-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ቺአይፒ-ሴክ)
ChIP-Seq ለሂስቶን ማሻሻያ፣ ግልባጭ ምክንያቶች እና ሌሎች ከዲኤንኤ ጋር ለተያያዙ ፕሮቲኖች ጂኖም-ሰፊ የዲኤንኤ ኢላማዎችን ያቀርባል።የተወሰኑ የፕሮቲን-ዲ ኤን ኤ ውስብስቦችን መልሶ ለማግኘት የ chromatin immuno-precipitation (ቺአይፒ) ምርጫን ያጣምራል፣ የተገኘውን የዲ ኤን ኤ የከፍተኛ-ሂደት ቅደም ተከተል ከቀጣዩ ትውልድ ቅደም ተከተል (NGS) ኃይል ጋር።በተጨማሪም፣ የፕሮቲን-ዲ ኤን ኤ ውህዶች ከህያዋን ህዋሶች ስለሚመለሱ፣ ማያያዣ ቦታዎች በተለያዩ የሕዋስ ዓይነቶች እና ቲሹዎች ወይም በተለያዩ ሁኔታዎች ሊነፃፀሩ ይችላሉ።አፕሊኬሽኖች ከጽሑፍ ግልባጭ ደንብ እስከ የእድገት ጎዳናዎች እስከ የበሽታ ዘዴዎች እና ከዚያም በላይ ናቸው።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል -ኤን.ኤስ
Metagenome የሚያመለክተው እንደ የአካባቢ ሜታጂኖም፣ የሰው ሜታጂኖም፣ ወዘተ ያሉ የተዋሃዱ ህዋሳት ማህበረሰብ አጠቃላይ የዘረመል ቁስ ስብስብ ነው።ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል ከአካባቢያዊ ናሙናዎች የተውጣጡ ድብልቅ ጂኖሚክ ቁሳቁሶችን ለመተንተን የሚያገለግል ሞለኪውላዊ መሳሪያ ነው ፣ ይህም ስለ ዝርያ ልዩነት እና ብዛት ፣ የስነ ሕዝብ አወቃቀር ፣ የፍየልጄኔቲክ ግንኙነት ፣ የተግባር ጂኖች እና ከአካባቢያዊ ሁኔታዎች ጋር ያለውን ትስስር ዝርዝር መረጃ ይሰጣል።
መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
ሜታጂኖሚክ ቅደም ተከተል-ናኖፖር
Metagenomics ከአካባቢያዊ ናሙናዎች የተውጣጡ ድብልቅ ጂኖሚክ ቁሳቁሶችን ለመተንተን የሚያገለግል ሞለኪውላዊ መሳሪያ ሲሆን ስለ ዝርያ ልዩነት እና ብዛት ፣የሕዝብ አወቃቀር ፣የሥነ-ሥርዓት ግንኙነት ፣ የተግባር ጂኖች እና የአካባቢ ሁኔታዎች ትስስር ወዘተ. ወደ ሜታጂኖሚክ ጥናቶች.በንባብ ርዝማኔ ያለው አስደናቂ አፈጻጸም በአብዛኛው ወደ ታች ዥረት ሜታጂኖሚክ ትንተና በተለይም የሜታጂኖም ስብሰባን አሻሽሏል።የንባብ-ርዝመት ጥቅሞችን በመውሰድ በናኖፖሬ ላይ የተመሰረተ የሜታጂኖሚክ ጥናት ከተኩስ-ጠመንጃ ሜታጂኖሚክስ ጋር በማነፃፀር ቀጣይነት ያለው ስብሰባን ማሳካት ይችላል።በናኖፖሬ ላይ የተመሰረቱ ሜታጂኖሚክስ ሙሉ እና የተዘጉ የባክቴሪያ ጂኖም ከማይክሮባዮሞች (Moss, EL, et. alተፈጥሮ ባዮቴክ, 2020)
መድረክ፡ናኖፖሬ ፕሮሜትሽን P48
-
ሙሉ የጂኖም ቢሰልፋይት ቅደም ተከተል
በሳይቶሲን (5-mC) ውስጥ በአምስተኛው ቦታ ላይ ያለው የዲ ኤን ኤ ሜቲላይዜሽን በጂን አገላለጽ እና በሴሉላር እንቅስቃሴ ላይ መሠረታዊ ተጽእኖ አለው.ያልተለመዱ የሜቲላይዜሽን ንድፎች ከበርካታ ሁኔታዎች እና እንደ ካንሰር ካሉ በሽታዎች ጋር ተያይዘዋል.WGBS በነጠላ ቤዝ መፍታት ጂኖም-ሰፊ ሜቲሌሽን ለማጥናት የወርቅ ደረጃ ሆኗል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
ለትራንስፖሴስ-ሊደረስ የሚችል Chromatin በከፍተኛ የፍተሻ ቅደም ተከተል (ATAC-seq)
ATAC-seq ጂኖም-ሰፊ chromatin ተደራሽነት ትንተና ከፍተኛ-throughput ቅደም ተከተል ዘዴ ነው, ይህም አቀፍ epigenetic የጂን መግለጫ ቁጥጥር አስፈላጊ ነው.የቅደም ተከተል አስማሚዎች ወደ ክፍት ክሮማቲን ክልሎች በሃይፐርአክቲቭ Tn5 transposase ገብተዋል።ከ PCR ማጉላት በኋላ፣ ተከታታይ ቤተ መፃህፍት ተገንብቷል።ሁሉም ክፍት ክሮማቲን ክልሎች በአንድ የተወሰነ የቦታ-ጊዜ ሁኔታ ውስጥ ሊገኙ ይችላሉ, ለጽሑፍ ግልባጭ ምክንያቶች አስገዳጅ ቦታዎች ብቻ ሳይሆን የተወሰነ ሂስቶን የተሻሻለ ክልል.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
በ 16S እና 18S አር ኤን ኤ ላይ ያለው ንዑስ ክፍል ሁለቱንም በጣም የተጠበቁ እና ከፍተኛ ተለዋዋጭ ክልሎችን የያዘ ለፕሮካርዮቲክ እና ኢውካርዮቲክ ፍጥረታት መለያ ፍጹም የሞለኪውላር አሻራ ነው።በቅደም ተከተል በመጠቀም እነዚህ አምፖሎች በተጠበቁ ክፍሎች ላይ ተመስርተው ሊነጣጠሩ ይችላሉ እና ከፍተኛ-ተለዋዋጭ ክልሎች በጥቃቅን ተህዋሲያን ለመለየት ሙሉ ለሙሉ ተለይተው የሚታወቁት ጥቃቅን ብዝሃነት ትንተና፣ ታክሶኖሚ፣ ፋይሎጅኒ ወዘተ. ነጠላ ሞለኪውል የእውነተኛ ጊዜ (SMRT) የPacBio መድረክ ቅደም ተከተል ከፍተኛ ትክክለኛ ረጅም ንባቦችን ለማግኘት ያስችላል፣ ይህም ሙሉ ርዝመት ያላቸውን አምፖሎች (በግምት 1.5 ኪባ) ሊሸፍን ይችላል።የጄኔቲክ መስክ ሰፊ እይታ በባክቴሪያ ወይም በፈንገስ ማህበረሰብ ውስጥ የዝርያ ማብራሪያ ላይ ያለውን መፍትሄ በእጅጉ አሻሽሏል።
መድረክ፡PacBio ተከታይ II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS የአምፕሊኮን ቅደም ተከተል ዓላማው በጣም የተነጋገሩትን እና ተለዋዋጭ ክፍሎችን የያዙ PCR የቤት አያያዝ የጄኔቲክ ማርከሮችን በመመርመር በጥቃቅን ማህበረሰብ ውስጥ የዝርያ ፣የታክሶኖሚ እና የዝርያ ብዛትን ለማሳየት ነው።የእነዚህ ፍፁም የሞለኪውላር የጣት አሻራ በ Woeses et al፣(1977) ማስተዋወቅ ከገለልተኝነት ነፃ የሆነ የማይክሮባዮም መገለጫን ያበረታታል።የ16S (ባክቴሪያዎች)፣ 18S (ፈንጋይ) እና Internal transcribed spacer(አይቲኤስ፣ ፈንገስ) ቅደም ተከተላቸው ሁለቱንም በብዛት የሚገኙ ዝርያዎችን እንዲሁም ብርቅዬ እና የማይታወቁ ዝርያዎችን ለመለየት ያስችላል።ይህ ቴክኖሎጂ በተለያዩ አከባቢዎች ማለትም በሰው አፍ፣ አንጀት፣ ሰገራ፣ ወዘተ ያሉ ልዩ ልዩ ተህዋሲያን ስብጥርን በመለየት በስፋት የተተገበረ እና ዋና መሳሪያ እየሆነ መጥቷል።
መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
የባክቴሪያ እና የፈንገስ ሙሉ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል
የባክቴሪያ እና የፈንገስ አጠቃላይ ጂኖም ዳግም ቅደም ተከተል የታወቁትን ባክቴሪያዎች እና ፈንገሶች ጂኖም ለማጠናቀቅ እንዲሁም በርካታ ጂኖምዎችን ለማነፃፀር ወይም የአዳዲስ ፍጥረታትን ጂኖም ለመቅረጽ ወሳኝ መሳሪያ ነው።ትክክለኛ የማጣቀሻ ጂኖም ለማመንጨት, ማይክሮባዮሎጂን ለመለየት እና ሌሎች የንጽጽር ጂኖም ጥናቶችን ለማካሄድ ሙሉውን የባክቴሪያ እና የፈንገስ ጂኖም በቅደም ተከተል ማስቀመጥ በጣም አስፈላጊ ነው.
