page_head_bg

Məhsullar

Metagenomik ardıcıllıq (NGS)

Metagenom ətraf mühitin metagenomu, insan metagenomu və s. kimi qarışıq orqanizmlər icmasının ümumi genetik materialının toplusuna aiddir. O, həm becərilə bilən, həm də becərilməyən mikroorqanizmlərin genomlarını ehtiva edir.Metagenomik ardıcıllıq ətraf mühit nümunələrindən çıxarılan qarışıq genomik materialların təhlili üçün istifadə olunan molekulyar alətdir və növlərin müxtəlifliyi və bolluğu, populyasiya strukturu, filogenetik əlaqə, funksional genlər və ətraf mühit faktorları ilə korrelyasiya şəbəkəsi haqqında ətraflı məlumat verir.

Platforma:Illumina NovaSeq6000


Xidmət Təfərrüatları

Demo nəticələri

Case Study

Xidmət Üstünlükləri

ØMikrob icmasının profilini çıxarmaq üçün izolyasiya və becərilməz

ØƏtraf mühit nümunələrində az bol olan növlərin aşkar edilməsində yüksək dəqiqlik

Ø“Meta-” ideyası bütün bioloji xüsusiyyətləri funksional səviyyədə, növ səviyyəsində və gen səviyyəsində birləşdirir ki, bu da reallığa daha yaxın olan dinamik mənzərəni əks etdirir.

ØBMK 10.000-dən çox nümunə ilə müxtəlif nümunə növləri üzrə böyük təcrübə toplayır.

Xidmət Xüsusiyyətləri

SıralamaPlatforma

Kitabxana

Tövsiyə olunan məlumat gəliri

Təxmini dönüş vaxtı

Illumina NovaSeq 6000

PE250

50K/100K/300K Teqlər

30 Gün

Bioinformatika analizləri

üXam məlumatların keyfiyyətinə nəzarət

üMetagenom montajı

üQeyri-ehtiyatsız gen dəsti və annotasiya

üNövlərin müxtəlifliyinin təhlili

üGenetik funksiyaların müxtəlifliyinin təhlili

üQruplararası təhlil

üEksperimental amillərə qarşı assosiasiya təhlili

2

Nümunə Tələbləri və Çatdırılma

Nümunə tələbləri:

üçünDNT ekstraktları:

Nümunə növü

Məbləğ

Konsentrasiya

Saflıq

DNT ekstraktları

> 30 ng

> 1 ng/μl

OD260/280= 1,6-2,5

Ətraf mühit nümunələri üçün:

Nümunə növü

Tövsiyə olunan nümunə götürmə proseduru

Torpaq

Nümunə miqdarı: təqribən.5 q;Qalan qurumuş maddə səthdən çıxarılmalıdır;Böyük parçaları doğrayın və 2 mm filtrdən keçirin;Rezervasiya üçün steril EP-borucuqda və ya cyrotubda aliquot nümunələri.

Nəcis

Nümunə miqdarı: təqribən.5 q;Rezervasiya üçün steril EP-boru və ya kriotubedə nümunələri toplayın və alikvotlayın.

Bağırsaq məzmunu

Nümunələr aseptik şəraitdə emal edilməlidir.Toplanmış toxumaları PBS ilə yuyun;PBS-ni sentrifuqa edin və çöküntünü EP borularında toplayın.

çamur

Nümunə miqdarı: təqribən.5 q;Şlam nümunəsini rezervasiya üçün steril EP-boruya və ya kriotubaya toplayın və alikvotun

Su obyekti

Kran suyu, quyu suyu və s. kimi məhdud miqdarda mikrob olan nümunə üçün ən azı 1 L su toplayın və membrandakı mikrobi zənginləşdirmək üçün 0,22 μm filtrdən keçirin.Membranı steril boruda saxlayın.

Dəri

Dərinin səthini steril pambıq çubuq və ya cərrahi bıçaqla diqqətlə qırın və steril boruya qoyun.

Tövsiyə olunan Nümunə Çatdırılması

Nümunələri maye azotda 3-4 saat dondurun və maye azotda və ya -80 dərəcədən uzunmüddətli rezervasiyada saxlayın.Quru buz ilə nümunə göndərmə tələb olunur.

Xidmət İş Akışı

logo_02

Nümunə çatdırılması

logo_04

Kitabxana tikintisi

logo_05

Sıralama

logo_06

Məlumatların təhlili

logo_07

Satışdan sonrakı xidmətlər


  • Əvvəlki:
  • Sonrakı:

  • 1.Histoqram: Növlərin paylanması

    3

    2. KEGG metabolik yollarına şərh edilmiş funksional genlər

    4

    3.İstilik xəritəsi: Nisbi gen bolluğuna əsaslanan diferensial funksiyalar54.CARD antibiotik müqavimət genlərinin sirkləri

    6

    BMK işi

    Torpaq-mangrov kök davamlılığı boyunca antibiotik müqavimət genlərinin və bakterial patogenlərin yayılması

    Nəşr olundu:Təhlükəli Materiallar Jurnalı, 2021

    Ardıcıllıq strategiyası:

    Materiallar: Mangrov kökü ilə əlaqəli nümunələrin dörd fraqmentinin DNT ekstraktları: əkilməmiş torpaq, rizosfer, episfer və endosfer bölmələri
    Platforma: Illumina HiSeq 2500
    Hədəflər: Metagenom
    16S rRNA geni V3-V4 bölgəsi

    Əsas nəticələr

    Antibiotik müqavimət genlərinin (ARG) torpaqdan bitkilərə yayılmasının öyrənilməsi məqsədilə manqrov tinglərinin torpaq-kök kontinuumunda metagenomik ardıcıllıq və metabarkodlama profili işlənmişdir.Metagenomik məlumatlar, antibiotik müqavimət genlərinin 91,4% -nin yuxarıda qeyd olunan bütün dörd torpaq bölməsində müəyyən edildiyini və davamlı bir moda nümayiş etdirdiyini ortaya qoydu.16S rRNA amplikon ardıcıllığı 346 növü təmsil edən 29,285 ardıcıllıq yaratdı.Amplikon ardıcıllığı ilə növlərin profilləşdirilməsi ilə birləşərək, bu yayılmanın köklə əlaqəli mikrobiotadan asılı olmadığı aşkar edildi, lakin bu, genetik elementlərin mobilliyi ilə asanlaşdırıla bilər.Bu tədqiqat qarşılıqlı əlaqəli torpaq-kök kontinuumu vasitəsilə torpaqdan bitkilərə ARG və patogenlərin axını müəyyən etdi.

    İstinad

    Wang, C., Hu, R., Strong, PJ, Zhuang, W., & Shu, L..(2020).Torpaq-mangrov kök davamlılığı boyunca antibiotik müqavimət genlərinin və bakterial patogenlərin yayılması.Təhlükəli Materiallar Jurnalı, 408, 124985.

    sitat almaq

    Mesajınızı buraya yazın və bizə göndərin

    Mesajınızı bizə göndərin: