BMKCloud Log in
条形banner-03

منتجات

تسلسل الأجزاء المضخم للموقع المحدد (SLAF-Seq)

يعد التنميط الجيني عالي الإنتاجية، خاصة على نطاق واسع من السكان، خطوة أساسية في دراسات الارتباط الجيني، والتي توفر الأساس الجيني لاكتشاف الجينات الوظيفية، والتحليل التطوري، وما إلى ذلك. بدلاً من إعادة تسلسل الجينوم الكامل العميق، يتم تقليل تسلسل الجينوم التمثيلي (RRGS) ) تم تقديمه لتقليل تكلفة التسلسل لكل عينة، مع الحفاظ على كفاءة معقولة في اكتشاف العلامات الجينية.يتم تحقيق ذلك عادة عن طريق استخراج جزء التقييد ضمن نطاق حجم معين، والذي يسمى مكتبة التمثيل المخفض (RRL).يعد تسلسل الأجزاء المضخم للمكان المحدد (SLAF-Seq) استراتيجية مطورة ذاتيًا للتنميط الجيني SNP مع أو بدون جينوم مرجعي.
المنصة: منصة Illumina NovaSeq


تفاصيل الخدمة

النتائج التجريبية

منشورات مميزة

تفاصيل الخدمة

المخطط الفني

111

تدفق العمل

流程图

مزايا الخدمة

كفاءة عالية في اكتشاف العلامات- تساعد تقنية التسلسل عالي الإنتاجية SLAF-Seq في اكتشاف مئات الآلاف من العلامات داخل الجينوم بأكمله.

انخفاض الاعتماد على الجينوم- يمكن تطبيقه على الأنواع إما مع أو بدون الجينوم المرجعي.

تصميم مخطط مرن- هضم إنزيم واحد، وثنائي إنزيم، ومتعدد الإنزيمات وأنواع مختلفة من الإنزيمات، يمكن اختيارها جميعًا لتلبية أهداف أو أنواع بحثية مختلفة.يتم استخدام التقييم المسبق في السيليكو لضمان تصميم الإنزيم الأمثل.

كفاءة الهضم الأنزيمي- تم إجراء التجربة المسبقة لتحسين الظروف، مما يجعل التجربة الرسمية مستقرة وموثوقة.يمكن أن تصل كفاءة جمع الأجزاء إلى أكثر من 95%.

علامات SLAF موزعة بالتساوي- يتم توزيع علامات SLAF بالتساوي في جميع الكروموسومات إلى أقصى حد، حيث يصل متوسطها إلى 1 SLAF لكل 4 كيلو بايت.

التجنب الفعال للتكرار- يتم تقليل التسلسل التكراري في بيانات SLAF-Seq إلى أقل من 5%، خاصة في الأنواع ذات المستوى العالي من التكرارات، مثل القمح والذرة وغيرها.

خبرة واسعة- أكثر من 2000 مشروع مغلق لـ SLAF-Seq على مئات الأنواع التي تغطي النباتات والثدييات والطيور والحشرات والكائنات المائية وغيرها.

سير عمل المعلوماتية الحيوية المطور ذاتيًا- تم تطوير سير عمل المعلومات الحيوية المتكامل لـ SLAF-Seq بواسطة BMKGENE لضمان موثوقية ودقة المخرجات النهائية.

 

مواصفات الخدمة

 

منصة

Conc. (نانوغرام / جل)

المجموع (ug)

أود260/280

إلومينا نوفا سيك

>35

>1.6(المجلد> 15μl)

1.6-2.5

ملاحظة: سيتم إجراء ثلاث عينات، لكل منها ثلاثة مخططات إنزيم، للتجربة المسبقة.

استراتيجية التسلسل الموصى بها

عمق التسلسل: 10X/علامة

حجم الجينوم

علامات SLAF الموصى بها

<500 ميجابايت

100 ألف أو WGS

500 ميجا بايت - 1 جيجا بايت

100 ك

1 جيجا -2 جيجا

200 ك

الجينومات العملاقة أو المعقدة

300 - 400 ألف

 

التطبيقات

 

مُستَحسَن

مقياس السكان

 

استراتيجية التسلسل والعمق

 

عمق

 

رقم العلامة

 

جواس

 

رقم العينة ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

وفق

حجم الجينوم

 

التطور الجيني

 

الأفراد من كل

المجموعة الفرعية ≥ 10؛

مجموع العينات ≥ 30

 

10X

 

أوصى تسليم العينة

الحاوية: أنبوب طرد مركزي سعة 2 مل

بالنسبة لمعظم العينات، نوصي بعدم حفظها في الإيثانول.

وضع العلامات على العينات: يجب أن يتم تصنيف العينات بوضوح وأن تكون مطابقة لنموذج معلومات العينة المقدم.

الشحنة: الثلج الجاف: يجب تعبئة العينات في أكياس أولاً ودفنها في الثلج الجاف.

سير عمل الخدمة

عينة لمراقبة الجودة
تجربة تجريبية
تجربة SLAF
إعداد المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع

عينة لمراقبة الجودة

تجربة تجريبية

تجربة SLAF

إعداد المكتبة

التسلسل

تحليل البيانات

خدمات ما بعد البيع


  • سابق:
  • التالي:

  • 1. إحصائيات نتيجة الخريطة

    image1

    أ1

    2. تطوير علامة SLAF

    أ2

    3. شرح الاختلاف

    أ3

    سنة

    مجلة

    IF

    عنوان

    التطبيقات

    2022

    اتصالات الطبيعة

    17.694

    الأساس الجينومي لكروموسومات جيجا وجينوم جيجا لشجرة الفاوانيا

    بايونيا أوستي

    سلاف-جواس

    2015

    عالم النبات الجديد

    7.433

    آثار أقدام التدجين ترسخ المناطق الجينومية ذات الأهمية الزراعية فيها

    فول الصويا

    سلاف-جواس

    2022

    مجلة البحوث المتقدمة

    12.822

    الإدخالات الاصطناعية على نطاق الجينوم لـ Gossypium barbadense في G. hirsutum

    الكشف عن مواضع متفوقة للتحسين المتزامن لجودة ألياف القطن وإنتاجيتها

    سمات

    SLAF-علم الوراثة التطوري

    2019

    النبات الجزيئي

    10.81

    يكشف تحليل الجينوم السكاني وجمعية دي نوفو عن أصل الأعشاب الضارة

    الأرز كلعبة تطورية

    SLAF-علم الوراثة التطوري

    2019

    علم الوراثة الطبيعة

    31.616

    التسلسل الجينومي والتنوع الجيني لسمك الكارب الشائع Cyprinus carpio

    خريطة الارتباط SLAF

    2014

    علم الوراثة الطبيعة

    25.455

    يوفر جينوم الفول السوداني المزروع نظرة ثاقبة للأنماط النووية للبقوليات، متعددة الصيغة الصبغية

    التطور وتدجين المحاصيل.

    خريطة الارتباط SLAF

    2022

    مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية

    9.803

    يكشف تحديد ST1 عن اختيار يتضمن التنقل في مورفولوجيا البذور

    ومحتوى الزيت أثناء تدجين فول الصويا

    تطوير SLAF-ماركر

    2022

    المجلة الدولية للعلوم الجزيئية

    6.208

    تحديد وتطوير علامة الحمض النووي لـ Wheat-Leymus mollis 2Ns (2D)

    استبدال الكروموسوم الثنائي

    تطوير SLAF-ماركر

    إقتبس

    اكتب رسالتك هنا وأرسلها لنا

    أرسل رسالتك إلينا: