Uzun Qeyri-kodlaşdırma Sequencing-Illumina
Xidmət Üstünlükləri
●mRNT və lncRNA-nın birgə təhlili: mRNT transkriptlərinin kəmiyyətini lncRNA və onların hədəflərinin tədqiqi ilə birləşdirərək, hüceyrə reaksiyasının əsasını təşkil edən tənzimləmə mexanizmi haqqında ətraflı məlumat əldə etmək mümkündür.
●Geniş Ekspertiza: Biz müxtəlif nümunələri və layihələrin məqsədlərini əhatə edən 230,000-dən çox nümunəni emal etmişik. Biz hər bir layihəyə təcrübə zənginliyi gətiririk.
●mRNT və lncRNA-nın birgə təhlili: Biz mRNT transkriptlərinin kəmiyyətini lncRNA və onların hədəflərinin tədqiqi ilə birləşdirərək hüceyrə reaksiyasının əsasını təşkil edən tənzimləmə mexanizmi haqqında ətraflı məlumat əldə etməyə imkan veririk.
●Ciddi Keyfiyyətə Nəzarət: Nümunələrin hazırlanmasından tutmuş kitabxananın hazırlanmasına, ardıcıllıq və bioinformatikaya qədər bütün mərhələlərdə əsas nəzarət nöqtələrini həyata keçiririk. Bizim dəqiq monitorinqimiz davamlı olaraq yüksək keyfiyyətli nəticələrin çatdırılmasını təmin edir.
●Hərtərəfli Annotasiya: Biz Diferensial İfadə Edilmiş Genləri (DEG) funksional olaraq qeyd etmək və müvafiq zənginləşdirmə təhlillərini aparmaq üçün çoxlu verilənlər bazasından istifadə edirik. Bu hərtərəfli yanaşma transkriptom cavabının altında yatan hüceyrə və molekulyar proseslər haqqında anlayışlar təqdim edərək, təcrübənizin məlumatları haqqında mümkün olan bütün məlumatları əldə etməyinizi təmin edir.
●Satışdan sonra dəstək: Biz iştirak etməyin nə qədər vacib olduğunu başa düşürük, buna görə də öhdəliyimiz 3 aylıq satış sonrası xidmət müddəti ilə layihənin tamamlanmasından kənara çıxır. Bu müddət ərzində biz nəticələrlə bağlı istənilən sualları həll etmək üçün layihənin təqibi, problemlərin aradan qaldırılması üçün yardım və sual-cavab sessiyaları təklif edirik.
Nümunə Tələbləri və Çatdırılma
| Kitabxana | Platforma | Tövsiyə olunan məlumatlar | Data QC |
| rRNA tükənmiş istiqamətli kitabxana | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nukleotidlər:
| Kons.(ng/μl) | Məbləğ (μg) | Saflıq | Dürüstlük |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Zülal və ya DNT ilə çirklənmə məhduddur və ya yoxdur. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; məhdud və ya əsas yüksəklik yoxdur |
● Bitkilər:
Kök, gövdə və ya ləçək: 450 mq
Yarpaq və ya toxum: 300 mq
Meyvə: 1,2 q
● Heyvan:
Ürək və ya bağırsaq: 450 mq
Daxili orqanlar və ya beyin: 240 mq
Əzələ: 600 mq
Sümüklər, saçlar və ya dərilər: 1,5 q
● Buğumayaqlılar:
Həşəratlar: 9 q
xərçəngkimilər: 450 mq
● Tam qan:2 boru
● Hüceyrələr: 106 hüceyrələr
● Serum və Plazma: 6 ml
Tövsiyə olunan Nümunə Çatdırılması
Konteyner: 2 ml sentrifuqa borusu (qalay folqa tövsiyə edilmir)
Nümunə etiketləmə: Qrup+təkrar, məsələn, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Göndərmə:
1. Quru buz: Nümunələr torbalara yığılmalı və quru buzda basdırılmalıdır.
2. RNT-stabil borular: RNT nümunələri RNT stabilizasiya borusunda (məsələn, RNAstable®) qurudula və otaq temperaturunda göndərilə bilər.
Xidmət İş Akışı
Eksperiment dizaynı
Nümunə çatdırılması
RNT çıxarılması
Kitabxana tikintisi
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Bioinformatika
- Xam məlumat
- Data QC
- Genom uyğunlaşması
- Gen quruluşu (Alternativ birləşmə, gen strukturunun optimallaşdırılması və yeni gen proqnozu)
- Gen ifadəsinin kəmiyyəti
- Diferensial ifadə təhlili
- DEG annotasiyası və zənginləşdirilməsi + Diferensial ifadə olunan lncRNA hədəf genləri
- Transkript identifikasiyası
- lncRNA identifikasiyası (lncRNA-nın qorunması və məlum lncRNA)
- lncRNA hədəf genlərinin proqnozlaşdırılması
- lncRNA ifadəsinin kəmiyyəti
- mRNA məlumatları ilə birgə analiz
Diferensial Gen İfadəsi (DEGs) analizi
lncRNA ifadəsinin kəmiyyəti - klasterləşmə
lncRNA hədəf genlərinin zənginləşdirilməsi
Birgə mRNA və lncRNA mövqe analizi - Circos süjeti (orta dairə mRNA və daxili cicrlce lncRNA-dır)
Seçilmiş nəşrlər toplusu vasitəsilə BMKGene-nin lncRNA bərabərləşdirmə xidmətləri ilə təmin edilən irəliləyişləri araşdırın.
Ji, H. və başqaları. (2020) 'Siçovulların qaraciyərində soyuq streslə əlaqəli lncRNA-ların identifikasiyası, funksional proqnozu və əsas lncRNA yoxlanışı',Elmi Hesabatlar2020 10:1, 10(1), səh. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'İnteqrativ Transkriptomik Təhlil CyHV-3-Davamlı Ümumi Sazan Ştamının İmmun Mexanizmini aşkar edir',İmmunologiyada sərhədlər, 12, səh. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Kiçik Hüceyrəli Ağciyər Xərçəngində Rəqabət edən Endogen RNT Tənzimləmə Şəbəkələrinin Multi-Omik İnteqrasiya Əsaslı Prioritetləşdirilməsi: Molekulyar Xüsusiyyətlər və Dərman Namizədləri',Onkologiyada sərhədlər, 12, səh. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. və başqaları. (2020) 'Populusda fotosintezin əsasını təşkil edən gen birgə ifadə şəbəkəsinin genetik disseksiyası',Bitki Biotexnologiyası Jurnalı, 18(4), səh. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Graves Xəstəliyi və Haşimoto Tiroiditinin Mikro Mühitində İmmun Hüceyrələrdə Tənzimlənməmiş Gen İfadəsi və Anormal Metabolik Siqnal üçün Qlobal Tənzimləyici Şəbəkə',İmmunologiyada sərhədlər, 13, səh. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
