-
Bitki/Heyvan De novo Genom ardıcıllığı
De novosekvensiya, istinad genomu olmadıqda, ardıcıllaşdırma texnologiyalarından, məsələn, PacBio, Nanopore, NGS və s. istifadə edərək növün bütün genomunun qurulmasına aiddir.Üçüncü nəsil sekvensiya texnologiyalarının oxunma uzunluğunda nəzərəçarpacaq təkmilləşmə yüksək heterozigotluq, təkrarlanan bölgələrin yüksək nisbəti, poliploidlər və s. kimi mürəkkəb genomların yığılmasında yeni imkanlar gətirdi. Onlarla kilobaza səviyyəsində oxunma uzunluğu ilə bu ardıcıllıq oxunuşları təkrarlanan elementlərin, anormal GC məzmunu olan bölgələrin və digər yüksək mürəkkəb bölgələrin həlli.
Platforma: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
-
Hi-C əsaslı Genom Assambleyası
Hi-C, yaxınlığa əsaslanan qarşılıqlı əlaqə və yüksək məhsuldarlıq ardıcıllığını birləşdirərək xromosom konfiqurasiyasını tutmaq üçün nəzərdə tutulmuş bir üsuldur.Bu qarşılıqlı təsirlərin intensivliyinin xromosomlardakı fiziki məsafə ilə mənfi əlaqəli olduğuna inanılır.Buna görə də, Hi-C məlumatları qaralama genomda yığılmış ardıcıllıqların qruplaşdırılmasına, sıralanmasına və istiqamətləndirilməsinə və onların müəyyən sayda xromosomlara bağlanmasına rəhbərlik edə bilər.Bu texnologiya populyasiyaya əsaslanan genetik xəritə olmadığı halda xromosom səviyyəli genom birləşməsini gücləndirir.Hər bir genom üçün Hi-C lazımdır.
Platforma: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Təkamül Genetikası
Təkamül genetikası, SNP, InDels, SV-lər və CNV-lər daxil olmaqla, genetik variasiyalara əsaslanan verilmiş materialların təkamül məlumatının hərtərəfli şərhini təmin etmək üçün nəzərdə tutulmuş paketli ardıcıllıq xidmətidir.O, populyasiya strukturu, genetik müxtəliflik, filogeniya əlaqələri və s. kimi təkamül dəyişikliklərini və populyasiyaların genetik xüsusiyyətlərini təsvir etmək üçün tələb olunan bütün fundamental analizləri təqdim edir. O, həmçinin populyasiyanın effektiv ölçüsünü, divergensiya vaxtını qiymətləndirməyə imkan verən gen axını ilə bağlı tədqiqatları ehtiva edir.
-
Müqayisəli Genomika
Müqayisəli genomika sözün əsl mənasında müxtəlif növlərin tam genom ardıcıllıqlarını və strukturlarını müqayisə etmək deməkdir.Bu intizam müxtəlif növlər arasında qorunub saxlanılan və ya fərqlənən ardıcıl strukturları və elementləri müəyyən etməklə növlərin təkamülünü, gen funksiyasını, gen tənzimləmə mexanizmini genom səviyyəsində aşkar etmək məqsədi daşıyır.Tipik müqayisəli genomika tədqiqatına gen ailəsi, təkamül inkişafı, bütün genomun duplikasiyası, selektiv təzyiq və s. analizlər daxildir.
-
Toplu Segregant analizi
Toplu seqreqant analizi (BSA) fenotiplə əlaqəli genetik markerləri tez bir zamanda müəyyən etmək üçün istifadə edilən bir texnikadır.BSA-nın əsas iş axını son dərəcə zidd fenotipləri olan iki fərd qrupunun seçilməsi, DNT-nin iki böyük hissəsini meydana gətirmək üçün bütün fərdlərin DNT-sinin birləşdirilməsi, iki hovuz arasında diferensial ardıcıllığın müəyyən edilməsi daxildir.Bu texnika bitki/heyvan genomlarında hədəflənmiş genlərlə güclü əlaqəli olan genetik markerlərin müəyyən edilməsində geniş şəkildə istifadə edilmişdir.
