቲክስ ድረስ በሁሉም ደረጃዎች አምስት ዋና የቁጥጥር ነጥቦችን ተግባራዊ እናደርጋለን። ይህ ጥንቃቄ የተሞላበት ክትትል በተከታታይ ከፍተኛ ጥራት ያላቸውን ውጤቶች ማድረስን ያረጋግጣል።
●አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክስ ትንተናየኛ የቧንቧ መስመር ከማጣቀሻ ጂኖም ልዩነቶችን ከመለየት ባለፈ፣ በተለይም ከበሽታዎች ወይም ከቲሞር ትንተና ጋር የተያያዙ የምርምር ጥያቄዎችን ለመፍታት የተነደፈ የላቀ ትንታኔን ያካትታል።
●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ፡ቁርጠኝነታችን ከፕሮጀክቱ መጠናቀቅ ባሻገር ከሽያጭ በኋላ ለ3 ወራት የሚቆይ የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ፣ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመመለስ የፕሮጀክት ክትትል፣ የመላ ፍለጋ እርዳታ እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
| የኤኮን ቀረጻ ስትራቴጂ | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የሚመከር የውሂብ ውፅዓት |
| Agilent SureSelectXT Human All Exon V6 + UTR + mtDNA Agilent SureSelectXT Human All Exon V6 + UTR + mtDNA (ከ UMI ጋር) IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | ኢሉሚና ኖቫሴክ PE150 | 5 -10 ጊቢ ለሜንዴሊያን ዲስኦርደር/ብርቅዬ በሽታዎች፡ > 50x ለዕጢ ናሙናዎች፡ ≥ 100x |
| የናሙና አይነት | መጠን(ኩቢት®) | ማጎሪያ | መጠን | የአጋሮዝ ጄል |
| WES-FF | ≥ 150 ንግ | ≥ 15 ng/µL |
≥ 15 µL | ምንም ወይም የተወሰነ ብክለት እና መበላሸት የለም (ዋናው ባንድ ግልጽ ነው)። የኤፍኤፍፒኢ ዲኤንኤ፡ ዋናው ባንድ ግልጽ ካልሆነ፣ ከ 2 ኪ.ባ በላይ የሆነ የተለየ ስሚር ያስፈልጋል። |
| WES-FFPE | ≥ 200 ንግ | ≥ 15 ng/µL |
የ hWES-በሽታ ናሙናዎች ባዮኢንፎርማቲክ ትንተና የሚከተሉትን ያካትታል፡
● የቅደም ተከተል ውሂብ QC
● የማጣቀሻ ጂኖም አሰላለፍ
● የSNPs እና InDels መለየት
● የSNPs እና InDels ተግባራዊ ማብራሪያ
የቲሞር ናሙናዎች ባዮኢንፎርማቲክ ትንተና የሚከተሉትን ያጠቃልላል
● የቅደም ተከተል ውሂብ QC
● የማጣቀሻ ጂኖም አሰላለፍ
● የSNPs፣ InDels እና የሶማቲክ ልዩነቶችን መለየት
● የጀርምላይን ልዩነቶችን መለየት
● የሚውቴሽን ፊርማዎች ትንተና
● በተግባር ሚውቴሽን ላይ የተመሰረቱ የድራይቭ ጂኖችን መለየት
● የመድኃኒቱ ተጋላጭነት ደረጃ ላይ የሚውቴሽን ማብራሪያ
● የልዩነት ትንተና - የንፅህና እና የፕሎይድ ስሌት
የውሂብ QC - የExome ቀረጻ ስታቲስቲክስ
የተለዋጭ መለያ - InDels
የላቀ ትንተና፡- ጎጂ የሆኑ SNPs/InDels - Circos ሴራ መለየት እና ማሰራጨት
የቲሞር ትንተና፡ የሶማቲክ ሚውቴሽን መለየት እና ስርጭት - የሰርኮስ ሴራ
የቲሞር ትንተና፡ የክሎናል ዝርያዎች