-
تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA) أحادي النواة
التقدم في التقاط خلية واحدة وتقنية بناء المكتبة الفردية مع الجمع بين التسلسل عالي الإنتاجية يسمح بإجراء دراسات التعبير الجيني على أساس كل خلية على حدة.فهو يتيح إجراء تحليل أعمق وكامل للنظام على مجموعات الخلايا المعقدة، حيث يتجنب إلى حد كبير إخفاء عدم تجانسها عن طريق أخذ متوسط جميع الخلايا.
ومع ذلك، فإن بعض الخلايا ليست مناسبة لتحويلها إلى معلق أحادي الخلية، لذلك هناك حاجة إلى طرق أخرى لتحضير العينات - استخراج النواة من الأنسجة، أي يتم استخراج النواة مباشرة من الأنسجة أو الخلية وإعدادها في معلق أحادي النواة للتعليق المفرد. تسلسل الخلايا.
توفر BMK خدمة تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA) أحادية الخلية المستندة إلى Genomics ChromiumTM 10×.تم استخدام هذه الخدمة على نطاق واسع في الدراسات المتعلقة بالأمراض، مثل تمايز الخلايا المناعية، وعدم تجانس الورم، وتطوير الأنسجة، وما إلى ذلك.
شريحة النسخ المكاني: 10 × الجينوم
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
تسلسل الجينوم الكامل للنبات/الحيوان
تتيح عملية إعادة تسلسل الجينوم بالكامل، والمعروفة أيضًا باسم WGS، الكشف عن كل من الطفرات الشائعة والنادرة في الجينوم بأكمله بما في ذلك تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNP)، وحذف الإدراج (InDel)، وتنوع البنية (SV)، وتباين أرقام النسخ (CNV). ).تشكل SVs جزءًا أكبر من قاعدة التباين مقارنة بـ SNPs ولها تأثير أكبر على الجينوم، والذي له تأثير كبير على الكائنات الحية.تسمح إعادة التسلسل للقراءة الطويلة بتحديد أكثر دقة للأجزاء الكبيرة والاختلافات المعقدة لأن القراءات الطويلة تجعل من الأسهل بكثير عبور الكروموسومات عبر المناطق المعقدة مثل التكرارات الترادفية والمناطق الغنية بـ GC/AT والمناطق شديدة التغير.
المنصة: إلومينا، باكبيو، نانوبور
-
BMKMANU S1000 النسخ المكاني
يقف علم النسخ المكاني في طليعة الابتكار العلمي، حيث يمكّن الباحثين من التعمق في أنماط التعبير الجيني المعقدة داخل الأنسجة مع الحفاظ على سياقها المكاني.ومن بين العديد من المنصات، قامت شركة BMKGene بتطوير شريحة BMKManu S1000 Spatial Transcriptome، التي تتميز بميزةدقة محسنةمن 5μM، والوصول إلى النطاق التحت خلوي، وتمكينإعدادات القرار متعددة المستويات.تستخدم شريحة S1000، التي تضم ما يقرب من 2 مليون نقطة، آبارًا صغيرة ذات طبقات من الخرز المحملة بمسبارات التقاط مشفرة مكانيًا.يتم إعداد مكتبة cDNA، المخصبة بالرموز الشريطية المكانية، من شريحة S1000 ويتم تسلسلها لاحقًا على منصة Illumina NovaSeq.يضمن الجمع بين العينات المشفرة مكانيًا وUMIs دقة وخصوصية البيانات التي تم إنشاؤها.تكمن السمة الفريدة لشريحة BMKManu S1000 في تعدد استخداماتها، حيث توفر إعدادات دقة متعددة المستويات يمكن ضبطها بدقة لتناسب الأنسجة ومستويات التفاصيل المختلفة.تعمل هذه القدرة على التكيف على وضع الشريحة كخيار رائع لدراسات النسخ المكاني المتنوعة، مما يضمن التجميع المكاني الدقيق بأقل قدر من الضوضاء.
باستخدام شريحة BMKManu S1000 وغيرها من تقنيات النسخ المكاني، يمكن للباحثين الحصول على فهم أفضل للتنظيم المكاني للخلايا والتفاعلات الجزيئية المعقدة التي تحدث داخل الأنسجة، مما يوفر رؤى لا تقدر بثمن حول الآليات الكامنة وراء العمليات البيولوجية في مجموعة واسعة من المجالات، بما في ذلك علم الأورام وعلم الأعصاب وعلم الأحياء التنموي وعلم المناعة والدراسات النباتية.
