ናኖፖር ሙሉ-ርዝመት ትራንስክሪፕቶም

የናኖፖሬ ትራንስክሪፕቶሜ ሴክዩንሲንግ ሙሉ ርዝመት ያላቸውን cDNAዎች ቅደም ተከተል ለማስያዝ፣ የትራንስክሪፕት ኢሶፎርሞችን በትክክል ለመለየት እና ለመለካት ኃይለኛ ዘዴ ነው። የBMKCloud Nanopore Full-Length Transcription Pipeline በናኖፖሬ መድረክ ላይ የሚፈጠረውን የRNA-Seq ውሂብ ከፍተኛ ጥራት ባለው በሚገባ በተብራራ የማጣቀሻ ጂኖም ላይ ለመተንተን የተነደፈ ሲሆን በጂንም ሆነ በትራንስክሪፕቱ ደረጃ ጥራት ያለው እና መጠናዊ ትንተና ይሰጣል። የጥራት ቁጥጥር ከተደረገ በኋላ፣ ሙሉ ርዝመት ያላቸው ኖን-ቺሜሪክ (FLNC) ቅደም ተከተሎች ይገኙና የጋራ ስምምነት ቅደም ተከተሎች ከማጣቀሻ ጂኖም ጋር ተያይዘዋል፣ ይህም ተደጋጋሚ ግልባጮችን ለማስወገድ ነው። ከዚህ የትራንስክሪፕት ስብስብ፣ አገላለጽ ይለካሉ እና በተለያዩ መልኩ የተገለጹ ጂኖች እና ግልባጮች ተለይተው በተግባራዊ መልኩ ተብራርተዋል። የቧንቧ መስመር አማራጭ ፖሊአዴኒሌሽን (APA) ትንተና፣ አማራጭ የስፕሊንግ ትንተና፣ ቀላል የቅደም ተከተል ድግግሞሽ (SSR) ትንተና፣ የlncRNA እና ተዛማጅ ኢላማዎችን መተንበይ፣ የኮድ ቅደም ተከተሎች ትንበያ (ሲዲኤስ)፣ የጂን ቤተሰብ ትንተና፣ የትራንስክሪፕሽን ፋክተር ትንተና፣ የአዳዲስ ጂኖች ትንበያ እና የትራንስክሪፕቶች ተግባራዊ ማብራሪያን ያካትታል።