منصة | حجم المكتبة | عائد البيانات النظرية (لكل خلية) | دقة قاعدة واحدة | التطبيقات |
نانوبور | 8 كيلو بايت ، 10 كيلو بايت ، 20 كيلو بايت ، Ultralong ، [كدنا] | 70-90 جيجابايت/خلية | 85-92 ٪ | SV Calling ، De Novo ، تسلسل كامل الطول ، ISO-Seq ، تعليق الجينات ، اكتشاف مثيلة الحمض النووي |
● خبرة أكثر من 5 سنوات على منصة تسلسل باكبيو مع آلاف المشاريع المغلقة مع أنواع مختلفة.
● BMKGENE شريك رسمي لأكسفورد نانوبور ، مع شهادة RNA/DNA منصة مزدوجة.
● هناك نماذج رئيسية من أجهزة التسلسل ذات المعدات الكاملة وإنتاجية تسلسل كافية.
● استنادًا إلى منصة Nanopore ، تم نشر أكثر من 10 أبحاث للحيوانات والنباتات في المجلات المشهورة دوليًا.
نوع العينة | كمية | التركيز (Qubit ®) | مقدار | نقاء | آحرون |
الحمض النووي الجيني | تعتمد على متطلبات البيانات | ≥20ng/ميكرولتر | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2 ؛ OD260/230≥1.5 ; ذروة واضحة عند 260 نانومتر - لا توجد ملوثات | يجب قياس التركيز بواسطة Qubit و Qubit/Nanopore ≤ 2 |
مجموع الحمض النووي الريبي | ≥1.2μg | ≥100 ميكروغرام/ميكرولتر | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5 ؛ OD260/230 = 0.5-2.5 ; لا توجد ملوثات | قيمة RIN ≥7.5 |
تقييم جودة البيانات لعينة الحمض النووي
الجدول 1. إحصائيات على البيانات النظيفة.
bmkid | rawseqnum | Rawsumbase | cleanseqnum | Cleansumbase | cleann50len | cleann90len | CleanMeanlen | CleanMaxlen | CleanMeanqual |
DNA_BMK01 | 1،218،239 | 26.37 | 1،121،736 | 25.90 | 28،014 | 15764 | 23،090 | 143،181 | 9 |
تقييم جودة البيانات لعينة الحمض النووي الريبي
الجدول 1. إحصائيات على البيانات النظيفة.
اسم الملف | ClientId | قراءة | الأساس | N50 | طول الطول | MaxLength | meadqscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8،947،708 | 4،047،230،083 | 398 | 452 | 129227 | Q12 |
الشكل 1. قراءة الطول توزيع
الشكل 2. توزيع نقاط الجودة للبيانات النظيفة
الشكل 3. طول نقاط الطول والجودة للبيانات النظيفة