Eukaryotik mRNT ardıcıllığı-Illumina
Üstünlüklər
ØYüksək Təcrübəli: BMK-da hüceyrə mədəniyyəti, toxuma, bədən mayesi və s. daxil olmaqla müxtəlif nümunə növlərini əhatə edən 200.000-dən çox nümunə işlənmiş və müxtəlif tədqiqat sahələrini əhatə edən 7.000-dən çox mRNA-Seq layihəsi bağlanmışdır.
ØCiddi keyfiyyətə nəzarət sistemi: Nümunələrin hazırlanması, kitabxananın hazırlanması, ardıcıllıq və bioinformatika daxil olmaqla, bütün addımlar vasitəsilə əsas keyfiyyətə nəzarət nöqtələri yüksək keyfiyyətli nəticələr əldə etmək üçün yaxından nəzarət altındadır.
ØMüxtəlif tədqiqat məqsədlərini yerinə yetirmək üçün funksiya annotasiyası və zənginləşdirmə tədqiqatları üçün çoxlu verilənlər bazası mövcuddur.
ØSatışdan sonrakı xidmətlər: Layihənin təqibi, problemlərin aradan qaldırılması, suallar və cavablar və s.
Nümunə Tələbləri və Çatdırılma
| Kitabxana | Ardıcıllıq strategiyası | Məlumat tövsiyə olunur | Keyfiyyətə nəzarət |
| Poly A zənginləşdirilmişdir | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nümunə tələbləri:
Nukleotidlər:
| Saflıq | Dürüstlük | Məbləğ |
| OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Geldə zülal və ya DNT ilə çirklənmə məhduddur və ya yoxdur. | Bitkilər üçün: RIN≥6,5;Heyvanlar üçün: RIN≥7;28S/18S≥1,0;məhdud və ya baza hündürlüyü yoxdur | Kons.≥30 ng/μl;Həcm ≥ 10 μl;Cəmi ≥ 1,5 μg |
Toxuma: Çəki (quru):≥1 q
*5 mq-dan kiçik toxumalar üçün flaş dondurulmuş (maye azotda) toxuma nümunəsi göndərməyi tövsiyə edirik.
Hüceyrə suspenziyası:Hüceyrə sayı = 3×106- 1×107
*Biz dondurulmuş hüceyrə lizatını göndərməyi tövsiyə edirik.Hüceyrə sayı 5×105-dən kiçik olarsa, mikro ekstraksiya üçün üstünlük verilən maye azotda dondurulmuş flaş tövsiyə olunur.
Qan nümunələri:Həcmi≥1 ml
Mikroorqanizm:Kütləsi ≥ 1 g
Tövsiyə olunan Nümunə Çatdırılması
Konteyner: 2 ml sentrifuqa borusu (qalay folqa tövsiyə edilmir)
Nümunə etiketləmə: Qrup+təkrar məsələn, A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Göndərmə:
- Quru buz: Nümunələr çantalara yığılmalı və quru buzda basdırılmalıdır.
- RNT-stabil borular: RNT nümunələri RNT stabilizasiya borusunda (məsələn, RNAstable®) qurudula və otaq temperaturunda göndərilə bilər.
Xidmət İş Akışı
Təcrübə dizaynı
Nümunə çatdırılması
RNT çıxarılması
Kitabxana tikintisi
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satışdan sonrakı xidmətlər
Bioinformatika
Eukaryotik mRNA sıralama analizi iş axını
Bioinformatika
ØXam məlumatların keyfiyyətinə nəzarət
Øİstinad genomunun uyğunlaşdırılması
ØTranskript strukturunun təhlili
Øİfadə kəmiyyəti
ØDiferensial ifadə təhlili
ØFunksiya annotasiyası və zənginləşdirilməsi
1.mRNA Data Saturation əyrisi
2.Diferensial ifadə təhlili-Vulkan süjeti
3.DEG-lərdə KEGG annotasiyası
4.DEGs üzrə GO təsnifatı