المنصة: شريحة BMKManu S1000 وIllumina NovaSeq
-
10x الجينوم فيزيوم النسخ المكاني
تعد النسخ المكانية تقنية متطورة تسمح للباحثين بالتحقيق في أنماط التعبير الجيني داخل الأنسجة مع الحفاظ على سياقها المكاني.إحدى المنصات القوية في هذا المجال هي 10x Genomics Visium مقترنة بتسلسل Illumina.يعتمد مبدأ 10X Visium على شريحة متخصصة ذات منطقة التقاط مخصصة حيث يتم وضع أقسام الأنسجة.تحتوي منطقة الالتقاط هذه على نقاط مشفرة، كل منها يتوافق مع موقع مكاني فريد داخل الأنسجة.يتم بعد ذلك تصنيف جزيئات الحمض النووي الريبي (RNA) التي تم التقاطها من الأنسجة بمعرفات جزيئية فريدة (UMIs) أثناء عملية النسخ العكسي.تتيح هذه البقع المرمزة وUMIs رسم الخرائط المكانية الدقيقة والتقدير الكمي للتعبير الجيني بدقة خلية واحدة.يضمن الجمع بين العينات المشفرة مكانيًا وUMIs دقة وخصوصية البيانات التي تم إنشاؤها.باستخدام تقنية النسخ المكاني هذه، يمكن للباحثين اكتساب فهم أعمق للتنظيم المكاني للخلايا والتفاعلات الجزيئية المعقدة التي تحدث داخل الأنسجة، مما يوفر رؤى لا تقدر بثمن حول الآليات الكامنة وراء العمليات البيولوجية في مجالات متعددة، بما في ذلك علم الأورام وعلم الأعصاب وعلم الأحياء التطوري وعلم المناعة. ، والدراسات النباتية.
المنصة: 10X Genomics Visium وIllumina NovaSeq
-
كامل طول تسلسل مرنا-نانوبوري
في حين أن تسلسل mRNA القائم على NGS بمثابة أداة متعددة الاستخدامات لتقدير التعبير الجيني، فإن اعتماده على القراءات القصيرة يحد من فعاليته في التحليلات النصية المعقدة.من ناحية أخرى، يستخدم تسلسل Nanopore تقنية القراءة الطويلة، مما يتيح تسلسل نصوص mRNA كاملة الطول.يسهل هذا النهج استكشافًا شاملاً للربط البديل، واندماج الجينات، والأدينيلات المتعددة، والتقدير الكمي لأشكال الرنا المرسال.
يعتمد تسلسل ثقب النانو على الإشارات الكهربائية في الوقت الفعلي لجزيء واحد من ثقب النانو.يرتبط الحمض النووي المزدوج، مسترشدًا بالبروتينات الحركية، ببروتينات المسام النانوية المدمجة في الغشاء الحيوي، ويتفكك أثناء مروره عبر قناة المسام النانوية تحت فرق الجهد.يتم الكشف عن الإشارات الكهربائية المميزة التي تولدها قواعد مختلفة على شريط الحمض النووي وتصنيفها في الوقت الحقيقي، مما يسهل تسلسل النوكليوتيدات الدقيق والمستمر.يتغلب هذا النهج المبتكر على قيود القراءة القصيرة ويوفر منصة ديناميكية للتحليل الجيني المعقد، ويتضمن دراسات نسخية معقدة.
المنصة: نانوبور بروميثيون P48
-
تسلسل mRNA كامل الطول -PacBio
في حين أن تسلسل mRNA القائم على NGS هو أداة متعددة الاستخدامات لقياس التعبير الجيني، فإن اعتماده على القراءات القصيرة يقيد استخدامه في التحليلات النصية المعقدة.من ناحية أخرى، يستخدم تسلسل PacBio (Iso-Seq) تقنية القراءة الطويلة، مما يتيح تسلسل نصوص mRNA كاملة الطول.يسهل هذا النهج استكشافًا شاملاً للربط البديل، واندماج الجينات، والأدينيلات المتعددة على الرغم من أنه ليس الخيار الأساسي لتقدير التعبير الجيني، نظرًا للكمية الكبيرة من البيانات المطلوبة.
تعتمد تقنية تسلسل PacBio على تسلسل جزيء واحد في الوقت الفعلي (SMRT)، مما يوفر ميزة واضحة في التقاط نصوص mRNA كاملة الطول.يتضمن هذا النهج المبتكر استخدام أدلة موجية ذات الوضع الصفري (ZMWs)، وهي آبار مصنعة بدقة تتيح المراقبة في الوقت الحقيقي لنشاط بوليميراز الحمض النووي أثناء التسلسل.داخل هذه ZMWs، يقوم بوليميريز الحمض النووي الخاص بـ PacBio بتوليف شريط مكمل من الحمض النووي، مما يولد قراءات طويلة تغطي كامل نسخ mRNA.يعمل تشغيل PacBio في وضع تسلسل الإجماع الدائري (CCS) على تحسين الدقة من خلال التسلسل المتكرر لنفس الجزيء.تتمتع قراءات HiFi التي تم إنشاؤها بدقة مماثلة لـ NGS، مما يساهم بشكل أكبر في تحليل شامل وموثوق لميزات النسخ المعقدة.المنصة: PacBio Sequel II
-
حقيقيات النواة mRNA تسلسل-إلومينا
يُمكّن تسلسل mRNA من التنميط الشامل لجميع نصوص mRNA داخل الخلايا في ظل ظروف محددة.تعمل هذه التكنولوجيا المتطورة كأداة فعالة، حيث تكشف عن ملفات التعبير الجيني المعقدة، والهياكل الجينية، والآليات الجزيئية المرتبطة بالعمليات البيولوجية المتنوعة.تم اعتماد تسلسل mRNA على نطاق واسع في الأبحاث الأساسية والتشخيص السريري وتطوير الأدوية، ويقدم نظرة ثاقبة لتعقيدات الديناميكيات الخلوية والتنظيم الجيني.
المنصة: Illumina NovaSeq X
-
تسلسل mRNA غير المرجعي - Illumina
يُمكّن تسلسل mRNA من التنميط الشامل لجميع نصوص mRNA داخل الخلايا في ظل ظروف محددة.تعمل هذه التكنولوجيا المتطورة كأداة فعالة، حيث تكشف عن ملفات التعبير الجيني المعقدة، والهياكل الجينية، والآليات الجزيئية المرتبطة بالعمليات البيولوجية المتنوعة.تم اعتماد تسلسل mRNA على نطاق واسع في الأبحاث الأساسية والتشخيص السريري وتطوير الأدوية، ويقدم نظرة ثاقبة لتعقيدات الديناميكيات الخلوية والتنظيم الجيني.
المنصة: Illumina NovaSeq X
-
تسلسل طويل غير مشفر - Illumina
إن RNAs الطويلة غير المشفرة (lncRNAs) عبارة عن RNAs أطول من 200 نيوكليوتيدات تمتلك الحد الأدنى من إمكانات الترميز وهي عناصر محورية داخل RNA غير المشفر.تلعب هذه الـ RNA الموجودة في النواة والسيتوبلازم أدوارًا حاسمة في التنظيم اللاجيني والنسخي وما بعد النسخي، مما يؤكد أهميتها في تشكيل العمليات الخلوية والجزيئية.يعد تسلسل LncRNA أداة قوية في تمايز الخلايا، وتكوين الجينات، والأمراض البشرية.
المنصة: إلومينا نوفا سيك
-
تسلسل الحمض النووي الريبي الصغير-إلومينا
تشتمل جزيئات الحمض النووي الريبوزي (sRNA) الصغيرة، التي يقل طولها عادةً عن 200 نيوكليوتيدات، على الرنا الميكروي (miRNAs)، والرنا الصغير المتداخل (siRNAs)، والرنا المتفاعل مع بيوي (piRNAs).من بين هذه العناصر، فإن miRNAs، التي يبلغ طولها حوالي 20-24 نيوكليوتيدات، جديرة بالملاحظة بشكل خاص لدورها التنظيمي المحوري في العمليات الخلوية المختلفة.مع أنماط التعبير الخاصة بالأنسجة والمرحلة المحددة، تظهر miRNAs درجة عالية من الحفظ عبر الأنواع المختلفة.
المنصة: إلومينا نوفا سيك
-
تسلسل circRNA-Illumina
تسلسل الحمض النووي الريبي الدائري (circRNA-seq) هو تحديد وتحليل الحمض النووي الريبي الدائري، وهو فئة من جزيئات الحمض النووي الريبي (RNA) التي تشكل حلقات مغلقة بسبب أحداث الربط غير المتعارف عليها، مما يوفر لهذا الحمض النووي الريبي (RNA) استقرارًا متزايدًا.في حين ثبت أن بعض circRNAs تعمل كإسفنجات microRNA، حيث تعزل microRNAs وتمنعها من تنظيم mRNAs المستهدفة، فإن circRNAs الأخرى قد تتفاعل مع البروتينات، أو تعدل التعبير الجيني، أو يكون لها أدوار في العمليات الخلوية.يوفر تحليل تعبير circRNA نظرة ثاقبة للأدوار التنظيمية لهذه الجزيئات وأهميتها في العمليات الخلوية المختلفة، ومراحل النمو، وحالات المرض، مما يساهم في فهم أعمق لتعقيد تنظيم RNA في سياق التعبير الجيني.
-
تسلسل النسخ الكامل - Illumina
يوفر تسلسل النسخ الكامل نهجًا شاملاً لتوصيف جزيئات الحمض النووي الريبي (RNA) المتنوعة، بما في ذلك كلاً من الحمض النووي الريبي المشفر (mRNA) والحمض النووي الريبي غير المشفر (lncRNA، وcircRNA، وmiRNA).تلتقط هذه التقنية النسخة الكاملة لخلايا محددة في لحظة معينة، مما يسمح بفهم شامل للعمليات الخلوية.المعروف أيضًا باسم "تسلسل الحمض النووي الريبي الكلي"، ويهدف إلى الكشف عن شبكات تنظيمية معقدة على مستوى النسخ، مما يتيح إجراء تحليل متعمق مثل تحليل الحمض النووي الريبي (RNA) الداخلي المتنافس (ceRNA) وتحليل الحمض النووي الريبي (RNA) المشترك.يمثل هذا الخطوة الأولى نحو التوصيف الوظيفي، لا سيما في كشف الشبكات التنظيمية التي تتضمن تفاعلات ceRNA المستندة إلى circRNA-miRNA-mRNA.
