Tam Uzunluqlu mRNA Ardıcıllığı-Nanopore
Xüsusiyyətlər
● Poli-A mRNT-nin tutulması, ardınca kDNT sintezi və kitabxana hazırlanması
● Tammetrajlı transkriptlərin ardıcıllığı
● Referans genomuna uyğunlaşdırmaya əsaslanan bioinformatik analiz
● Bioinformatik analiz yalnız gen və izoform səviyyəsində ifadəni deyil, həm də lncRNT, gen birləşmələri, poliadenilləşmə və gen strukturunun təhlilini əhatə edir.
Xidmət Üstünlükləri
●İzoform səviyyəsində ifadənin kəmiyyətləndirilməsi: ətraflı və dəqiq ifadə təhlilini təmin edir, bütün gen ifadəsini təhlil edərkən gizlədilə bilən dəyişiklikləri aşkar edir
●Azaldılmış Məlumat Tələbləri:Növbəti Nəsil Ardıcıllıqla (NGS) müqayisədə Nanopore ardıcıllığı daha aşağı məlumat tələbləri nümayiş etdirir və daha kiçik məlumatlarla ekvivalent səviyyələrdə gen ifadəsinin kəmiyyət doymasını təmin edir.
●İfadə miqdarının daha yüksək dəqiqliyihəm gen, həm də izoform səviyyəsində
●Əlavə transkriptomik məlumatların müəyyən edilməsialternativ poliadenilləşmə, füzyon genləri və lcnRNT və onların hədəf genləri
●Geniş EkspertizaKomandamız 850-dən çox Nanopore tammetrajlı transkriptom layihəsini tamamlamış və 8000-dən çox nümunəni emal etmiş, hər layihəyə zəngin təcrübə gətirir.
●Satış Sonrası Dəstək: öhdəliyimiz layihənin tamamlanmasından kənara çıxır və 3 aylıq satış sonrası xidmət müddəti təklif edirik. Bu müddət ərzində nəticələrlə bağlı hər hansı bir sualı cavablandırmaq üçün layihənin izlənilməsi, problemlərin aradan qaldırılmasına kömək və sual-cavab sessiyaları təklif edirik.
Nümunə Tələbləri və Çatdırılma
| Kitabxana | Ardıcıllıq strategiyası | Tövsiyə olunan məlumatlar | Keyfiyyətə Nəzarət |
| Poli A ilə zənginləşdirilmiş | Nanopore PromethION 48 | 6/12 Gb | Orta keyfiyyət balı: Q10 |
Nümunə Tələbləri:
Nukleotidlər:
| Konsentrasiya (ng/μl) | Miqdar (μg) | Saflıq | Dürüstlük |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Gel üzərində məhdud və ya heç bir protein və ya DNT çirklənməsi göstərilməyib. | Bitkilər üçün: RIN≥7.0; Heyvanlar üçün: RIN≥7.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; məhdud və ya heç bir baza yüksəlişi yoxdur |
● Bitkilər:
Kök, gövdə və ya ləçək: 450 mq
Yarpaq və ya toxum: 300 mq
Meyvə: 1,2 q
● Heyvan:
Ürək və ya Bağırsaq: 300 mq
Daxili orqanlar və ya beyin: 240 mq
Əzələ: 450 mq
Sümüklər, Saç və ya Dəri: 1 q
● Buğumayaqlılar:
Həşəratlar: 6 q
Xərçəngkimilər: 300 mq
● Tam qan: 1 boru
● Hüceyrələr: 106 hüceyrələr
Tövsiyə olunan Nümunə Çatdırılması
Qab: 2 ml santrifüj borusu (Qalay folqa tövsiyə edilmir)
Nümunə etiketləmə: Qrup+replikasiya, məs. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Göndərmə:
1. Quru buz: Nümunələr torbalara yığılmalı və quru buzda basdırılmalıdır.
2. RNT-stabil borular: RNT nümunələri RNT stabilizasiya borusunda (məsələn, RNT-stabil®) qurudulub otaq temperaturunda göndərilə bilər.
Xidmət İş Axını
Nukleotidlər:
Nümunə çatdırılması
Kitabxana tikintisi
Ardıcıllıq
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Xidmət İş Axını
Toxuma:
Təcrübə dizaynı
Nümunə çatdırılması
RNT ekstraksiyası
Kitabxana tikintisi
Ardıcıllıq
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
● Xam məlumatların emalı
● Transkript identifikasiyası
● Alternativ splaysinq
● Gen səviyyəsində və izoform səviyyəsində ifadə miqdarının müəyyən edilməsi
● Diferensial ifadə təhlili
● Funksiya annotasiyası və zənginləşdirilməsi (DEG və DET)
Alternativ splaysinq təhlili
Alternativ Poliadenilləşmə Təhlili (APA)
lncRNA proqnozu
Yeni genlərin annotasiyası
DET-lərin klasterləşdirilməsi
DEG-lərdə Zülal-Zülal Şəbəkələri
BMKGene-nin Nanopore tammetrajlı mRNA ardıcıllıq xidmətləri tərəfindən təmin edilən irəliləyişləri seçilmiş nəşrlər kolleksiyası vasitəsilə araşdırın.
Gong, B. və b. (2023) 'Qliomada onkogen kimi sekretor kinaz FAM20C-nin epigenetik və transkripsiya aktivləşməsi', Genetika və Genomika Jurnalı, 50(6), səh. 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
He, Z. və b. (2023) 'IFN-γ-yə cavab verən limfositlərin tam uzunluqlu transkriptom ardıcıllığı, kambala balığında (Paralichthys olivaceus) Th1-əyri immun cavabını ortaya qoyur', Fish & Mollyfish Immunology, 134, s. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
Ma, Y. və b. (2023) 'Nemopilema Nomurai zəhərinin identifikasiyası üçün PacBio və ONT RNT ardıcıllıq metodlarının müqayisəli təhlili', Genomics, 115(6), səh. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
Yu, D. və b. (2023) 'Nano-seq analizi hUMSC-dən əldə edilən ekzosomlar və mikroveziküllər arasında fərqli funksional meyl aşkar edir', Kök Hüceyrə Tədqiqatı və Terapiyası, 14(1), səh. 1–13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.