መድረክ፡ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
PacBio-Full-ርዝመት 16S/18S/ITS የአምፕሊኮን ቅደም ተከተል
አምፕሊኮን (16S/18S/ITS) ፕላትፎርም በጥቃቅን ብዝሃነት ፕሮጀክት ትንተና የዓመታት ልምድ ያለው ሲሆን ይህም ደረጃውን የጠበቀ መሰረታዊ ትንተና እና ግላዊ ትንታኔን ይዟል፡ መሰረታዊ ትንተና የወቅቱ ጥቃቅን ምርምር ዋና ዋና የትንታኔ ይዘቶችን ይሸፍናል፣ የትንታኔ ይዘቱ የበለፀገ እና ሁሉን አቀፍ ነው። እና የትንታኔ ውጤቶች በፕሮጀክት ሪፖርቶች መልክ ቀርበዋል;ለግል የተበጁ ትንታኔዎች ይዘት የተለያዩ ናቸው.ለግል የተበጁ መስፈርቶችን ለመገንዘብ በመሠረታዊ የትንታኔ ዘገባ እና የምርምር ዓላማ መሠረት ናሙናዎች ሊመረጡ እና መለኪያዎች በተለዋዋጭ ሊዘጋጁ ይችላሉ።የዊንዶውስ ኦፐሬቲንግ ሲስተም, ቀላል እና ፈጣን.
-
PacBio-Full-long Transcriptome (ማጣቀሻ ያልሆነ)
የፓሲፊክ ባዮሳይንስ (PacBio) Isoform ተከታታይ ውሂብን እንደ ግብአት በመውሰድ ይህ መተግበሪያ የሙሉ ርዝመት ግልባጭ ቅደም ተከተሎችን (ያለ ስብሰባ) መለየት ይችላል።የሙሉ-ርዝመት ቅደም ተከተሎችን ከማጣቀሻ ጂኖም ጋር በማነፃፀር ግልባጮች በሚታወቁ ጂኖች ፣ ግልባጮች ፣ በኮድ ክልሎች ፣ ወዘተ. በዚህ ሁኔታ የበለጠ ትክክለኛ የኤምአርኤን አወቃቀሮችን እንደ አማራጭ መገጣጠም ፣ ወዘተ የመሳሰሉትን መለየት ይቻላል ።የጋራ ትንተና ከኤንጂኤስ የትራንስክሪፕት ቅደም ተከተል ዳታ የበለጠ አጠቃላይ ማብራሪያ እና የበለጠ ትክክለኛ አገላለጽ በጽሑፍ ግልባጭ ደረጃ እንዲታይ ያስችለዋል፣ ይህም በአብዛኛው የታችኛውን ተፋሰስ ልዩነት አገላለጽ እና ተግባራዊ ትንታኔን ይጠቀማል።
-
የተቀነሰ ውክልና Bisulfite ቅደም ተከተል (RRBS)
የዲኤንኤ ሜቲላይዜሽን ምርምር ሁልጊዜም በበሽታ ምርምር ውስጥ በጣም ሞቃት ርዕሰ ጉዳይ ነው, እና ከጂን አገላለጽ እና ፍኖተ-ዓይነት ባህሪያት ጋር በቅርበት የተያያዘ ነው.RRBS ለዲኤንኤ ሜቲላይዜሽን ምርምር ትክክለኛ፣ ቀልጣፋ እና ኢኮኖሚያዊ ዘዴ ነው።የፕሮሞተር እና የሲፒጂ ደሴት ክልሎችን በኢንዛይም ክላቭጅ (Msp I) ማበልፀግ ከBisulfite ቅደም ተከተል ጋር ተዳምሮ ከፍተኛ ጥራት ያለው የዲኤንኤ ሜቲላይዜሽን ማግኘትን ይሰጣል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ መድረክ
-
ፕሮካርዮቲክ mRNA ቅደም ተከተል
mRNA ቅደም ተከተል በተወሰኑ ሁኔታዎች ውስጥ በሴሎች ውስጥ ያሉትን ሁሉንም የኤምአርኤን ቅጂዎች አጠቃላይ መገለጫን ያበረታታል።ይህ የመቁረጫ ቴክኖሎጂ ውስብስብ የሆኑ የጂን አገላለጾችን መገለጫዎችን፣ የጂን አወቃቀሮችን እና ከተለያዩ ባዮሎጂካዊ ሂደቶች ጋር የተያያዙ ሞለኪውላዊ ስልቶችን በማሳየት እንደ ሃይለኛ መሳሪያ ሆኖ ያገለግላል።በመሠረታዊ ምርምር፣ ክሊኒካዊ ምርመራ እና የመድኃኒት ልማት ውስጥ በሰፊው ተቀባይነት ያለው፣ mRNA ቅደም ተከተል ስለ ሴሉላር ተለዋዋጭነት እና የጄኔቲክ ቁጥጥር ውስብስብነት ግንዛቤዎችን ይሰጣል።የእኛ የፕሮካርዮቲክ ኤምአርኤን ናሙና ማቀነባበር ለፕሮካርዮቲክ ትራንስክሪፕት የተዘጋጀ ነው፣ አር ኤን ኤ መሟጠጥ እና የአቅጣጫ ቤተመፃህፍት ዝግጅትን ያካትታል።
መድረክ፡ ኢሉሚና ኖቫሴክ ኤክስ
