BMKCloud Log in
条形banner-03

Məhsullar

DNT/RNT Sequencing – Nanopore Sequencer

ONT ardıcıllığı nanoməsamələrə əsaslanan real vaxt rejimində tək molekullu elektrik siqnal ardıcıllığı texnologiyasıdır, hər platformanın ardıcıllıq prinsipi eynidir.İkiqat zəncirli DNT/RNT biofilmdə yerləşdirilmiş nanoməsaməli zülala bağlanacaq və motor zülalının rəhbərliyi altında açılacaq, biofilmin hər iki tərəfindəki gərginlik fərqinin təsiri altında DNT/RNT zəncirləri nanoporöz kanal zülalından müəyyən bir sürətlə keçir. dərəcəsi.DNT/RNT zəncirindəki müxtəlif əsasların kimyəvi xassələrinin fərqliliyinə görə tək əsas və ya DNT molekulu nanopor kanalından keçdikdə müxtəlif elektrik siqnallarının dəyişməsinə səbəb olacaq.Bu siqnalları aşkarlamaq və onlara uyğunlaşdırmaqla müvafiq baza növləri hesablana bilər və ardıcıllığın real vaxtda aşkarlanması tamamlana bilər.


Xidmət Təfərrüatları

Demo Nəticə

Xidmət Təfərrüatları Xüsusiyyətləri

Platforma

Kitabxana ölçüsü

Nəzəri Məlumat Verimi (Hüceyrə Başına)

Tək əsaslı Dəqiqlik

Tətbiqlər

Nanopor

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/hüceyrə

85-92%

SV çağırışı, De novo, Tam uzunluqlu ardıcıllıq, Iso-Seq, Gen annotasiyası, DNT metilasiyasının aşkarlanması

Xidmət Üstünlükləri

● Müxtəlif növlərlə minlərlə qapalı layihə ilə PacBio sıralama platformasında 5 ildən artıq təcrübə.
● BMKGENE ikili platformalı RNT/DNT sertifikatına malik Oxford Nanopore şirkətinin rəsmi tərəfdaşıdır.
● Tam avadanlığa və kifayət qədər ardıcıllıq ötürmə qabiliyyətinə malik sekvenerlərin əsas modelləri mövcuddur.
● Nanopore platformasına əsaslanaraq, 10-dan çox heyvan və bitki Denovo tədqiqatı beynəlxalq tanınmış jurnallarda dərc edilmişdir.

Nümunə tələbləri


Nümunə növü

Məbləğ

Konsentrasiya(Qubit ®)

Həcmi

Saflıq

Digərləri

Genomik DNT

Data Tələbindən asılıdır

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

260 nm-də təmiz zirvə, çirklənmə yoxdur

Konsentrasiya Qubit və Qubit/Nanopore ≤ 2 ilə ölçülməlidir

Ümumi RNT

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5;çirklənmə yoxdur

RIN dəyəri ≥7,5

 

Xidmət iş axını

nümunənin hazırlanması

Nümunə hazırlığı

Kitabxana Hazırlığı

Kitabxana tikintisi

Sıralama

Sıralama

Məlumatların təhlili

Məlumatların təhlili

Nümunə QC

Layihənin çatdırılması


  • Əvvəlki:
  • Sonrakı:

  • DNT Nümunəsinin Məlumat Keyfiyyətinin Qiymətləndirilməsi

    Cədvəl 1. Təmiz məlumatların statistikası.

    BMKID

    xamSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    cleanN50Len

    cleanN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    RNT Nümunəsinin Məlumat Keyfiyyətinin Qiymətləndirilməsi

    Cədvəl 1. Təmiz məlumatların statistikası.

    Fayl adı

    ClientID

    OxuNum

    BazaNum

    N50

    Orta Uzunluq

    Maksimum Uzunluq

    Orta QScore

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Şəkil 1. Uzunluq paylanmasını oxuyun

    A3

    Şəkil 2. Təmiz verilənlərin keyfiyyət xalının paylanması

    A4

    Şəkil 3. Təmiz verilənlərin uzunluq və keyfiyyət xallarının paylanması

    A5

    sitat almaq

    Mesajınızı buraya yazın və bizə göndərin

    Mesajınızı bizə göndərin: