-
ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል (NGS)
Metagenome የሚያመለክተው እንደ አካባቢ ሜታጂኖም፣ የሰው ሜታጂኖም፣ ወዘተ ያሉ የተዋሃዱ የኦርጋኒክ ማህበረሰብ አጠቃላይ የዘረመል ቁስ ስብስብ ነው።ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል ከአካባቢያዊ ናሙናዎች የተውጣጡ ድብልቅ ጂኖሚክ ቁሳቁሶችን ለመተንተን የሚያገለግል ሞለኪውላዊ መሳሪያ ነው ፣ ይህም ስለ ዝርያ ልዩነት እና ብዛት ፣ የስነ ሕዝብ አወቃቀር ፣ የፍየልጄኔቲክ ግንኙነት ፣ የተግባር ጂኖች እና ከአካባቢያዊ ሁኔታዎች ጋር ያለውን ትስስር ዝርዝር መረጃ ይሰጣል።
መድረክ፡ኢሉሚና NovaSeq6000
-
ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል-ናኖፖር
Metagenomics ከአካባቢያዊ ናሙናዎች የተውጣጡ ድብልቅ ጂኖሚክ ቁሳቁሶችን ለመተንተን የሚያገለግል ሞለኪውላዊ መሳሪያ ሲሆን ስለ ዝርያዎች ልዩነት እና ብዛት ፣የሕዝብ አወቃቀር ፣የሥነ-ሥርዓት ግንኙነት ፣ የተግባር ጂኖች እና የአካባቢ ሁኔታዎች ትስስር ወዘተ. ወደ metagenomic ጥናቶች.በንባብ ርዝማኔ ያለው አስደናቂ አፈጻጸሙ ወደ ታች ዥረት ሜታጂኖሚክ ትንተና በተለይም የሜታጂኖም ስብሰባን ከፍ አድርጓል።የንባብ-ርዝመት ጥቅሞችን በመውሰድ በናኖፖሬ ላይ የተመሰረተ የሜታጂኖሚክ ጥናት ከተኩስ-ሽጉ ሜታጂኖሚክስ ጋር በማነፃፀር ቀጣይነት ያለው ስብሰባን ማሳካት ይችላል።በናኖፖሬ ላይ የተመሰረቱ ሜታጂኖሚክስ ሙሉ እና የተዘጉ የባክቴሪያ ጂኖም ከማይክሮባዮሞች (Moss, EL, et. alተፈጥሮ ባዮቴክ, 2020)
መድረክ፡ናኖፖሬ ፕሮሜትሽን P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
በ16S እና 18S አር ኤን ኤ ላይ ያለው ንዑስ ክፍል ሁለቱንም በጣም የተጠበቁ እና ከፍተኛ ተለዋዋጭ ክልሎችን የያዘ ለፕሮካርዮቲክ እና ኢውካርዮቲክ ፍጥረታት መለያ ፍጹም የሞለኪውላር አሻራ ነው።በቅደም ተከተል በመጠቀም እነዚህ አምፖሎች በተጠበቁ ክፍሎች ላይ ተመስርተው ሊነጣጠሩ ይችላሉ እና ከፍተኛ ተለዋዋጭ ክልሎች በጥቃቅን ተህዋሲያን መለየት ሙሉ ለሙሉ ተለይተው የሚታወቁት ጥቃቅን ብዝሃነት ትንተና, ታክሶኖሚ, ፋይሎሎጂ, ወዘተ. ነጠላ ሞለኪውል የእውነተኛ ጊዜ (SMRT) የPacBio መድረክ ቅደም ተከተል ከፍተኛ ትክክለኛ ረጅም ንባቦችን ለማግኘት ያስችላል፣ ይህም ሙሉ ርዝመት ያላቸውን አምፖሎች (በግምት 1.5 ኪባ) ሊሸፍን ይችላል።የጄኔቲክ መስክ ሰፊ እይታ በባክቴሪያ ወይም በፈንገስ ማህበረሰብ ውስጥ የዝርያ ማብራሪያዎችን መፍታት በእጅጉ አሻሽሏል።
መድረክ፡PacBio ተከታይ II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing ዓላማው ከፍተኛ ውይይቶችን እና ተለዋዋጭ ክፍሎችን የያዙ PCR የቤት አያያዝ የጄኔቲክ ማርከር ምርቶችን በመመርመር በጥቃቅን ማህበረሰብ ውስጥ የዝርያ ፣የታክሶኖሚ እና የዝርያ ብዛትን ለማሳየት ነው።የእነዚህ ፍፁም የሞለኪውላር የጣት አሻራ በ Woeses et al፣(1977) ማስተዋወቅ ከመገለል የፀዳ የማይክሮባዮም መገለጫን ያበረታታል።የ16S (ባክቴሪያዎች)፣ 18S (ፈንጋይ) እና Internal transcribed spacer(ITS፣ fungi) በቅደም ተከተል ማስቀመጥ ሁለቱንም በብዛት የሚገኙ ዝርያዎችን እንዲሁም ብርቅዬ እና የማይታወቁ ዝርያዎችን መለየት ያስችላል።ይህ ቴክኖሎጂ በተለያዩ አከባቢዎች ማለትም በሰው አፍ፣ አንጀት፣ ሰገራ፣ ወዘተ ያሉ ልዩ ልዩ ጥቃቅን ተህዋሲያን ስብጥርን በመለየት በስፋት የሚሰራ እና ዋና መሳሪያ እየሆነ መጥቷል።
መድረክ፡ኢሉሚና NovaSeq6000
-
የባክቴሪያ እና የፈንገስ ሙሉ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል
የባክቴሪያ እና የፈንገስ አጠቃላይ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል የታወቁትን ባክቴሪያዎች እና ፈንገሶች ጂኖም ለማጠናቀቅ እንዲሁም በርካታ ጂኖምዎችን ለማነፃፀር ወይም የአዳዲስ ፍጥረታትን ጂኖም ለመቅረጽ ወሳኝ መሳሪያ ነው።ትክክለኛ የማጣቀሻ ጂኖም ለማመንጨት, ማይክሮባዮሎጂን ለመለየት እና ሌሎች የንጽጽር ጂኖም ጥናቶችን ለማካሄድ ሙሉውን የባክቴሪያ እና የፈንገስ ጂኖም በቅደም ተከተል ማስቀመጥ በጣም አስፈላጊ ነው.
መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
-
የፈንገስ ጂኖም
ባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች በልዩ የምርምር ግብ ላይ በመመስረት የጂኖም ዳሰሳ፣ ጥሩ ጂኖም እና የፔን-ሙሉ የፈንገስ ጂኖም ይሰጣሉ።የጂኖም ቅደም ተከተል ፣ ስብሰባ እና የተግባር ማብራሪያ የሚቀጥለው ትውልድ ቅደም ተከተል + የሶስተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል በማጣመር ከፍተኛ ደረጃ የጂኖም ስብሰባ ማግኘት ይቻላል ።ጂኖም በክሮሞሶም ደረጃ ለመገጣጠም የ Hi-C ቴክኖሎጂም መጠቀም ይቻላል።
መድረክ፡PacBio ተከታይ II
ናኖፖሬ ፕሮሜትሽን P48
ኢሉሚና ኖቫሴክ 6000
-
የባክቴሪያ ሙሉ ጂኖም
ባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች የተሟላ የባክቴሪያ ጂኖም ከዜሮ ክፍተት ጋር በመገንባት ላይ ያለውን የቅደም ተከተል አገልግሎት ይሰጣል።የባክቴሪያ ዋና የስራ ሂደት የተሟላ ጂኖም ግንባታ የሶስተኛ ትውልድ ቅደም ተከተል ፣ ስብሰባ ፣ ተግባራዊ ማብራሪያ እና የተወሰኑ የምርምር ግቦችን የሚያሟላ የላቀ ባዮኢንፎርማቲክ ትንታኔን ያጠቃልላል።የባክቴሪያ ጂኖም የበለጠ አጠቃላይ መገለጫ ባዮሎጂያዊ ሂደቶቻቸውን የሚመለከቱ መሠረታዊ ዘዴዎችን ለማሳየት ኃይል ይሰጣል ፣ ይህም በከፍተኛ የዩኩሪዮቲክ ዝርያዎች ውስጥ ለሚደረጉ የጂኖም ጥናቶች ጠቃሚ ማጣቀሻዎችን ይሰጣል ።
መድረክ፡ናኖፖሬ ፕሮሜሽን ፒ 48 + ኢሉሚና ኖቫ ሴክ 6000
PacBio ተከታይ II
