-
Metagenomik ardıcıllıq (NGS)
Metagenom ətraf mühitin metagenomu, insan metagenomu və s. kimi qarışıq orqanizmlər icmasının ümumi genetik materialının toplusuna aiddir. O, həm becərilə bilən, həm də becərilməyən mikroorqanizmlərin genomlarını ehtiva edir.Metagenomik ardıcıllıq ətraf mühit nümunələrindən çıxarılan qarışıq genomik materialların təhlili üçün istifadə olunan molekulyar alətdir və növlərin müxtəlifliyi və bolluğu, populyasiya strukturu, filogenetik əlaqə, funksional genlər və ətraf mühit faktorları ilə korrelyasiya şəbəkəsi haqqında ətraflı məlumat verir.
Platforma:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomika ətraf mühit nümunələrindən çıxarılan qarışıq genomik materialların təhlili üçün istifadə olunan molekulyar alətdir, burada növlərin müxtəlifliyi və bolluğu, populyasiya strukturu, filogenetik əlaqə, funksional genlər və ətraf mühit amilləri ilə korrelyasiya şəbəkəsi və s. metagenomik tədqiqatlar üçün.Onun oxunma uzunluğundakı üstün performansı aşağı axın metagenomik analizini, xüsusən də metagenom birləşməsini əhəmiyyətli dərəcədə artırdı.Oxuma uzunluğunun üstünlüklərindən istifadə edərək, Nanopore əsaslı metagenomik tədqiqat ov tüfəngi metagenomikası ilə müqayisədə daha davamlı montaja nail ola bilir.Nanopore əsaslı metagenomikanın mikrobiomlardan tam və qapalı bakterial genomları uğurla yaratdığı nəşr edilmişdir (Moss, EL, et. al.Təbiət biotexnologiyası, 2020)
Platforma:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S və 18S rRNT-də həm yüksək dərəcədə qorunan, həm də hiper-dəyişən bölgələri ehtiva edən alt bölmə prokaryotik və eukaryotik orqanizmlərin identifikasiyası üçün mükəmməl molekulyar barmaq izidir.Ardıcıllıqdan istifadə edərək, bu amplikonlar qorunan hissələrə əsasən hədəfə alına bilər və hiper-dəyişən bölgələr mikrob müxtəlifliyinin təhlili, taksonomiya, filogeniya və s. əhatə edən tədqiqatlara töhfə verən mikrob identifikasiyası üçün tam olaraq xarakterizə edilə bilər. Tək molekullu real vaxt(SMRT) ) PacBio platformasının ardıcıllığı tam uzunluqlu amplikonları (təqribən 1,5 Kb) əhatə edə bilən yüksək dəqiqlikli uzun oxunuşları əldə etməyə imkan verir.Genetik sahənin geniş görünüşü bakteriya və ya göbələklər cəmiyyətində növ annotasiyasının dəqiqliyini xeyli artırdı.
Platforma:PacBio davamı II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplikon ardıcıllığının məqsədi həm yüksək dərəcədə qarşılıqlı, həm də hiperdəyişən hissələri ehtiva edən ev təsərrüfatı genetik markerlərinin PCR məhsullarını tədqiq etməklə mikrob icmasında filogeniya, taksonomiya və növ bolluğunu aşkar etməkdir.Bu mükəmməl molekulyar barmaq izinin Woeses və digərləri (1977) tərəfindən təqdim edilməsi, mikrobiomun təcrid olunmadan profillənməsini gücləndirir.16S (bakteriyalar), 18S (göbələklər) və Daxili transkripsiya edilmiş spacer (ITS, göbələklər) ardıcıllığı həm bol növlərin, həm də nadir və naməlum növlərin identifikasiyasına imkan verir.Bu texnologiya müxtəlif mühitlərdə, məsələn, insan ağzı, bağırsaqları, nəcisləri və s.-də diferensial mikrob tərkibinin müəyyən edilməsində geniş tətbiq olunan və əsas vasitəyə çevrilmişdir.
Platforma:Illumina NovaSeq6000
-
Bakterial və göbələklərin bütün genomunun təkrar ardıcıllığı
Bakterial və göbələklərin bütöv genomunun təkrar ardıcıllığı məlum bakteriya və göbələklərin genomlarını tamamlamaq, həmçinin çoxsaylı genomları müqayisə etmək və ya yeni orqanizmlərin genomlarını xəritələşdirmək üçün mühüm vasitədir.Dəqiq istinad genomlarının yaradılması, mikrobların identifikasiyası və digər müqayisəli genom tədqiqatlarının aparılması üçün bakteriya və göbələklərin bütün genomlarının ardıcıllığı böyük əhəmiyyət kəsb edir.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Mantar genomu
Biomarker Technologies xüsusi tədqiqat məqsədindən asılı olaraq genom sorğusu, incə genom və göbələklərin tam genomunu təmin edir.Genom ardıcıllığı, montaj və funksional annotasiya yüksək səviyyəli genom yığımına nail olmaq üçün Növbəti nəsil ardıcıllığı + Üçüncü nəsil ardıcıllığı birləşdirməklə əldə edilə bilər.Hi-C texnologiyası həmçinin xromosom səviyyəsində genom yığılmasını asanlaşdırmaq üçün istifadə edilə bilər.
Platforma:PacBio davamı II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakteriyaların tam genomu
Biomarker Technologies sıfır boşluqla bakteriyaların tam genomunun qurulması üzrə ardıcıllıq xidməti təqdim edir.Bakteriyaların tam genom qurulmasının əsas iş axınına üçüncü nəsil ardıcıllığı, montaj, funksional annotasiya və xüsusi tədqiqat məqsədlərini yerinə yetirən qabaqcıl bioinformatik analiz daxildir.Bakteriyaların genomunun daha əhatəli profili onların bioloji proseslərinin əsasını təşkil edən əsas mexanizmləri aşkar etməyə imkan verir ki, bu da yüksək eukaryotik növlərdə genomik tədqiqatlar üçün dəyərli istinad təmin edə bilər.
Platforma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio davamı II
