ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል-ናኖፖር
የአገልግሎት ጥቅሞች
● ከፍተኛ ጥራት ያለው ስብሰባ-የዝርያዎችን መለየት እና ተግባራዊ የጂን ትንበያ ትክክለኛነትን ማሳደግ
● ተዘግቷል የባክቴሪያ ጂኖም ማግለል
● የበለጠ ኃይለኛ እና አስተማማኝ መተግበሪያ በተለያዩ አካባቢዎች ለምሳሌ በሽታ አምጪ ተህዋሲያን ወይም አንቲባዮቲክ የመቋቋም ተዛማጅ ጂኖች መለየት
● የንጽጽር ሜታጂኖም ትንተና
የአገልግሎት ዝርዝሮች
| መድረክ | ቅደም ተከተል | የሚመከር ውሂብ | የመመለሻ ጊዜ |
| ናኖፖሬ | ONT | 6 ግ/10 ግ | 65 የስራ ቀናት |
ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔዎች
● የጥሬ መረጃ ጥራት ቁጥጥር
● Metagenome ስብሰባ
● የማይታደስ የጂን ስብስብ እና ማብራሪያ
● የዝርያ ልዩነት ትንተና
● የጄኔቲክ ተግባር ልዩነት ትንተና
● የቡድን ትንተና
● በሙከራ ሁኔታዎች ላይ የማህበሩ ትንተና
ናሙና መስፈርቶች እና ማድረስ
ናሙና መስፈርቶች እና መላኪያ
የናሙና መስፈርቶች፡
ለየዲኤንኤ ውህዶች:
| የናሙና ዓይነት | መጠን | ትኩረት መስጠት | ንጽህና |
| የዲኤንኤ ውህዶች | 1-1.5 ሚ.ግ | ： 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
ለአካባቢያዊ ናሙናዎች፡-
| የናሙና ዓይነት | የሚመከር የናሙና አሰራር |
| አፈር | የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;የተረፈውን የደረቀ ንጥረ ነገር ከምድር ላይ ማስወገድ ያስፈልጋል;ትላልቅ ቁርጥራጮችን መፍጨት እና በ 2 ሚሜ ማጣሪያ ውስጥ ማለፍ;የ Aliquot ናሙናዎች በማይጸዳ EP-tube ወይም cyrotube ውስጥ ለማስያዝ። |
| ሰገራ | የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;ለቦታ ማስያዝ በማይጸዳ EP-tube ወይም cryotube ውስጥ ናሙናዎችን ይሰብስቡ እና ይልቀቁ። |
| የአንጀት ይዘት | ናሙናዎች በ aseptic ሁኔታ ውስጥ መደረግ አለባቸው.የተሰበሰበውን ቲሹ በፒቢኤስ ያጠቡ;ፒቢኤስን ሴንትሪፉግ ያድርጉ እና በ EP-tubes ውስጥ ያለውን ተንሳፋፊ ይሰብስቡ። |
| ዝቃጭ | የናሙና መጠን: በግምት.5 ግ;ለቦታ ማስያዝ በማይጸዳ EP-tube ወይም cryotube ውስጥ ዝቃጭ ናሙና ይሰብስቡ እና ይላኩ። |
| የውሃ አካል | እንደ የቧንቧ ውሃ፣ የጉድጓድ ውሃ፣ ወዘተ የመሳሰሉ ውስን መጠን ያለው ረቂቅ ተሕዋስያን ላለው ናሙና ቢያንስ 1 ሊትር ውሃ ይሰብስቡ እና በ 0.22 μm ማጣሪያ ውስጥ በማለፍ በገለባው ላይ ረቂቅ ተሕዋስያንን ለማበልጸግ።ሽፋኑን በማይጸዳ ቱቦ ውስጥ ያከማቹ። |
| ቆዳ | የቆዳውን ገጽታ በማይጸዳ ጥጥ ወይም በቀዶ ጥገና ምላጭ በጥንቃቄ ይከርክሙት እና በማይጸዳ ቱቦ ውስጥ ያስቀምጡት። |
የሚመከር ናሙና ማድረስ
ናሙናዎቹን በፈሳሽ ናይትሮጅን ውስጥ ለ 3-4 ሰአታት ያቀዘቅዙ እና በፈሳሽ ናይትሮጅን ወይም -80 ዲግሪ ለረጅም ጊዜ በተያዘ ቦታ ውስጥ ያከማቹ።ከደረቅ በረዶ ጋር ናሙና መላክ ያስፈልጋል.
