የተቀነሰ ውክልና Bisulfite ቅደም ተከተል (RRBS)
የተቀነሰ የውክልና የቢሰልፋይት ቅደም ተከተል (RRBS) በሲፒጂ ደሴት የበለፀጉ ክልሎችን በ MspI ስንጥቅ በማበልፀግ እና ከ200-500/600 bps ቁርጥራጭ መጠን ምርጫን ይከተላል። ስለዚህ፣ ለሲፒጂ ደሴቶች ቅርበት ያላቸው ክልሎች ብቻ በቅደም ተከተል የተቀመጡ ሲሆኑ፣ ሩቅ የሲፒጂ ደሴቶች ያላቸው ከመተንተን የተገለሉ ናቸው። ይህ ሂደት ከ bisulfite ቅደም ተከተል ጋር ተጣምሮ ከፍተኛ ጥራት ያለው የዲ ኤን ኤ ሜቲላይዜሽን ለመለየት ያስችላል, እና ቅደም ተከተል አቀራረብ, PE150, በተለይም ከመሃል ይልቅ በመክተቻዎቹ ጫፎች ላይ ያተኩራል, ይህም የሜቲላይዜሽን ፕሮፋይል ቅልጥፍናን ይጨምራል.
ይህ ዘዴ በDNA methylation ምርምር ውስጥ ከሙሉ ጂኖም Bisulfite Sequencing (WGBS) ጋር ወጪ ቆጣቢ እና ቀልጣፋ አማራጭ ሆኖ ብቅ ብሏል። WGBS ሙሉውን ጂኖም በአንድ የመሠረት ጥራት በመመርመር አጠቃላይ ግንዛቤዎችን ሲያቀርብ፣ ከፍተኛ ወጪው ገደቡ ሊሆን ይችላል፣ ይህም RRBS የጂኖም ተወካይ ክፍልን በመምረጥ ይህንን ፈተና በዘዴ ይቀንሳል። ይህ ዘዴ ወጪ ቆጣቢ የዲ ኤን ኤ ሜቲሊየሽን ምርምርን እና የኤፒጄኔቲክ ዘዴዎችን እውቀትን የሚያጎለብት በዋጋ ሊተመን የማይችል መሳሪያ ነው።
የአገልግሎት ባህሪዎች
● በ Illumina NovaSeq ላይ ቅደም ተከተል.
● የማጣቀሻ ጂኖም ያስፈልገዋል።
● ላምዳ ዲ ኤን ኤ የቢሰልፋይት መለዋወጥን ውጤታማነት ለመቆጣጠር ይጠቅማል።
● የ MspI የምግብ መፈጨት ቅልጥፍና ቁጥጥር ይደረግበታል።
● ለዕፅዋት ናሙናዎች ድርብ ኢንዛይም መፈጨት።
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ወጪ ቆጣቢ እና ቀልጣፋ አማራጭ ከ WGBS: ትንታኔው በአነስተኛ ዋጋ እና በዝቅተኛ ናሙና መስፈርቶች እንዲካሄድ ያስችለዋል.
●የተሟላ መድረክ፡ከናሙና ማቀነባበር፣ ቤተመፃህፍት ግንባታ እና ቅደም ተከተል እስከ ባዮኢንፎርማቲክስ ትንታኔ ድረስ አንድ-ማቆም ጥሩ አገልግሎት እንሰጣለን።
●ሰፊ ዕውቀትበተለያዩ ዝርያዎች ውስጥ ስኬት አለን። BMKGENE ከአስር አመታት በላይ ልምድን፣ ከፍተኛ ችሎታ ያለው የትንታኔ ቡድን፣ አጠቃላይ ይዘት እና ከሽያጭ በኋላ ጥሩ ድጋፍን ያመጣል።
የአገልግሎት ዝርዝሮች
| ቤተ መፃህፍት | የቅደም ተከተል ስልት | የሚመከር የውሂብ ውፅዓት | የጥራት ቁጥጥር |
| MspI ተፈጭተው እና Bisulfite መታከም ቤተ መጻሕፍት | ኢሉሚና PE150 | 8 ጊባ | Q30 ≥ 85% የ Bsulfite ልወጣ > 99% MspI የመቁረጥ ውጤታማነት > 95% |
ናሙና መስፈርቶች
| ትኩረት (ng/µL) | ጠቅላላ መጠን (µg) |
| |
| ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ | ≥ 30 | ≥ 1 | የተገደበ መበላሸት ወይም ብክለት |
የአገልግሎት ሥራ ፍሰት
ናሙና መላኪያ
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች
የ BI ትንታኔ የሚከተሉትን ያጠቃልላል
● ጥሬ ቅደም ተከተል የጥራት ቁጥጥር;
● የማጣቀሻ ጂኖም ካርታ መስራት;
● የ 5mC methylated bases እና motif ለይቶ ማወቅ;
● የሜቲሌሽን ስርጭት እና የናሙና ንጽጽር ትንተና;
● የተለያየ የሜቲካል ክልሎች ትንተና (ዲኤምአር);
● ከዲኤምአር ጋር የተያያዙ ጂኖች ተግባራዊ ማብራሪያ።
የጥራት ቁጥጥር፡ የምግብ መፈጨት ቅልጥፍና (በጂኖም ካርታ ስራ)
የጥራት ቁጥጥር፡ bisulfite ልወጣ (በሜቲሌሽን መረጃ ማውጣት)
Methylation ካርታ፡ 5mC ሜቲሌሽን ጂኖም-ሰፊ ስርጭት
የናሙና ንጽጽር፡ ዋና አካል ትንተና
ልዩነት ሜቲላይትድ ክልሎች (ዲኤምአር) ትንታኔ፡ የሙቀት ካርታ
በ BMKGene አጠቃላይ የጂኖም ቢሰልፋይት ቅደም ተከተል አገልግሎቶች የተቀናጁ የሕትመቶችን ስብስብ በመጠቀም ያመቻቹትን የምርምር ግስጋሴዎች ያስሱ።
ሊ, ዜድ እና ሌሎች. (2022) በ CRISPR ማግበር እና በፓራክሪን ፋክተሮች ወደ ላይዲግ መሰል ህዋሶች ውስጥ ከፍተኛ ታማኝነት እንደገና ማደራጀት ፣PNAS Nexus፣ 1(4)። doi: 10.1093 / PNASNEXUS / PGAC179.
ቲያን, ኤች እና ሌሎች. (2023) በቻይንኛ ሞኖዚጎቲክ መንትዮች ውስጥ ያለው የሰውነት ስብጥር ጂኖም-ሰፊ ዲ ኤን ኤ ሜቲላይዜሽን ትንተና ፣የአውሮፓ ጆርናል ክሊኒካዊ ምርመራ, 53 (11), ገጽ. እ14055. doi: 10.1111 / ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'ዲ ኤን ኤ ሜቲላይሽን እና ከወገብ ወደ ዳሌ ጥምርታ፡ በቻይና ሞኖዚጎቲክ መንትዮች ላይ የተደረገ የኤፒጂኖም ሰፊ ማህበር ጥናት'፣ኢንዶክሪኖሎጂካል ምርመራ ጆርናል, 45 (12), ገጽ. 2365-2376. doi: 10.1007 / S40618-022-01878-4.
