BMKCloud Log in
条形banner-03

منتجات

التسلسل الميتاجينومي-نانوبور

Metagenomics هي أداة جزيئية تستخدم لتحليل المواد الجينومية المختلطة المستخرجة من العينات البيئية، والتي توفر معلومات مفصلة عن تنوع الأنواع ووفرتها، والتركيبة السكانية، والعلاقة التطورية، والجينات الوظيفية وشبكة الارتباط مع العوامل البيئية، وما إلى ذلك. وقد تم مؤخرًا تقديم منصات تسلسل Nanopore للدراسات الميتاجينومية.أدى أدائه المتميز في طول القراءة إلى تعزيز التحليل الميتاجينومي للتيار السفلي إلى حد كبير، وخاصة تجميع الميتاجينوم.من خلال الاستفادة من طول القراءة، فإن دراسة الميتاجينوم المستندة إلى Nanopore قادرة على تحقيق تجميع أكثر استمرارًا مقارنةً بعلم الميتاجينوم الخاص بالبندقية.لقد تم نشر أن الميتاجينوميات المعتمدة على النانوبور نجحت في توليد جينومات بكتيرية كاملة ومغلقة من الميكروبات (Moss, EL, et. al,الطبيعة الحيوية، 2020)

منصة:نانوبور بروميثيون P48


تفاصيل الخدمة

النتائج التجريبية

قضية بي إم كيه

مزايا الخدمة

● تجميع عالي الجودة - تعزيز دقة تحديد الأنواع والتنبؤ بالجينات الوظيفية

● عزل الجينوم البكتيري مغلق

● تطبيق أكثر قوة وموثوقية في مجالات متنوعة، على سبيل المثال الكشف عن الكائنات الحية الدقيقة المسببة للأمراض أو الجينات المرتبطة بمقاومة المضادات الحيوية

● تحليل الميتاجينوم المقارن

مواصفات الخدمة

 منصة

التسلسل

البيانات الموصى بها

الفترة الزمنية

نانوبور

أونت

6 جم/10 جم

65 يوم عمل

تحليلات المعلوماتية الحيوية

● مراقبة جودة البيانات الأولية

● تجميع الميتاجينوم

● مجموعة الجينات غير الزائدة والشروح

● تحليل تنوع الأنواع

● تحليل تنوع الوظائف الجينية

● التحليل المشترك بين المجموعات

● تحليل الارتباط ضد العوامل التجريبية

نانوبور

متطلبات العينة والتسليم

متطلبات العينة والتسليم

متطلبات العينة:   

لمقتطفات الحمض النووي:

نوع العينة

كمية

تركيز

نقاء

مقتطفات الحمض النووي

1-1.5 ميكروغرام

> 20 نانوغرام/ميكروليتر

OD260/280 = 1.6-2.5

للعينات البيئية:

نوع العينة

إجراءات أخذ العينات الموصى بها

تربة

كمية العينة: تقريبًا.5 جرام؛يجب إزالة المادة الذابلة المتبقية من السطح؛طحن قطع كبيرة وتمريرها عبر مرشح 2 مم؛عينات قسامة في أنبوب EP أو أنبوب cyrotube المعقم للحجز.

البراز

كمية العينة: تقريبًا.5 جرام؛جمع وقسامة العينات في أنبوب EP المعقم أو أنبوب التبريد للحجز.

محتويات الأمعاء

يجب معالجة العينات تحت ظروف معقمة.غسل الأنسجة التي تم جمعها مع برنامج تلفزيوني؛أجهزة الطرد المركزي في برنامج تلفزيوني وجمع المرسب في أنابيب EP.

الحمأة الناتجة

كمية العينة: تقريبًا.5 جرام؛جمع وقسامة عينة الحمأة في أنبوب EP المعقم أو أنبوب التبريد للحجز

جسم مائي

بالنسبة للعينة التي تحتوي على كمية محدودة من الميكروبات، مثل ماء الصنبور، ومياه الآبار، وما إلى ذلك، قم بجمع ما لا يقل عن 1 لتر من الماء وتمريرها عبر مرشح 0.22 ميكرومتر لإثراء الميكروبات على الغشاء.تخزين الغشاء في أنبوب معقم.

جلد

كشط سطح الجلد بعناية باستخدام قطعة قطن معقمة أو شفرة جراحية ووضعها في أنبوب معقم.

أوصى تسليم العينة

قم بتجميد العينات في النيتروجين السائل لمدة 3-4 ساعات وتخزينها في النيتروجين السائل أو -80 درجة للحفظ على المدى الطويل.مطلوب شحن العينة مع الثلج الجاف.

تدفق عمل الخدمة

تسليم العينة

تسليم العينة

إعداد المكتبة

بناء المكتبة

التسلسل

التسلسل

تحليل البيانات

تحليل البيانات

خدمات ما بعد البيع

خدمات ما بعد البيع


  • سابق:
  • التالي:

  • 1.الخريطة الحرارية: تجميع ثراء الأنواع32. الجينات الوظيفية المشروحة لمسارات التمثيل الغذائي لـ KEGG43. شبكة ارتباط الأنواع54.Circos من الجينات المقاومة للمضادات الحيوية CARD
    6

    قضية بي إم كيه

    تتيح الميتاجينوميات النانوية التشخيص السريري السريع لعدوى الجهاز التنفسي السفلي البكتيرية

    نشرت:التكنولوجيا الحيوية الطبيعية، 2019

    أبرز النقاط الفنية
    التسلسل: نانوبور مينيون
    المعلوماتية الحيوية الميتاجينومية السريرية: استنفاد الحمض النووي المضيف، وتحليل WIMP وARMA
    الكشف السريع: 6 ساعات
    حساسية عالية: 96.6%

    النتائج الرئيسية

    في عام 2006، تسببت عدوى الجهاز التنفسي السفلي في وفاة 3 ملايين إنسان على مستوى العالم.الطريقة النموذجية للكشف عن مسببات الأمراض LR1 هي الزراعة، التي تتسم بحساسية ضعيفة، ومدة زمنية طويلة، ونقص التوجيه في العلاج بالمضادات الحيوية المبكرة.لقد كان التشخيص الميكروبي السريع والدقيق منذ فترة طويلة حاجة ملحة.نجح الدكتور جاستن من جامعة إيست أنجليا وشركاؤه في تطوير طريقة ميتاجينومية قائمة على النانوبور للكشف عن مسببات الأمراض.وفقا لسير العمل، يمكن استنفاد 99.99% من الحمض النووي المضيف.يمكن الانتهاء من الكشف عن مسببات الأمراض والجينات المقاومة للمضادات الحيوية خلال 6 ساعات.

    مرجع
    تشارلامبوس، تي، كاي، جي إل، ريتشاردسون، إتش.، أيدين، أ.، أوغرادي، جي.(2019).تتيح الميتاجينوميات النانوية التشخيص السريري السريع لعدوى الجهاز التنفسي السفلي البكتيرية.الطبيعة والتكنولوجيا الحيوية, 37(7)، 1.

    إقتبس

    اكتب رسالتك هنا وأرسلها لنا

    أرسل رسالتك إلينا: