تسلسل الحمض النووي الريبوزي الرسول كامل الطول - تقنية النانوبور
سمات
● التقاط الحمض النووي الريبوزي الرسول متعدد الأدينين متبوعًا بتخليق الحمض النووي التكميلي وإعداد المكتبة
● تسلسل النسخ الكاملة
● التحليل المعلوماتي الحيوي القائم على المحاذاة مع جينوم مرجعي
● لا يقتصر التحليل المعلوماتي الحيوي على التعبير على مستوى الجين والنظائر فحسب، بل يشمل أيضًا تحليل الحمض النووي الريبوزي غير المشفر الطويل، والاندماجات الجينية، والتذييل المتعدد للأدينين، وبنية الجين.
مزايا الخدمة
●تحديد كمية التعبير على مستوى النظائر البروتينية: مما يتيح تحليلًا تفصيليًا ودقيقًا للتعبير الجيني، ويكشف عن التغييرات التي قد تكون مخفية عند تحليل التعبير الجيني الكامل
●انخفاض متطلبات البيانات:بالمقارنة مع تقنية التسلسل من الجيل التالي (NGS)، فإن تقنية التسلسل النانوي تُظهر متطلبات بيانات أقل، مما يسمح بمستويات مكافئة من تشبع قياس التعبير الجيني ببيانات أصغر.
●دقة أعلى في تحديد كمية التعبير: على مستوى الجين ومستوى النظائر
●تحديد معلومات إضافية عن النسخ الجيني: التذييل المتعدد البديل، وجينات الاندماج، و lcnRNA وجيناتها المستهدفة
●خبرة واسعةيتمتع فريقنا بثروة من الخبرة في كل مشروع، حيث أنجز أكثر من 850 مشروعًا كامل الطول للنسخ الجيني بتقنية النانوبور، وقام بمعالجة أكثر من 8000 عينة.
●دعم ما بعد البيعيمتد التزامنا لما بعد إتمام المشروع، حيث نقدم خدمة ما بعد البيع لمدة ثلاثة أشهر. خلال هذه الفترة، نوفر متابعة للمشروع، ومساعدة في حل المشكلات، وجلسات أسئلة وأجوبة للإجابة على أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
متطلبات العينات والتسليم
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها | ضبط الجودة |
| مُخصب بالبولي أ | نانوبور بروميثيون 48 | 6/12 جيجابايت | متوسط درجة الجودة: ١٠ |
متطلبات العينة:
النيوكليوتيدات:
| التركيز (نانوغرام/ميكرولتر) | الكمية (ميكروغرام) | نقاء | نزاهة |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 لم يظهر على الهلام إلا تلوث محدود أو معدوم بالبروتين أو الحمض النووي. | بالنسبة للنباتات: RIN≥7.0؛ بالنسبة للحيوانات: RIN≥7.5؛ 5.0≥28S/18S≥1.0؛ ارتفاع محدود أو معدوم في خط الأساس |
● النباتات:
الجذر أو الساق أو البتلة: 450 ملغ
الورقة أو البذرة: 300 ملغ
الفاكهة: 1.2 غرام
● حيوان:
القلب أو الأمعاء: 300 ملغ
الأحشاء أو الدماغ: 240 ملغ
العضلات: 450 ملغ
العظام أو الشعر أو الجلد: 1 غرام
● المفصليات:
الحشرات: 6 غرام
القشريات: 300 ملغ
● الدم الكاملأنبوب واحد
● الخلايا106 الخلايا
خدمة توصيل العينات الموصى بها
العبوة: أنبوب طرد مركزي سعة 2 مل (لا يُنصح باستخدام ورق القصدير)
تسمية العينة: مجموعة + تكرار، على سبيل المثال A1، A2، A3؛ B1، B2، B3.
شحنة:
1. الثلج الجاف: يجب تعبئة العينات في أكياس ودفنها في الثلج الجاف.
2. أنابيب RNAstable: يمكن تجفيف عينات الحمض النووي الريبي في أنبوب تثبيت الحمض النووي الريبي (مثل RNAstable®) وشحنها في درجة حرارة الغرفة.
سير عمل الخدمة
النيوكليوتيدات:
تسليم العينات
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
سير عمل الخدمة
منديل:
تصميم التجربة
تسليم العينات
استخلاص الحمض النووي الريبي
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
● معالجة البيانات الأولية
● تحديد النص
● التضفير البديل
● قياس التعبير على مستوى الجين ومستوى النظير
● تحليل التعبير التفاضلي
● شرح الوظائف وإثرائها (الجينات المتغيرة التعبير والجينات المتغيرة التعبير)
تحليل التضفير البديل
تحليل التذييل المتعدد البديل (APA)
التنبؤ بـ lncRNA
شرح الجينات الجديدة
تجميع عناصر DET
شبكات البروتين-بروتين في الجينات المتغيرة التعبير
استكشف التطورات التي سهّلتها خدمات تسلسل الحمض النووي الريبوزي المرسال كامل الطول بتقنية النانو من BMKGene من خلال مجموعة مختارة من المنشورات.
جونغ، ب. وآخرون (2023) "التنشيط اللاجيني والنسخي للكيناز الإفرازي FAM20C كجين ورمي في الورم الدبقي"، مجلة علم الوراثة وعلم الجينوم، 50(6)، ص 422-433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
هي، ز. وآخرون (2023) "التسلسل الكامل للنسخ الجيني للخلايا الليمفاوية المستجيبة للإنترفيرون غاما يكشف عن استجابة مناعية منحرفة نحو Th1 في سمك الفلوندر (Paralichthys olivaceus)"، علم المناعة للأسماك والمحار، 134، ص. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
ما، واي. وآخرون (2023) "تحليل مقارن لطرق تسلسل الحمض النووي الريبي PacBio وONT لتحديد سم Nemopilema Nomurai"، علم الجينوم، 115(6)، ص. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
يو، د. وآخرون (2023) "تحليل التسلسل النانوي يكشف عن اختلاف في التوجه الوظيفي بين الإكسوسومات والحويصلات الدقيقة المشتقة من الخلايا الجذعية الوسيطة المشتقة من الحبل السري البشري"، أبحاث وعلاج الخلايا الجذعية، 14(1)، ص 1-13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.