የአገልግሎት ሥራ ፍሰት
ናሙና መላኪያ
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች
1.የሙቀት ካርታ፡የዝርያ ሀብት ስብስብ
2.Functional ጂኖች ለ KEGG ተፈጭቶ መንገዶች የተገለጹ
3.Species ትስስር አውታረ መረብ
CARD አንቲባዮቲክ የመቋቋም ጂኖች 4.Circos
BMK መያዣ
ናኖፖሬ ሜታጂኖሚክስ በባክቴሪያ የታችኛው የመተንፈሻ አካላት ኢንፌክሽን ፈጣን ክሊኒካዊ ምርመራን ያስችላል
የታተመተፈጥሮ ባዮቴክኖሎጂ፣ 2019
ቴክኒካዊ ድምቀቶች
ቅደም ተከተል: ናኖፖሬ ሚኒዮን
ክሊኒካል ሜታጂኖሚክስ ባዮኢንፎርማቲክስ፡ አስተናጋጅ ዲኤንኤ መሟጠጥ፣ WIMP እና ARMA ትንታኔ
ፈጣን ማወቂያ: 6 ሰዓቶች
ከፍተኛ ስሜታዊነት: 96.6%
ቁልፍ ውጤቶች
እ.ኤ.አ. በ 2006 ዝቅተኛ የመተንፈሻ አካላት ኢንፌክሽን (LR) በዓለም አቀፍ ደረጃ 3 ሚሊዮን ሰዎችን ሞት አስከትሏል ።የ LR1 በሽታ አምጪ ተህዋስያንን ለመለየት የተለመደው ዘዴ እርባታ ነው, እሱም ደካማ ስሜታዊነት ያለው, ረጅም ጊዜ የሚቆይ እና በቅድመ አንቲባዮቲክ ሕክምና ውስጥ መመሪያ ማጣት ነው.ፈጣን እና ትክክለኛ የማይክሮባዮሎጂ ምርመራ ለረጅም ጊዜ አስቸኳይ ፍላጎት ሆኖ ቆይቷል።ዶ/ር ጀስቲን ከኢስት አንግሊያ ዩኒቨርሲቲ እና አጋሮቹ በሽታ አምጪ ተህዋስያንን ለመለየት በናኖፖሬ ላይ የተመሰረተ ሜታጂኖሚክ ዘዴን በተሳካ ሁኔታ ፈጥረዋል።እንደ የስራ ፍሰታቸው፣ 99.99% የአስተናጋጅ ዲ ኤን ኤ ሊሟጠጥ ይችላል።በሽታ አምጪ ተህዋሲያን እና አንቲባዮቲክን የሚቋቋሙ ጂኖችን መለየት በ 6 ሰዓታት ውስጥ ሊጠናቀቅ ይችላል.
ማጣቀሻ
Charalampous፣ T.፣ Kay፣ GL፣ Richardson፣ H.፣ Aydin፣ A.፣ እና O'Grady፣ J.(2019)ናኖፖሬ ሜታጂኖሚክስ በባክቴሪያ የታችኛው የመተንፈሻ አካላት ኢንፌክሽን ፈጣን ክሊኒካዊ ምርመራን ያስችላል።ተፈጥሮ ባዮቴክኖሎጂ፣ 37(7)፣ 1.
