-
تسلسل الكروماتين المناعي للترسيب (ChIP-seq)
يوفر ChIP-Seq تحديدًا على مستوى الجينوم لأهداف الحمض النووي لتعديل الهيستون وعوامل النسخ والبروتينات الأخرى المرتبطة بالحمض النووي.فهو يجمع بين انتقائية الترسيب المناعي للكروماتين (ChIP) لاستعادة مجمعات معينة من البروتين والحمض النووي ، مع قوة تسلسل الجيل التالي (NGS) للتسلسل عالي الإنتاجية للحمض النووي المستعاد.بالإضافة إلى ذلك ، نظرًا لاسترداد مجمعات البروتين والحمض النووي من الخلايا الحية ، يمكن مقارنة مواقع الارتباط في أنواع الخلايا والأنسجة المختلفة ، أو في ظل ظروف مختلفة.تتراوح التطبيقات من تنظيم النسخ إلى مسارات النمو إلى آليات المرض وما بعدها.
المنصة: Illumina NovaSeq 6000
-
تسلسل الجينوم الكامل
مثيلة الحمض النووي في المركز الخامس في السيتوزين (5-mC) لها تأثير أساسي على التعبير الجيني والنشاط الخلوي.ارتبطت أنماط المثيلة غير الطبيعية بالعديد من الحالات والأمراض ، مثل السرطان.أصبح WGBS المعيار الذهبي لدراسة مثيلة على مستوى الجينوم بدقة قاعدة واحدة.
المنصة: Illumina NovaSeq6000
-
فحص الكروماتين الذي يمكن الوصول إليه بواسطة Transposase مع تسلسل عالي الإنتاجية (ATAC-seq)
ATAC-seq هي طريقة تسلسل عالية الإنتاجية لتحليل إمكانية الوصول إلى الكروماتين على مستوى الجينوم ، وهو أمر مهم للتحكم في الوراثة اللاجينية العالمية للتعبير الجيني.يتم إدخال محولات التسلسل في مناطق الكروماتين المفتوحة عن طريق ترانسبوزيز Tn5 مفرط النشاط.بعد تضخيم PCR ، يتم إنشاء مكتبة تسلسل.يمكن الحصول على جميع مناطق الكروماتين المفتوحة في ظل ظروف زمنية محددة ، لا تقتصر فقط على مواقع الربط لعامل النسخ ، أو منطقة معينة معدلة هيستون.
-
التمثيل المنخفض لتسلسل بيسلفيت (RRBS)
لطالما كانت أبحاث مثيلة الحمض النووي موضوعًا ساخنًا في أبحاث الأمراض ، وترتبط ارتباطًا وثيقًا بالتعبير الجيني والسمات المظهرية.RRBS هي طريقة دقيقة وفعالة واقتصادية لأبحاث مثيلة الحمض النووي.يوفر إثراء مناطق المروج وجزيرة CpG عن طريق الانقسام الأنزيمي (Msp I) ، جنبًا إلى جنب مع تسلسل بيسلفيت ، اكتشاف مثيلة الحمض النووي عالي الدقة.
المنصة: Illumina NovaSeq 6000
