በማጣቀሻ ላይ ያልተመሠረተ mRNA ቅደም ተከተል-NGS
ባህሪያት
● ቤተ-መጽሐፍት ከመዘጋጀቱ በፊት የፖሊ mRNA ቀረጻ
● ከማንኛውም የማጣቀሻ ጂኖም ነፃ የሆነ፡- በዴ ኖቮ የትራንስክሪፕቶች ስብስብ ላይ የተመሠረተ፣ በበርካታ የውሂብ ጎታዎች (NR፣ Swiss-Prot፣ COG፣ KOG፣ eggNOG፣ Pfam፣ GO፣ KEGG) የተገለጹ የዩኒጂኖች ዝርዝር ይፈጥራል።
● የጂን አገላለጽ እና የትራንስክሪፕት መዋቅር አጠቃላይ ባዮኢንፎርማቲክ ትንተና
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ሰፊ እውቀትቡድናችን በBMKGENE ከ600,000 በላይ ናሙናዎችን በማቀነባበር ረገድ ልምድ ያለው ሲሆን ይህም እንደ የሴል ባህሎች፣ ቲሹዎች እና የሰውነት ፈሳሾች ያሉ የተለያዩ የናሙና ዓይነቶችን ያካትታል። ቡድናችን ለእያንዳንዱ ፕሮጀክት ብዙ ልምድ ያመጣል። በተለያዩ የምርምር ዘርፎች ከ100,000 በላይ mRNA-Seq ፕሮጀክቶችን በተሳካ ሁኔታ ዘግተናል።
●ጥብቅ የጥራት ቁጥጥር፦ ከናሙና እና ከቤተ-መጽሐፍት ዝግጅት ጀምሮ እስከ ቅደም ተከተል እና ባዮኢንፎርማቲክስ ድረስ በሁሉም ደረጃዎች ዋና የቁጥጥር ነጥቦችን ተግባራዊ እናደርጋለን። ይህ ጥንቃቄ የተሞላበት ክትትል በተከታታይ ከፍተኛ ጥራት ያላቸውን ውጤቶች ማድረስን ያረጋግጣል።
● አጠቃላይ ማብራሪያ፦ የተለያዩ የተገለጹ ጂኖችን (DEGs) በተግባራዊነት ለማብራራት እና ተጓዳኝ የማበልጸጊያ ትንተና ለማድረግ በርካታ የውሂብ ጎታዎችን እንጠቀማለን፣ ይህም በትራንስክሪፕቶሜም ምላሽ ስር ስላሉት ሴሉላር እና ሞለኪውላዊ ሂደቶች ግንዛቤዎችን ይሰጣል።
●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ: ቁርጠኝነታችን ከፕሮጀክቱ መጠናቀቅ ባሻገር ከሽያጭ በኋላ ለ3 ወራት የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ፣ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመመለስ የፕሮጀክት ክትትል፣ የመላ ፍለጋ እርዳታ እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
የናሙና መስፈርቶች እና አቅርቦት
| ቤተ መጻሕፍት | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የሚመከር ውሂብ | የጥራት ቁጥጥር |
| ፖሊ ኤ የበለፀገ | ኢሉሚና PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 ጊቢ | ሩብ 30≥85% |
የናሙና መስፈርቶች፡
ኒውክሊዮታይዶች፡
| ኮንክ.(ng/μl) | መጠን (μg) | ንጽሕና | ታማኝነት |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 በጄል ላይ የተወሰነ ወይም ምንም የፕሮቲን ወይም የዲኤንኤ ብክለት አይታይም። | ለተክሎች፡ RIN≥4.0፤ ለእንስሳት፡ RIN≥4.5፤ 5.0≥28S/18S≥1.0; የተወሰነ ወይም ምንም የመነሻ ከፍታ የለም |
● ተክሎች፡
ሥር፣ ግንድ ወይም አበባ፡ 450 ሚ.ግ.
ቅጠል ወይም ዘር፡ 300 ሚ.ግ.
ፍራፍሬ፡ 1.2 ግ
● እንስሳ፦
ልብ ወይም አንጀት: 300 ሚ.ግ.
ቪሴራ ወይም አንጎል: 240 ሚ.ግ.
ጡንቻ፡ 450 ሚ.ግ.
አጥንት፣ ፀጉር ወይም ቆዳ፡ 1 ግራም
● አርትሮፖዶች፡
ነፍሳት፡ 6 ግ
ክሩስታሲያ፡ 300 ሚ.ግ.
● ሙሉ ደም: 1 ቱቦ
● ሴሎች፡ 106 ሴሎች
የሚመከር የናሙና አቅርቦት
ኮንቴይነር፡ 2 ሚሊ ሊትር የሴንትሪፉጅ ቱቦ (የቲን ፎይል አይመከርም)
የናሙና መለያ፡ ቡድን+ድግምግሞሽ ለምሳሌ A1፣ A2፣ A3፤ B1፣ B2፣ B3።
ጭነት፡
1. ደረቅ በረዶ፡- ናሙናዎቹ በከረጢቶች ውስጥ መታሸግ እና በደረቅ በረዶ ውስጥ መቀበር አለባቸው።
2. RNA-ሊረጋጉ የሚችሉ ቱቦዎች፡- RNA ናሙናዎች በRNA ማረጋጊያ ቱቦ ውስጥ ሊደርቁ እና በክፍል ሙቀት ውስጥ ሊላኩ ይችላሉ።
የአገልግሎት የስራ ፍሰት
የሙከራ ንድፍ
የናሙና አቅርቦት
አር ኤን ኤ ማውጣት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች
ባዮኢንፎርማቲክስ
የትራንስክሪፕቶሜ ስብሰባ እና የዩኒጂን ምርጫ
የዩኒጂን ማብራሪያ
የባዮሎጂካል ቅጂዎች ትስስር እና ግምገማ ናሙና
የተለያዩ ጂኖች (DEGs)
የDEGዎች ተግባራዊ ማብራሪያ
የDEGዎች ተግባራዊ ማበልጸጊያ
በተዘጋጁ የህትመቶች ስብስብ አማካኝነት በBMKGene's eukaryotic NGS mRNA ቅደም ተከተል አገልግሎቶች የተመቻቹትን እድገቶች ያስሱ።
ሼን፣ ኤፍ. እና ሌሎች (2020) 'በአሙር ካትፊሽ (ሲሉረስ አሶተስ) ጎናድ ውስጥ የዴ ኖቮ ትራንስክሪፕቶሜ ስብስብ እና በጾታዊ አድልዎ የተሞላ የጂን አገላለጽ'፣ ጂኖሚክስ፣ 112(3)፣ ገጽ 2603–2614። doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026።
ዣንግ፣ ሲ. እና ሌሎችም (2016) 'በሽንኩርት ውስጥ በአምፖል እብጠት እና እድገት ወቅት የሱክሮስ ሜታቦሊዝም ግልባጭ ትንተና (አሊየም ሴፓ ኤል.)'፣ Frontiers in Plant Science፣ 7(ሴፕቴምበር)፣ ገጽ 212763። doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX።
ዙ፣ ሲ. እና ሌሎችም (2017) 'የሳርኮቺሊችቲስ ሲኔንሲስን ግልባጭ የዴ ኖቮ አሰባሰብ፣ ባህሪ እና ማብራሪያ'፣ PLoS ONE፣ 12(2)። doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966።
ዙ፣ ኤል. እና ሌሎች (2021) 'የዴ ኖቮ ትራንስክሪፕቶሜ ትንተና በጨው ውጥረት ወቅት የፖዶካርፐስ ማክሮፊለስን የጨው መቻቻል በተመለከተ ግንዛቤዎችን ይሰጣል'፣ BMC Plant Biology፣ 21(1)፣ ገጽ 1–17። doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9።
