-
PacBio-Tam uzunluqlu Transkriptom (Qeyri-istinad)
Amplicon (16S/18S/ITS) platforması mikrob müxtəlifliyi layihəsinin təhlili sahəsində uzun illər təcrübəsi ilə işlənib hazırlanmışdır ki, burada standartlaşdırılmış əsas analiz və fərdiləşdirilmiş analizlər var: əsas analiz cari mikrob tədqiqatının əsas təhlili məzmununu əhatə edir, təhlilin məzmunu zəngin və əhatəlidir, və təhlil nəticələri layihə hesabatları şəklində təqdim olunur;Fərdi təhlilin məzmunu müxtəlifdir.Fərdi tələbləri həyata keçirmək üçün nümunələr seçilə bilər və parametrlər əsas təhlil hesabatına və tədqiqat məqsədinə uyğun olaraq çevik şəkildə təyin edilə bilər.Windows əməliyyat sistemi, sadə və sürətli.
-
PacBio-Tam uzunluqlu Transkriptom (Qeyri-istinad)
Daxiletmə kimi Pacific Biosciences (PacBio) İzoform ardıcıllığı məlumatlarını götürərək, bu Tətbiq tam uzunluqlu transkript ardıcıllığını (montaj olmadan) müəyyən edə bilir.İstinad genomuna qarşı tam uzunluqlu ardıcıllıqların xəritəsini çəkməklə, transkriptləri məlum genlər, transkriptlər, kodlaşdırma bölgələri və s. ilə optimallaşdırmaq olar. Bu halda mRNT strukturlarının, məsələn, alternativ splaysinq və s. daha dəqiq müəyyənləşdirilməsinə nail olmaq olar.NGS transkriptom ardıcıllığı məlumatları ilə birgə təhlil transkript səviyyəsində ifadədə daha əhatəli annotasiyaya və daha dəqiq kəmiyyətləşdirməyə imkan verir ki, bu da əsasən aşağı axın diferensial ifadə və funksional analizdən faydalanır.
-
Alət dəstləri
BMKCloud, tibb, kənd təsərrüfatı, ətraf mühit və s. o cümlədən müxtəlif sahələrdə tədqiqatçılar tərəfindən geniş etibar edilən genomik proqramlar üçün bir pəncərə həllini təmin edən aparıcı bioinformatik platformadır. BMKCloud bioinformatik analiz platformaları və alətləri də daxil olmaqla inteqrasiya olunmuş, etibarlı və səmərəli xidmətlər təqdim etməyə sadiqdir. , hesablama resursları, ictimai verilənlər bazası, bioinformatik onlayn kurslar və s. BMKCloud-da gen annotasiyası, təkamüllü genetik alətlər, ncRNA, məlumatların keyfiyyətinə nəzarət, montaj, uyğunlaşdırma, məlumatların çıxarılması, mutasiyalar, statistika, rəqəm generatoru, ardıcıllıq daxil olmaqla, tez-tez istifadə olunan müxtəlif bioinformatik alətlər var. təhlili və s.
-
kiçik RNT
Kiçik RNT-lər miRNA, siRNA və piRNA daxil olmaqla orta uzunluğu 18-30 nt olan qısa kodlaşdırmayan RNT növüdür.Bu kiçik RNT-lərin mRNT-nin deqradasiyası, tərcümənin inhibəsi, heterokromatinin əmələ gəlməsi və s. kimi müxtəlif bioloji proseslərdə iştirak etdiyi kütləvi şəkildə bildirilmişdir. SmallRNT ardıcıllığının təhlili heyvan/bitki inkişafı, xəstəlik, virus və s. tədqiqatlarda geniş şəkildə tətbiq edilmişdir. Kiçik RNT ardıcıllıq təhlili platforması standart analiz və qabaqcıl məlumatların əldə edilməsindən ibarətdir.RNT seq məlumatları əsasında standart analiz miRNA identifikasiyası və proqnozlaşdırılması, miRNA hədəf geninin proqnozlaşdırılması, annotasiya və ifadə analizinə nail ola bilər.Qabaqcıl analiz fərdiləşdirilmiş miRNA axtarışı və çıxarılmasına, Venn diaqramının yaradılmasına, miRNA və hədəf gen şəbəkəsinin qurulmasına imkan verir.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS Biomarker Technologies-də zəngin təcrübə əsasında hazırlanmış bütöv bir genomun təkrar ardıcıllığının təhlili platformasıdır.İstifadəsi asan olan bu platforma həm Illumina platformasından, həm də BGI sıralama platformasından yaradılan DNT ardıcıllığı məlumatlarına uyğun gələn bir neçə əsas parametr təyin etməklə inteqrasiya olunmuş analiz iş axınının tez təqdim edilməsinə imkan verir.Bu platforma yüksək performanslı hesablama serverində yerləşdirilib ki, bu da çox məhdud vaxtda yüksək səmərəli məlumatların təhlilinə imkan verir.Fərdi məlumatların əldə edilməsi standart analiz əsasında mövcuddur, o cümlədən mutasiya edilmiş gen sorğusu, PCR primer dizaynı və s.
