تسلسل الحمض النووي DNA/RNA – جهاز التسلسل النانوي
تفاصيل الخدمة والميزات
| منصة | حجم المكتبة | الناتج النظري للبيانات (لكل خلية) | دقة القاعدة الواحدة | التطبيقات |
| نانوبور | 8 كيلوبايت، 10 كيلوبايت، 20 كيلوبايت، طويل جدًا، cDNA-PCR | 70-90 جيجابايت/خلية | 85-92% | تحديد الاختلافات البنيوية، التسلسل من الصفر، التسلسل الكامل، التسلسل المتساوي، شرح الجينات، الكشف عن مثيلة الحمض النووي |
مزايا الخدمة
● خبرة تزيد عن 5 سنوات في منصة تسلسل PacBio مع آلاف المشاريع المغلقة مع أنواع مختلفة.
● BMKGENE هي شريك رسمي لشركة Oxford Nanopore، حاصلة على شهادة منصة مزدوجة للحمض النووي الريبي/الحمض النووي.
● توجد نماذج شائعة لأجهزة التسلسل مزودة بمعدات كاملة وإنتاجية تسلسل كافية.
● استنادًا إلى منصة Nanopore، تم نشر أكثر من 10 أبحاث جديدة حول الحيوانات والنباتات في مجلات مشهورة دوليًا.
متطلبات العينة
| نوع العينة | كمية | التركيز (كيوبت ®) | مقدار | نقاء | آحرون |
| الحمض النووي الجينومي | يعتمد ذلك على متطلبات البيانات | ≥20 نانوغرام/ميكرولتر | ≥15 ميكرولتر | OD260/280=1.7-2.2؛ OD260/230≥1.5؛ قمة واضحة عند 260 نانومتر، بدون شوائب | يجب قياس التركيز بواسطة جهاز Qubit و Qubit/Nanopore ≤ 2 |
| الحمض النووي الريبي الكلي | ≥1.2 ميكروغرام | ≥100 ميكروغرام/ميكرولتر | ≥15 ميكرولتر | OD260/280=1.7-2.5؛ OD260/230=0.5-2.5؛ لا توجد ملوثات | قيمة RIN ≥ 7.5 |
سير عمل الخدمة
تحضير العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
تسليم المشروع
تقييم جودة بيانات عينة الحمض النووي
الجدول 1. إحصائيات حول البيانات النظيفة.
| BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | تنظيف ماكس لين | جودة متوسطة نظيفة |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
تقييم جودة بيانات عينة الحمض النووي الريبي
الجدول 1. إحصائيات حول البيانات النظيفة.
| اسم الملف | معرف العميل | رقم القراءة | الرقم الأساسي | N50 | متوسط الطول | أقصى طول | MeanQscore |
| RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | س12 |
الشكل 1. توزيع طول القراءة
الشكل 2. توزيع درجات جودة البيانات النظيفة
الشكل 3. توزيع طول البيانات النظيفة ودرجة جودتها
