-
التسلسل المناعي للكروماتين (ChIP-seq)
يوفر ChIP-Seq ملفات تعريف على مستوى الجينوم لأهداف الحمض النووي لتعديل الهيستون وعوامل النسخ والبروتينات الأخرى المرتبطة بالحمض النووي.فهو يجمع بين انتقائية الترسيب المناعي للكروماتين (ChIP) لاستعادة مجمعات محددة من البروتين والحمض النووي، مع قوة تسلسل الجيل التالي (NGS) للتسلسل عالي الإنتاجية للحمض النووي المستعاد.بالإضافة إلى ذلك، نظرًا لأنه يتم استرداد مجمعات البروتين والحمض النووي من الخلايا الحية، يمكن مقارنة مواقع الارتباط في أنواع وأنسجة مختلفة من الخلايا، أو في ظل ظروف مختلفة.تتراوح التطبيقات من التنظيم النسخي إلى المسارات التنموية إلى آليات المرض وما بعدها.
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
التسلسل الميتاجينومي -NGS
يشير الميتاجينوم إلى مجموعة من المواد الوراثية الإجمالية لمجتمع مختلط من الكائنات الحية، مثل الميتاجينوم البيئي، والميتاجينوم البشري، وما إلى ذلك. ويحتوي على جينومات الكائنات الحية الدقيقة القابلة للزراعة وغير القابلة للزراعة.التسلسل الميتاجينومي هو أداة جزيئية تستخدم لتحليل المواد الجينومية المختلطة المستخرجة من العينات البيئية، والتي توفر معلومات مفصلة عن تنوع الأنواع ووفرتها، والتركيبة السكانية، والعلاقة التطورية، والجينات الوظيفية وشبكة الارتباط مع العوامل البيئية.
منصة:منصة إلومينا نوفا سيك
-
التسلسل الميتاجينومي-نانوبور
Metagenomics هي أداة جزيئية تستخدم لتحليل المواد الجينومية المختلطة المستخرجة من العينات البيئية، والتي توفر معلومات مفصلة عن تنوع الأنواع ووفرتها، والتركيبة السكانية، والعلاقة التطورية، والجينات الوظيفية وشبكة الارتباط مع العوامل البيئية، وما إلى ذلك. وقد تم مؤخرًا تقديم منصات تسلسل Nanopore للدراسات الميتاجينومية.أدى أدائه المتميز في طول القراءة إلى تعزيز التحليل الميتاجينومي للتيار السفلي إلى حد كبير، وخاصة تجميع الميتاجينوم.من خلال الاستفادة من طول القراءة، فإن دراسة الميتاجينوم المستندة إلى Nanopore قادرة على تحقيق تجميع أكثر استمرارًا مقارنةً بعلم الميتاجينوم الخاص بالبندقية.لقد تم نشر أن الميتاجينوميات المعتمدة على النانوبور نجحت في توليد جينومات بكتيرية كاملة ومغلقة من الميكروبات (Moss, EL, et. al,الطبيعة الحيوية، 2020)
منصة:نانوبور بروميثيون P48
-
تسلسل ثنائي كبريتات الجينوم الكامل
مثيلة الحمض النووي في المركز الخامس في السيتوزين (5-mC) لها تأثير أساسي على التعبير الجيني والنشاط الخلوي.ارتبطت أنماط المثيلة غير الطبيعية بالعديد من الحالات والأمراض، مثل السرطان.أصبح WGBS المعيار الذهبي لدراسة المثيلة على مستوى الجينوم بدقة أساسية واحدة.
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
مقايسة للكروماتين الذي يمكن الوصول إليه مع تسلسل الإنتاجية العالية (ATAC-seq)
ATAC-seq هي طريقة تسلسل عالية الإنتاجية لتحليل إمكانية الوصول إلى الكروماتين على مستوى الجينوم، وهو أمر مهم للتحكم اللاجيني العالمي في التعبير الجيني.يتم إدخال محولات التسلسل في مناطق الكروماتين المفتوحة بواسطة ناقل Tn5 المفرط النشاط.بعد تضخيم PCR، يتم إنشاء مكتبة التسلسل.يمكن الحصول على جميع مناطق الكروماتين المفتوحة في ظل ظروف زمنية محددة، ولا تقتصر فقط على مواقع الربط لعامل النسخ، أو منطقة معينة معدلة بالهيستون.
-
16S/18S/ITS تسلسل Amplicon-PacBio
الوحدة الفرعية الموجودة في 16S و18S rRNA التي تحتوي على مناطق شديدة الحفظ ومتغيرة للغاية هي بصمة جزيئية مثالية لتحديد الكائنات بدائية النواة وحقيقية النواة.من خلال الاستفادة من التسلسل، يمكن استهداف هذه الأمبليكونات بناءً على الأجزاء المحفوظة ويمكن وصف المناطق شديدة التغير بشكل كامل لتحديد هوية الميكروبات مما يساهم في الدراسات التي تغطي تحليل التنوع الميكروبي، والتصنيف، والتطور، وما إلى ذلك. ) تسلسل منصة PacBio يتيح الحصول على قراءات طويلة دقيقة للغاية، والتي يمكن أن تغطي amplicons كاملة الطول (حوالي 1.5 كيلو بايت).إن الرؤية الواسعة للمجال الوراثي عززت إلى حد كبير الدقة في شرح الأنواع في مجتمع البكتيريا أو الفطريات.
منصة:باكبيو تتمة الثاني
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
يهدف تسلسل amplicon 16S/18S/ITS إلى الكشف عن السلالة والتصنيف ووفرة الأنواع في مجتمع ميكروبي من خلال فحص منتجات PCR للعلامات الجينية للتدبير المنزلي التي تحتوي على أجزاء شديدة التباين ومتغيرة للغاية.إن إدخال هذه البصمات الجزيئية المثالية بواسطة Woeses et al (1977) يمكّن من تحديد ملامح الميكروبيوم الخالي من العزلة.تسلسل 16S (البكتيريا)، 18S (الفطريات) والفاصل الداخلي المكتوب (ITS، الفطريات) يسمح بتحديد كل من الأنواع الوفيرة وكذلك الأنواع النادرة وغير المحددة.أصبحت هذه التكنولوجيا أداة رئيسية مطبقة على نطاق واسع في تحديد التركيب الميكروبي التفاضلي في بيئات مختلفة، مثل الفم البشري والأمعاء والبراز، وما إلى ذلك.
منصة:منصة إلومينا نوفا سيك
-
إعادة تسلسل الجينوم البكتيري والفطري الكامل
تعد إعادة تسلسل الجينوم البكتيري والفطري بأكمله أداة حاسمة لاستكمال جينومات البكتيريا والفطريات المعروفة، وكذلك لمقارنة الجينومات المتعددة أو رسم خريطة جينومات الكائنات الحية الجديدة.من الأهمية بمكان إجراء تسلسل جينومات كاملة من البكتيريا والفطريات من أجل توليد جينومات مرجعية دقيقة، وللقيام بتحديد الميكروبات ودراسات الجينوم المقارنة الأخرى.
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
PacBio-كامل الطول 16S/18S/ITS تسلسل Amplicon
تم تطوير منصة Amplicon (16S/18S/ITS) بسنوات من الخبرة في تحليل مشاريع التنوع الميكروبي، والتي تحتوي على تحليل أساسي موحد وتحليل شخصي: يغطي التحليل الأساسي محتوى التحليل السائد للأبحاث الميكروبية الحالية، ومحتوى التحليل غني وشامل، ويتم عرض نتائج التحليل في شكل تقارير المشروع؛محتوى التحليل الشخصي متنوع.يمكن اختيار العينات ويمكن ضبط المعلمات بمرونة وفقًا لتقرير التحليل الأساسي والغرض البحثي، لتحقيق المتطلبات الشخصية.نظام التشغيل ويندوز، بسيط وسريع.
-
نسخة كاملة الطول من PacBio (غير مرجعية)
باستخدام بيانات التسلسل Isoform الخاصة بشركة Pacific Biosciences (PacBio) كمدخلات، فإن هذا التطبيق قادر على تحديد تسلسلات النص كاملة الطول (بدون تجميع).من خلال تعيين تسلسلات كاملة الطول مقابل الجينوم المرجعي، يمكن تحسين النصوص بواسطة الجينات المعروفة، والنصوص، ومناطق الترميز، وما إلى ذلك. وفي هذه الحالة، يمكن تحقيق تحديد أكثر دقة لهياكل الرنا المرسال، مثل الربط البديل، وما إلى ذلك.يتيح التحليل المشترك مع بيانات تسلسل نسخة NGS شرحًا أكثر شمولاً وتقديرًا أكثر دقة في التعبير على مستوى النص، مما يفيد إلى حد كبير التعبير التفاضلي النهائي والتحليل الوظيفي.
-
انخفاض التمثيل تسلسل ثنائي الكبريتيت (RRBS)
لقد كانت أبحاث مثيلة الحمض النووي دائمًا موضوعًا ساخنًا في أبحاث الأمراض، وترتبط ارتباطًا وثيقًا بالتعبير الجيني والصفات الظاهرية.RRBS هي طريقة دقيقة وفعالة واقتصادية لأبحاث مثيلة الحمض النووي.يوفر إثراء مناطق المروج وجزيرة CpG عن طريق الانقسام الأنزيمي (Msp I)، جنبًا إلى جنب مع تسلسل بيسلفيت، اكتشافًا عالي الدقة لمثيلة الحمض النووي.
المنصة: منصة Illumina NovaSeq
-
تسلسل مرنا بدائية النواة
يُمكّن تسلسل mRNA من التنميط الشامل لجميع نصوص mRNA داخل الخلايا في ظل ظروف محددة.تعمل هذه التكنولوجيا المتطورة كأداة فعالة، حيث تكشف عن ملفات التعبير الجيني المعقدة، والهياكل الجينية، والآليات الجزيئية المرتبطة بالعمليات البيولوجية المتنوعة.تم اعتماد تسلسل mRNA على نطاق واسع في الأبحاث الأساسية والتشخيص السريري وتطوير الأدوية، ويقدم نظرة ثاقبة لتعقيدات الديناميكيات الخلوية والتنظيم الجيني.تم تصميم معالجة عينات الرنا المرسال بدائية النواة الخاصة بنا خصيصًا للنسخ بدائية النواة، بما في ذلك استنفاد الرنا الريباسي وإعداد المكتبة الاتجاهية.
المنصة: Illumina NovaSeq X