-
mRNT(İstinad)
Transkriptom genomik genetik məlumat ilə bioloji funksiyanın proteomu arasında əlaqədir.Transkripsiya səviyyəsinin tənzimlənməsi orqanizmlərin ən vacib və ən çox öyrənilən tənzimləmə üsuludur.Transkriptomun ardıcıllığı tək bir nukleotidə dəqiqliklə dəqiqliklə transkriptomu istənilən anda və ya istənilən şəraitdə ardıcıllıqla sıralaya bilər. O, gen transkripsiyasının səviyyəsini dinamik şəkildə əks etdirə, eyni zamanda nadir və normal transkriptləri müəyyən edib kəmiyyətini müəyyən edə, həmçinin transkriptomun struktur məlumatını təmin edə bilər. xüsusi transkript nümunələri.
Hal-hazırda transkriptom ardıcıllığı texnologiyası heyvan və bitki inkişafının tənzimlənməsi, ətraf mühitə uyğunlaşma, immun qarşılıqlı əlaqə, genlərin lokalizasiyası, növlərin genetik təkamülü və şiş və genetik xəstəliklərin aşkarlanması daxil olmaqla, aqronomiya, tibb və digər tədqiqat sahələrində geniş istifadə olunur.
-
Metagenomika (NGS)
Bu analiz platforması illərin təcrübəsi əsasında ov tüfəngi metagenomik məlumatların təhlili üçün nəzərdə tutulmuşdur.O, verilənlərin emalı, növ səviyyəli tədqiqatlar, gen funksiyası səviyyəsində tədqiqatlar, metagenomların yığılması və s. daxil olmaqla, müxtəlif tez-tez tələb olunan metagenomik təhlilləri ehtiva edən inteqrasiya olunmuş iş axınından ibarətdir. Bundan əlavə, gen və növ sorğusu da daxil olmaqla, standart analiz iş prosesində fərdi məlumatların öyrənilməsi alətləri mövcuddur. , parametr təyini, fərdiləşdirilmiş rəqəm yaratmaq və s.
-
LncRNA
Uzun kodlaşdırmayan RNT (lncRNA) zülalları kodlaya bilməyən, uzunluğu 200 nt-dən çox olan transkript növüdür.Yığımlı sübutlar göstərir ki, lncRNA-ların çoxu funksionaldır.Yüksək məhsuldarlıqlı sekvensiya texnologiyaları və bioinformatik analiz alətləri bizə lncRNA ardıcıllıqlarını və yerləşdirmə məlumatlarını daha səmərəli aşkar etməyə imkan verir və mühüm tənzimləyici funksiyaları olan lncRNA-ları kəşf etməyə kömək edir.BMKCloud müştərilərimizə sürətli, etibarlı və çevik lncRNA analizinə nail olmaq üçün lncRNA sıralama analizi platformasını təqdim etməkdən qürur duyur.
-
GWAS
Genom-geniş assosiasiya tədqiqatı (GWAS) spesifik əlamətlərlə (fenotip) əlaqəli olan genetik variantları (genotip) müəyyən etmək məqsədi daşıyır.GWA tədqiqatları çoxlu sayda fərdlərin bütün genomunu keçən genetik markerləri araşdırır və populyasiya səviyyəsində statistik təhlillə genotip-fenotip birləşmələrini proqnozlaşdırır.Bütün genomun təkrar sıralanması potensial olaraq bütün genetik variantları aşkar edə bilər.Fenotipik məlumatlarla birləşdirilərək, GWAS müasir heyvan/bitki yetişdirilməsini güclü şəkildə dəstəkləyən fenotiplə əlaqəli SNP-ləri, QTL-ləri və namizəd genləri müəyyən etmək üçün işlənə bilər.SLAF, genom üzrə paylanmış markerləri, SNP-ni aşkar edən, özü tərəfindən hazırlanmış sadələşdirilmiş genom ardıcıllığı strategiyasıdır.Bu SNP-lər, molekulyar genetik markerlər kimi, hədəflənmiş əlamətlərlə assosiasiya tədqiqatları üçün işlənə bilər.Mürəkkəb əlamətlərin əlaqəli genetik variasiyaları müəyyən etmək üçün səmərəli strategiyadır.
-
Nanopore Tammetrajlı transkriptomikası
Orqanizmlərdə mürəkkəb və dəyişkən alternativ izoformalar gen ifadəsini və zülal müxtəlifliyini tənzimləyən mühüm genetik mexanizmlərdir.Transkript strukturlarının dəqiq müəyyən edilməsi gen ifadəsinin tənzimlənməsi nümunələrinin dərindən öyrənilməsi üçün əsasdır.Nanopore sequencing platforması transkriptomik tədqiqatı uğurla izoform səviyyəsinə çatdırdı.Bu analiz platforması həm gen səviyyəsində, həm də transkript səviyyəsində keyfiyyət və kəmiyyət analizlərinə nail olan istinad genomu əsasında Nanopore platformasında yaradılmış RNT-Seq məlumatlarını təhlil etmək üçün nəzərdə tutulmuşdur.
