ሰንደቅ-03

ምርቶች

ሜታጀኖሚክ ሴኩዊንሲንግ-ቲጂኤስ

图片67

ሜታጂኖም እንደ የአካባቢ እና የሰው ሜታጂኖም ያሉ የተደባለቀ የህዋሳት ማህበረሰብ የጄኔቲክ ቁሳቁስ ስብስብ ነው። ሊበቅሉ የሚችሉ እና ሊታረሱ የማይችሉ ረቂቅ ተሕዋስያን ጂኖሞችን ይዟል። ሜታጂኖም ቅደም ተከተል እነዚህን ውስብስብ የጂኖሚክ መልክዓ ምድሮች ከታክሶኖሚክ መገለጫ በላይ በማቅረብ በኢኮሎጂካል ናሙናዎች ውስጥ የተካተቱትን ለማጥናት ያስችላል። እንዲሁም የተመዘገቡ ጂኖችን እና በአካባቢ ሂደቶች ውስጥ ያላቸውን ሚና በመቃኘት ተግባራዊ የጂኖሚክስ እይታን ይሰጣል። ከኢሉሚና ቅደም ተከተል ጋር ባህላዊ የሾትጉ አቀራረቦች በሜታጂኖሚክ ጥናቶች ውስጥ በስፋት ጥቅም ላይ ሲውሉ፣ የናኖፖር እና የፓክባዮ ረጅም ንባብ ቅደም ተከተል መምጣት መስክን ቀይሮታል። የናኖፖር እና የፓክባዮ ቴክኖሎጂ የታችኛውን ባዮኢንፎርማቲክ ትንታኔዎችን በተለይም የሜታጂኖም ስብሰባን ያሻሽላሉ፣ ይህም የበለጠ ቀጣይ ስብሰባዎችን ያረጋግጣል። ሪፖርቶች እንደሚያሳዩት ናኖፖር ላይ የተመሰረቱ እና በፓክባዮ ላይ የተመሰረቱ ሜታጂኖሚክስ ከተወሳሰቡ ማይክሮባዮሞች የተሟላ እና የተዘጉ የባክቴሪያ ጂኖሞችን በተሳካ ሁኔታ አምጥተዋል (ሞስ፣ ኤል፣ እና ሌሎች፣ ኔቸር ባዮቴክ፣ 2020)። የናኖፖሬ ንባቦችን ከኢሉሚና ንባቦች ጋር ማዋሃድ የስህተት እርማት ስትራቴጂካዊ አቀራረብን ይሰጣል፣ የናኖፖሬ ውስጣዊ ዝቅተኛ ትክክለኛነትን ይቀንሳል። ይህ የተመሳሳይ ጥምረት የእያንዳንዱን የቅደም ተከተል መድረክ ጥንካሬዎች ይጠቀማል፣ ሊከሰቱ የሚችሉ ገደቦችን ለማሸነፍ እና የሜታጀኖሚክ ትንታኔዎችን ትክክለኛነት እና አስተማማኝነት ለማሳደግ ጠንካራ መፍትሄ ይሰጣል።

መድረክ፡ ናኖፖሬ ፕሮሜቲዮን 48፣ ኢሉሚያ እና ፓክባዮ ሪቪዮ


የአገልግሎት ዝርዝሮች

ባዮኢንፎርማቲክስ

የማሳያ ውጤቶች

ተለይተው የቀረቡ ህትመቶች

የአገልግሎት ባህሪያት

● በናኖፖሬ P48 (10Kb ቤተ-መጽሐፍት) ላይ ረጅም የንባብ ቅደም ተከተል፤ PacBio Revio (8Kb ቤተ-መጽሐፍት)

● የስህተት ማስተካከያ፡ በኢሉሚና ኖቫሴክ (PE150 ቤተ-መጽሐፍት) ላይ ቅደም ተከተል

የአገልግሎት ጥቅሞች

●ከፍተኛ ጥራት ያለው ሜታጂኖም ስብስብ፡ከፍተኛ ቀጣይነት ያላቸው ጥቂት ኮንቲጎች ሲኖሩ።

●ከፍተኛ ትክክለኛነት፦የዝርያዎችን መለየት እና ተግባራዊ ጂን ትንበያ።

●የተሻሻለ ስብሰባየባክቴሪያ ጂኖም ማግለል እና የንፅፅር ሜታጂኖም ትንተና ማመቻቸት።

●አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክስ ትንተና፡ትንታኔያችን ያተኮረው በታክሶኖሚክ ልዩነት ላይ ብቻ ሳይሆን በማህበረሰቡ ተግባራዊ ልዩነት ላይም ጭምር ነው።

●ሰፊ ተሞክሮቡድናችን ለእያንዳንዱ ፕሮጀክት ብዙ ልምድ ያመጣል፣ በተለያዩ የምርምር ዘርፎች በርካታ የሜታጂኖሚክስ ፕሮጀክቶችን በተሳካ ሁኔታ በመዝጋት እና ከ200,000 በላይ ናሙናዎችን በማስኬድ ረገድ ልምድ ያለው ሲሆን፣ ቡድናችን ለእያንዳንዱ ፕሮጀክት ብዙ ልምድ ያመጣል።

የአገልግሎት ዝርዝር መግለጫዎች

የቅደም ተከተል መድረክ

የቅደም ተከተል ስትራቴጂ

የሚመከር ውሂብ

ኢሉሚና ኖቫሴክ

PE150

6 ጊባ

ናኖፖሬ P48

10 ኪ.ባ.

6 / 10 Gb

ፓክባዮ ሬቪዮ

8 ኪ.ባ.

10 / 20 Gb

የናሙና መስፈርቶች

 

ማጎሪያ (ng/µL)

ጠቅላላ መጠን (µግ)

መጠን (µL)

የኢሉሚና PE150 ቤተ መጻሕፍት

≥1

≥0.03

≥20

ናኖፖሬ 10 ኪ.ባ. ላይብረሪ

≥40

≥2

≥20

የPacBio 8 ኪ.ባ. ቤተ-መጽሐፍት

≥50

10 µግ/ሴል ≥20

የአገልግሎት የስራ ፍሰት

የናሙና አቅርቦት

የናሙና አቅርቦት

የቤተ-መጻሕፍት ዝግጅት

የቤተ መፃህፍት ግንባታ

ቅደም ተከተል

ቅደም ተከተል

የውሂብ ትንተና

የውሂብ ትንተና

ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች

ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች


  • ቀዳሚ፡
  • ቀጣይ፡

  • 流程图 贝贝第三版-02

    የሚከተለውን ትንታኔ ያካትታል፡

    ● የውሂብ ቅደም ተከተል የጥራት ቁጥጥር

    ● የሜታጂኖም ስብስብ እና የጂን ትንበያ

    ● የጂን ማብራሪያ

    ● የታክሶኖሚክ አልፋ ልዩነት ትንተና

    ● የማህበረሰቡ ተግባራዊ ትንተና፡ ባዮሎጂካል ተግባር፣ ሜታቦሊክ፣ አንቲባዮቲክ መቋቋም

    ● በተግባራዊ እና በታክሶኖሚክ ልዩነት ላይ ትንተና፡

    የቤታ ልዩነት ትንተና

    በቡድን መካከል የሚደረግ ትንተና

    የትስስር ትንተና፡ በአካባቢ ሁኔታዎች እና በ OUT ቅንብር እና ልዩነት መካከል

    ያልተደጋገመ የጂን ስብስብ ስርጭት፡

    图片68 

    የጂን ማብራሪያ፡ የKEGG መንገድ

    图片69 

    የጂን ማብራሪያ፡ eggNOG

     图片70

     

    የጂን ማብራሪያ፡- CAZY ካርቦሃይድሬትስ

     图片71

    የዝርያዎች ትስስር አውታረ መረብ፡

     图片72

    በዚህ ተለይቶ በቀረበ ህትመት በBMKGene's metagenomics sequencing አገልግሎት የተመቻቹትን እድገቶች ከናኖፖሬ + ኢሉሚና ጋር ያስሱ፡

    ጂን፣ ኤች. እና ሌሎች (2023) 'በውስጣዊ ሞንጎሊያውያን የሰው አንጀት ማይክሮባዮም ከፍተኛ ጥራት ያለው የጂኖም ስብስብ'፣ ኔቸር ማይክሮባዮሎጂ 2023 8:1, 8(1), ገጽ 150–161. doi: 10.1038/s41564-022-01270-1.

    ዋጋ ያግኙ

    መልእክትዎን እዚህ ይፃፉ እና ይላኩልን

    መልእክትዎን ለእኛ ይላኩልን፦