BMKCloud Log in
ሰንደቅ-03

ዜና

ጂኖም ኢቮሉሽን

ጂኖም ደ ኖቮ
የስብሰባ|የወሲብ አወሳሰን አጠቃላይ ተከታታይ ስራዎች እና ከፊል ባዮኢንፎርማቲክ አገልግሎቶች በባዮማርከር ቴክኖሎጅስ ተሰጥተዋል።

ረቂቅ

የባህር ዳራጎን ተምሳሌት የሆነው ፍኖታይፕ እንደ ቅጠል የሚመስሉ ተጨማሪዎች፣ ጥርስ የሌለው ቱቦ አፍ እና ወንድ እርግዝና ክፍት በሆነ “የዝርያ ጥፍጥ” ላይ የተዳቀሉ እንቁላሎችን መፈልፈልን ያካትታል።እኛ ደ ኖቮ–የጋራ ሴድራጎን (ፊሊሎፕተሪክስ ታኒዮላተስ) እና በቅርብ ተዛማጅ ዝርያቸው፣ አሌጋቶር ፒፔፊሽ (Syngnathoides biculeatus) የወንድ እና የሴት ጂኖም በቅደም ተከተል አቅርበናል።ከዝግመተ ለውጥ አዲስነት፣ ቅጠሉ መሰል አባሪዎች የተገለበጡ መግለጫዎች እንደሚያሳዩት በተለምዶ በፊን ልማት ውስጥ የሚሳተፉ የጂኖች ስብስብ በአንድ ላይ እንደተመረጡ እና እንዲሁም ለቲሹ ጥገና እና የበሽታ መከላከያ ጂኖች የትራን ስክሪፕት ማበልጸግ ነው።በሁሉም syngnathids ውስጥ የጠፋው የዚብራፊሽ ሚውቴሽን ለ scpp5፣ የጎደለው ወይም የተበላሸ የፍራንነክስ ጥርስ ያለው ሆኖ ተገኝቷል።በተለመደው ሴድራጎን እና አሊጋተር ፒፔፊሽ የሚጋራ ወንድ-ተኮር የሆነ amhr2y ዘረ-መል (ሴራጎን) የሚፈጥር ወሲብ-የሚወስን ቦታ ተለይቷል። 

ቁስአካላት እና መንገዶች:

ቁሶች

Fየእኛ የጋራ የባህር ዳርጎን (P. taeniolatusእና ሁለት አዞዎች ፓይፕፊሽ (ኤስ. biculeatus) ናሙናዎች.ሁለት የተለመዱ የባህር ዳርጎን (አንድ ወንድ እና አንድ ሴት) እና ሁለት አሊጋተር ፒፔፊሽ (አንድ ወንድ እና አንድ ሴት) ግለሰቦች ለሙሉ ጂኖም ቅደም ተከተል ጥቅም ላይ ውለው ነበር, እና ሌሎች ሁለት ወንድ የጋራ የባህር ዳርቻ ግለሰቦች ለጂኖም ቅደም ተከተሎች ጥቅም ላይ ውለዋል.

የጂኖም ቅደም ተከተል ስልት

270/350 bp ላይብረሪ (Hiseq 2500) + Pacbio 20Kb (Sequel) ወይም Nanopore 30 Kb (MinION)+ Hi-C (NovaSeq 6000) .ተከታታይ እና ሌሎች ሁለት ወንድ የጋራ የባህር ዳርጎን ግለሰቦች ለጂኖም ቅደም ተከተል ጥቅም ላይ ውለዋል።

የትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል

Fወይም የጋራ የባህር ዳርጎን፣ አንጎል፣ አይን፣ ጉበት፣ ልብ፣ ኩላሊት፣ ሜሴንቴሪ፣ አንጀት፣ ጡንቻ፣ ክንፍ፣ ቆዳ፣ ቅጠል የሚመስሉ እጢዎች፣ እንቁላሎች እና እንቁላሎች ተሰብስበዋል።

የጂኖም ደ ኖቮ የመሰብሰቢያ ስልት

Canu (ማስተካከያ) + WTDBG2 (ስብሰባ) + ፒሎን (ፖላንድኛ) + ላቼሲስ (ሃይ-ሲ)።

ዋና ውጤቶች

ምስል-1.-ቁልፍ-ባህሪያት-የጋራ-የባህር-ዳርጎን-P.-taeniolatus-እና-አልጋተር-ፓይፕፊሽ-ኤስ

ምስል 1. የጋራ የባህር ዳርጎን (P. taeniolatus) እና አልጌተር ፒፔፊሽ (ኤስ. ቢያኩሌቱስ) እና የፋይሎጄኔቲክ አቀማመጦቻቸው ዋና ዋና ባህሪያት.

ምስል-2.- ሞርፎሎጂ-እና-ጄኔቲክ-ሜካፕ-ቅጠል-የሚመስሉ-አባሪዎች-በጋራ-የባህር-ዳርጎን-P

ምስል 2. በተለመደው የባህር ዳርጎን (P. taeniolatus) ውስጥ ቅጠሉ የሚመስሉ ተጨማሪዎች ሞርፎሎጂ እና ጄኔቲክ ሜካፕ.

ምስል-3.-የወሲብ-መወሰን-ጂን-በጋራ-የባህር-ዳርጎን-P.-taeniolatus-እና-አልጋተር-ፓይፕፊሽ-ኤስ.-biaculeatus

ምስል 3. በጋራ የባህር ዳርጎን (P. taeniolatus) እና በአልጋቶር ፒፔፊሽ (ኤስ. ቢያኩሌቱስ) ውስጥ የወሲብ መወሰኛ ጂን።

ምስል-4

ምስል 4. የፍራንክስ ጥርስ ፍኖታይፕስ በዜብራፊሽ scpp5 ሆሞዚጎስ ሚውቴሽን።


የልጥፍ ጊዜ: ጥር-08-2022

መልእክትህን ላክልን፡