التسلسل الطويل غير المشفر - إيلومينا
مزايا الخدمة
●التحليل المشترك لـ mRNA و lncRNA:من خلال الجمع بين تحديد كمية نسخ mRNA مع دراسة lncRNA وأهدافها، من الممكن الحصول على نظرة عامة متعمقة على الآلية التنظيمية التي تكمن وراء الاستجابة الخلوية.
●خبرة واسعةلقد عالجنا أكثر من 230,000 عينة، تغطي مختلف أهداف العينات والمشاريع. نوظف خبرتنا الواسعة في كل مشروع.
●التحليل المشترك لـ mRNA و lncRNA:نحن نجمع بين تحديد كمية نسخ mRNA مع دراسة lncRNA وأهدافها، مما يجعل من الممكن الحصول على نظرة عامة متعمقة على الآلية التنظيمية التي تكمن وراء الاستجابة الخلوية.
●مراقبة الجودة الصارمةنطبق نقاط تحكم أساسية في جميع المراحل، من تحضير العينات إلى تجهيز المكتبة، والتسلسل الجيني، والمعلوماتية الحيوية. مراقبتنا الدقيقة تضمن تقديم نتائج عالية الجودة باستمرار.
●شرح شاملنستخدم قواعد بيانات متعددة لشرح الجينات المعبر عنها تفاضليًا (DEGs) وظيفيًا وإجراء تحليلات إثرائية مناسبة. يوفر هذا النهج الشامل رؤىً ثاقبة حول العمليات الخلوية والجزيئية الكامنة وراء استجابة النسخ، مما يضمن حصولك على جميع المعلومات الممكنة حول بيانات تجربتك.
●دعم ما بعد البيعنحن ندرك أهمية التواجد الدائم، ولذلك يمتد التزامنا إلى ما بعد إتمام المشروع، مع فترة خدمة ما بعد البيع لمدة ثلاثة أشهر. خلال هذه الفترة، نقدم متابعة للمشروع، ومساعدة في استكشاف الأخطاء وإصلاحها، وجلسات أسئلة وأجوبة للإجابة على أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
متطلبات العينة والتسليم
| مكتبة | منصة | البيانات الموصى بها | مراقبة جودة البيانات |
| مكتبة اتجاهية مستنفدة من rRNA | إيلومينا PE150 | 10-16 جيجابايت | Q30 ≥ 85% |
النوكليوتيدات:
| التركيز (نانوغرام/ميكرولتر) | الكمية (ميكروغرام) | نقاء | نزاهة |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 يظهر على الجل تلوث محدود أو معدوم بالبروتين أو الحمض النووي. | رين ≥ 6.0؛ 5.0≥28 ثانية/18 ثانية≥1.0؛ ارتفاع خط الأساس محدود أو معدوم |
● النباتات:
الجذر أو الساق أو البتلة: 450 ملغ
الأوراق أو البذور: 300 ملغ
الفاكهة: 1.2 غرام
● الحيوان:
القلب أو الأمعاء: 450 ملغ
الأحشاء أو الدماغ: 240 ملغ
العضلات: 600 ملغ
العظام أو الشعر أو الجلد: 1.5 جرام
● المفصليات:
الحشرات: 9 جرام
القشريات: 450 ملغ
● الدم الكامل:أنبوبين
● الخلايا: 106 الخلايا
● المصل والبلازما: 6 مل
تسليم العينة الموصى به
الحاوية: أنبوب طرد مركزي سعة 2 مل (لا يُنصح باستخدام ورق القصدير)
تسمية العينة: المجموعة + التكرار مثل A1، A2، A3؛ B1، B2، B3.
شحنة:
1. الثلج الجاف: يجب تعبئة العينات في أكياس ودفنها في الثلج الجاف.
2. أنابيب تثبيت الحمض النووي الريبوزي (RNAstable): يمكن تجفيف عينات الحمض النووي الريبوزي (RNAstable®) في أنبوب تثبيت الحمض النووي الريبوزي (RNAstable®) وشحنها في درجة حرارة الغرفة.
سير عمل الخدمة
تصميم التجربة
تسليم العينة
استخراج الحمض النووي الريبي
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
علم المعلومات الحيوية
- البيانات الخام
- مراقبة جودة البيانات
- محاذاة الجينوم
- بنية الجينات (الربط البديل، وتحسين بنية الجينات والتنبؤ بالجينات الجديدة)
- تحديد كمية التعبير الجيني
- تحليل التعبير التفاضلي
- شرح وإثراء DEG + جينات هدف lncRNA ذات التعبير التفاضلي
- تحديد النسخة
- تحديد lncRNA (حفظ lncRNA وlncRNA المعروف)
- التنبؤ بجينات هدف lncRNA
- تحديد كمية تعبير lncRNA
- التحليل المشترك مع بيانات mRNA
تحليل التعبير الجيني التفاضلي (DEGs)
تحديد كمية التعبير عن lncRNA – التجميع
إثراء جينات هدف lncRNA
تحليل موضع المفصل mRNA وlncRNA – مخطط Circos (الدائرة الوسطى هي mRNA والدائرة الداخلية هي lncRNA)
اكتشف التطورات التي تيسرها خدمات تسلسل lncRNA الخاصة بشركة BMKGene من خلال مجموعة مختارة من المنشورات.
جي، هـ. وآخرون (2020) "التعرف على lncRNAs المرتبطة بالإجهاد البارد والتنبؤ الوظيفي والتحقق من lncRNA الرئيسي في كبد الفئران".التقارير العلمية2020 10:1، 10(1)، ص. 1-14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
جيا، ز. وآخرون (2021) "التحليل النسخي التكاملي يكشف عن الآلية المناعية لسلالة سمك الشبوط الشائع المقاومة لفيروس CyHV-3"،الحدود في علم المناعة، 12، ص. 687151. دوى: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
وانج، إكس جيه وآخرون (2022) "إعطاء الأولوية لشبكات تنظيم الحمض النووي الريبي المتنافسة القائمة على تكامل متعدد الأوميكس في سرطان الرئة ذي الخلايا الصغيرة: الخصائص الجزيئية والمرشحين للأدوية".الحدود في علم الأورام، 12، ص. 904865. دوى: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
شياو، ل. وآخرون (2020) "التشريح الجيني لشبكة التعبير الجيني التي تشكل أساس عملية التمثيل الضوئي في الحور"،مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية، 18(4)، ص 1015-1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
تشنغ، هـ. وآخرون (2022) "شبكة تنظيمية عالمية للتعبير الجيني غير المنظم والإشارات الأيضية غير الطبيعية في الخلايا المناعية في البيئة المحيطة بمرض جريفز والتهاب الغدة الدرقية هاشيموتو".الحدود في علم المناعة، 13، ص. 879824. دوى: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
