የተቀነሰ ውክልና የቢሰልፋይት ቅደም ተከተል (RRBS)
የተቀነሰ የውክልና ቢሱልፋይት ቅደም ተከተል (RRBS) የሚወሰነው በMspI ክሊቫጅ የሲፒጂ ደሴት የበለጸጉ ክልሎችን በማበልጸግ ላይ ሲሆን በመቀጠልም ከ200-500/600 bps ቁርጥራጮች የመጠን ምርጫን ያካትታል። በዚህም ምክንያት፣ ከሲፒጂ ደሴቶች አቅራቢያ ያሉ ክልሎች ብቻ በቅደም ተከተል የሚቀመጡ ሲሆን፣ ሩቅ የሲፒጂ ደሴቶች ያላቸው ደግሞ ከትንታኔው አይካተቱም። ይህ ሂደት፣ ከቢሱልፋይት ቅደም ተከተል ጋር ተዳምሮ፣ የዲኤንኤ ሜቲሌሽን ከፍተኛ ጥራት ያለው መለየት ያስችላል፣ እና የቅደም ተከተል አቀራረብ፣ PE150፣ በተለይ በመሃል ላይ ሳይሆን በመሃል ላይ ባሉት ማስገቢያዎች ጫፎች ላይ ያተኩራል፣ ይህም የሜቲሌሽን መገለጫ ውጤታማነትን ይጨምራል።
ይህ ዘዴ በዲኤንኤ ሜቲሌሽን ጥናት ውስጥ ለጠቅላላ ጂኖም ቢሱልፋይት ሴክዩንሲንግ (WGBS) ወጪ ቆጣቢ እና ቀልጣፋ አማራጭ ሆኖ ብቅ ብሏል። WGBS መላውን ጂኖም በአንድ መሰረታዊ ጥራት በመመርመር አጠቃላይ ግንዛቤዎችን ቢሰጥም፣ ከፍተኛ ወጪው ውስን ሊሆን ይችላል፣ ይህም RRBS የጂኖምን ተወካይ ክፍል በምርጫ በመተንተን ይህንን ተግዳሮት በስትራቴጂካዊ መንገድ ያቃልላል። ይህ ዘዴ ወጪ ቆጣቢ የዲኤንኤ ሜቲሌሽን ምርምርን የሚያመቻች እና የኤፒጄኔቲክ ዘዴዎችን እውቀት የሚያሻሽል እጅግ ጠቃሚ መሳሪያ ነው።
የአገልግሎት ባህሪያት
● በኢሉሚና ኖቫሴክ ላይ ቅደም ተከተል ማድረግ።
● የማጣቀሻ ጂኖም ይፈልጋል።
● የላምዳ ዲኤንኤ የቢሱልፋይት ልወጣ ውጤታማነትን ለመከታተል ይጠቅማል።
● የኤምኤስፒአይ የምግብ መፈጨት ውጤታማነትም ክትትል ይደረግበታል።
● ለእፅዋት ናሙናዎች ድርብ የኢንዛይም መፈጨት።
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ለ WGBS ወጪ ቆጣቢ እና ቀልጣፋ አማራጭ፦ ትንታኔውን በዝቅተኛ ዋጋ እና በዝቅተኛ የናሙና መስፈርቶች እንዲካሄድ ያስችላል።
●የተሟላ መድረክ፡ከናሙና ማቀነባበሪያ፣ ከቤተ-መጽሐፍት ግንባታ እና ከቅደም ተከተል እስከ ባዮኢንፎርማቲክስ ትንተና ድረስ አንድ ጊዜ ብቻ የሚቆም እጅግ በጣም ጥሩ አገልግሎት እንሰጣለን።
●ሰፊ እውቀት፦ በተለያዩ ዝርያዎች ውስጥ ስኬት አግኝተናል። BMKGENE ከአስር አመታት በላይ ልምድ፣ ከፍተኛ ችሎታ ያለው የትንታኔ ቡድን፣ ሁሉን አቀፍ ይዘት እና ከሽያጭ በኋላ በጣም ጥሩ ድጋፍን ያመጣል።
የአገልግሎት ዝርዝር መግለጫዎች
| ቤተ መጻሕፍት | የቅደም ተከተል ስትራቴጂ | የሚመከር የውሂብ ውፅዓት | የጥራት ቁጥጥር |
| የኤምኤስፒአይ የተፈጨ እና የቢሱልፋይት የታከመ ቤተ-መጽሐፍት | ኢሉሚና PE150 | 8 ጊባ | ሩብ 30 ≥ 85% የቢሰልፋይት ልወጣ > 99% የኤምኤስፒአይ የመቁረጥ ውጤታማነት > 95% |
የናሙና መስፈርቶች
| ማጎሪያ (ng/µL) | ጠቅላላ መጠን (µግ) |
| |
| ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ | ≥ 30 | ≥ 1 | የተወሰነ መበላሸት ወይም ብክለት |
የአገልግሎት የስራ ፍሰት
የናሙና አቅርቦት
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ የሚሰጡ አገልግሎቶች
የቢአይ ትንተና የሚከተሉትን ያካትታል፡
● ጥሬ የቅደም ተከተል የጥራት ቁጥጥር፤
● ወደ ማጣቀሻ ጂኖም ካርታ ማውጣት፤
● የ5mC ሜቲላይትድ መሠረቶችን እና የሞቲፍ መለያን መለየት፤
● የሜቲሊቲየም ስርጭት ትንተና እና የናሙና ንጽጽር፤
● የተለያዩ ሜቲላይትድ ክልሎች (ዲኤምአርዎች) ትንተና፤
● ከዲኤምአርዎች ጋር የተያያዙ ጂኖች ተግባራዊ ማብራሪያ።
የጥራት ቁጥጥር፡ የምግብ መፈጨት ውጤታማነት (በጂኖም ካርታ ስራ)
የጥራት ቁጥጥር፡ የቢሰልፋይት ልወጣ (በሜቲሌሽን መረጃ ማውጣት)
የሜቲሌሽን ካርታ፡ 5mC ሜቲሌሽን በጂኖም-አቀፍ ስርጭት
የናሙና ንጽጽር፡ ዋና የክፍሎች ትንተና
የተለያየ ሜቲላይትድ ክልሎች (DMRs) ትንተና፡ የሙቀት ካርታ
በቢኤምኬጂኔ ሙሉ የጂኖም ቢሰልፋይት ቅደም ተከተል አገልግሎቶች የተመቻቹ የምርምር እድገቶችን በተዘጋጁ የህትመቶች ስብስብ ያስሱ።
ሊ፣ ዜድ. እና ሌሎች (2022) 'በCRISPR ማግበር እና ፓራክሪን ፋክተሮች አማካኝነት ወደ ሌይዲግ መሰል ሴሎች ከፍተኛ ታማኝነት ያለው ዳግም ፕሮግራም ማድረግ'፣PNAS Nexus፣ 1(4)። doi: 10.1093 / PNASNEXUS / PGAC179.
ቲያን፣ ኤች. እና ሌሎች (2023) 'በቻይናውያን ሞኖዚጎቲክ መንትዮች ውስጥ የሰውነት ስብጥር ጂኖም-አቀፍ የዲኤንኤ ሜቲሌሽን ትንተና'፣የአውሮፓ ጆርናል ኦፍ ክሊኒካል ኢንቬስትመንት, 53 (11), ገጽ. እ14055. doi: 10.1111 / ECI.14055.
ዉ፣ ዋይ. እና ሌሎች (2022) 'የዲኤንኤ ሜቲሌሽን እና ከወገብ እስከ ዳሌ ጥምርታ፡ በቻይናውያን ሞኖዚጎቲክ መንትዮች ላይ የኤፒጂኖም-አቀፍ የአሶሴሽን ጥናት'፣የኢንዶክሪኖሎጂ ምርመራ ጆርናል, 45 (12), ገጽ. 2365-2376. doi: 10.1007 / S40618-022-01878-4.
