منتجات

*النتائج التجريبية الموضحة هنا كلها مأخوذة من الجينومات المنشورة بواسطة Biomarker Technologies

1.LTR إدراج تقدير الوقت: يظهر الشكل توزيعًا ثنائيًا فريدًا في أوقات إدخال LTR-RTs في جينوم Weining Rye، مقارنة بالأنواع الأخرى.ظهرت الذروة الأخيرة منذ حوالي 0.5 مليون سنة.

لي قوانغ وآخرون،علم الوراثة الطبيعة، 2021

2.تحليل السلالات وعائلة الجينات في شايوت (Sechium edule): من خلال تحليل شايوت والأنواع الـ 13 الأخرى ذات الصلة في عائلة الجينات، وجد أن شايوت هو الأكثر ارتباطًا بقرع الثعبان (Trichosanthes anguina).وقد لوحظ وجود Chayote مشتق من قرع الثعبان في حوالي 27-45 Mya وتكرار الجينوم الكامل (WGD) في chayote في 25 ± 4 Mya، وهو حدث WGD الثالث في cucuibitaceae.

فو وآخرون،بحوث البستنة، 2021

3. تحليل Synteny: تم العثور على بعض الجينات المرتبطة بالهرمونات النباتية في نمو الفاكهة في الشايوت والقرع الثعبان والقرع.العلاقة بين شايوت والقرع أعلى قليلاً من العلاقة بين شايوت وقرع الثعبان.

فو وآخرون،بحوث البستنة، 2021

4. تحليل عائلة الجينات: أظهر إثراء KEGG على توسع عائلة الجينات وتقلصها في جينومات G.thurberi وG.davidsonii أن الجينات المرتبطة بالتخليق الحيوي للستيرويد والتخليق الحيوي للبراسينستيرويد قد تم توسيعها.

يانغ زي وآخرون،بي إم سي علم الأحياء، 2021

5.تحليل ازدواج الجينوم الكامل: أظهر تحليل توزيع 4DTV وKs حدث ازدواجية الجينوم بالكامل.أظهرت قمم الأنواع الداخلية أحداث الازدواجية.أظهرت قمم الأنواع المشتركة أحداثًا جديدة.وأشار التحليل إلى أنه بالمقارنة مع الأنواع الثلاثة الأخرى ذات الصلة الوثيقة، فقد مرت O. europaea بتكرار جيني واسع النطاق في الآونة الأخيرة.

راو جي وآخرون،بحوث البستنة، 2021

قضية بي إم كيه

الورد بدون وخز: رؤى جينية مرتبطة بالتكيف مع الرطوبة

نشرت: مراجعة العلوم الوطنية، 2021

استراتيجية التسلسل:

"باسي."عديم الشوك"(ر.ويشورينان) الجينوم:
تقريبا.93 × باكبيو + تقريبًا.90 × نانوبور + 267 × إلومينا

النتائج الرئيسية

1. تم بناء جينوم R.wichuraiana عالي الجودة باستخدام تقنيات التسلسل طويلة القراءة، والتي أسفرت عن تجميع قدره 530.07 ميجا بايت (كان حجم الجينوم المقدر حوالي 525.9 ميجا بايت عن طريق قياس التدفق الخلوي و 525.5 عن طريق مسح الجينوم؛ وكان تغاير الزيجوت حوالي 1.03٪).كانت النتيجة المقدرة لـ BUSCO 93.9٪.بالمقارنة مع "أحمر الخدود القديم" (haploOB)، تم تأكيد جودة واكتمال هذا الجينوم من خلال الدقة الأساسية أحادية القاعدة ومؤشر التجميع LTR (LAI = 20.03).يحتوي جينوم R.wichuraiana على 32,674 جينًا لترميز البروتين.

2. كشف التحليل المشترك متعدد الأوميات، الذي يتكون من علم الجينوم المقارن، وعلم النسخ، وتحليل QTL للسكان الوراثيين، عن الأنواع الحاسمة بين R. wichuraiana وRosa chinensis.أيضًا، من المحتمل أن يكون تباين التعبير عن الجينات ذات الصلة في QTL مرتبطًا بنمط وخز الجذع.

كشف تحليل الجينوم المقارن بين Basye;s Thornless وRosa chinensis، بما في ذلك تحليل التركيب، ومجموعة عائلة الجينات، وتحليل التوسع والانكماش، عن عدد كبير من الاختلافات، التي تتعلق بالسمات الحاسمة في الورود.كان من المحتمل جدًا أن يكون التوسع الفريد في عائلة الجينات NAC وFAR1/FRS مرتبطًا بمقاومة البقعة السوداء.

تشونغ، M.، وآخرون."وردة بدون وخز: رؤى جينية مرتبطة بالتكيف مع الرطوبة"مراجعة العلوم الوطنية, 2021;, nwab092.