-
PacBio-Tam uzunluqlu 16S/18S/ITS Amplikon Ardıcıllığı
Amplicon (16S/18S/ITS) platforması, standartlaşdırılmış əsas analiz və fərdiləşdirilmiş analizi özündə birləşdirən mikrob müxtəlifliyi layihəsinin təhlili sahəsində illərlə təcrübə ilə hazırlanmışdır: əsas analiz mövcud mikrob tədqiqatlarının əsas təhlil məzmununu əhatə edir, təhlil məzmunu zəngin və əhatəlidir və təhlil nəticələri layihə hesabatları şəklində təqdim olunur; Fərdiləşdirilmiş təhlilin məzmunu müxtəlifdir. Fərdiləşdirilmiş tələbləri həyata keçirmək üçün nümunələr seçilə və parametrlər əsas təhlil hesabatına və tədqiqat məqsədinə uyğun olaraq çevik şəkildə təyin edilə bilər. Windows əməliyyat sistemi, sadə və sürətli.
-
PacBio-Tam uzunluqlu transkriptom (İstinad Olmayan)
Pacific Biosciences (PacBio) İzoform ardıcıllıq məlumatlarını giriş kimi qəbul edərək, bu Tətbiq tam uzunluqlu transkript ardıcıllıqlarını (yığım olmadan) müəyyən edə bilir. Tam uzunluqlu ardıcıllıqları istinad genomuna qarşı xəritələşdirməklə transkriptlər məlum genlər, transkriptlər, kodlaşdırma bölgələri və s. ilə optimallaşdırıla bilər. Bu halda, alternativ splaysinq və s. kimi mRNA strukturlarının daha dəqiq müəyyənləşdirilməsinə nail olmaq olar. NGS transkriptom ardıcıllıq məlumatları ilə birgə analiz transkript səviyyəsində daha əhatəli annotasiya və ifadədə daha dəqiq kəmiyyətləndirməyə imkan verir ki, bu da əsasən aşağı axın diferensial ifadə və funksional təhlilə fayda verir.
-
Alət dəstləri
BMKCloud, tibbi, kənd təsərrüfatı, ətraf mühit və s. daxil olmaqla müxtəlif sahələrdə tədqiqatçılar tərəfindən geniş etibar qazanan genom proqramları üçün vahid həll yolu təqdim edən aparıcı bioinformatik platformadır. BMKCloud, bioinformatik analiz platformaları və alətləri, hesablama resursları, ictimai verilənlər bazası, bioinformatik onlayn kurslar və s. daxil olmaqla inteqrasiya olunmuş, etibarlı və səmərəli xidmətlər göstərməyə sadiqdir. BMKCloud, gen annotasiyası, təkamül genetik alətləri, ncRNA, məlumatların keyfiyyətinə nəzarət, yığılma, uyğunlaşdırma, məlumatların çıxarılması, mutasiyalar, statistika, rəqəm generatoru, ardıcıllıq təhlili və s. daxil olmaqla müxtəlif tez-tez istifadə olunan bioinformatik alətlərə malikdir.
-
Kiçik RNT
Kiçik RNT-lər, miRNT, siRNT və piRNT daxil olmaqla, orta uzunluğu 18-30 nt olan qısa kodlaşdırmayan RNT növüdür. Bu kiçik RNT-lərin mRNT-nin deqradasiyası, tərcümənin inhibisiyası, heteroxromatin əmələ gəlməsi və s. kimi müxtəlif bioloji proseslərdə iştirak etdiyi kütləvi şəkildə bildirilmişdir. Kiçik RNT ardıcıllıq təhlili heyvan/bitki inkişafı, xəstəliklər, viruslar və s. üzrə tədqiqatlarda geniş tətbiq edilmişdir. Kiçik RNT ardıcıllıq təhlili platforması standart təhlil və qabaqcıl məlumatların çıxarılmasından ibarətdir. RNT-seq məlumatları əsasında standart təhlil miRNT-nin müəyyənləşdirilməsinə və proqnozlaşdırılmasına, miRNT hədəf geninin proqnozlaşdırılmasına, annotasiya və ifadə təhlilinə nail ola bilər. Qabaqcıl təhlil fərdiləşdirilmiş miRNT axtarışına və çıxarılmasına, Venn diaqramının yaradılmasına, miRNT və hədəf gen şəbəkəsinin qurulmasına imkan verir.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS, Biomarker Texnologiyaları sahəsində zəngin təcrübəyə əsaslanaraq hazırlanmış bütöv bir genom yenidən ardıcıllıqla təhlil platformasıdır. İstifadəsi asan olan bu platforma, həm Illumina platformasından, həm də BGI ardıcıllıqla təhlil platformasından yaradılan DNT ardıcıllıqla təhlil məlumatları üçün uyğun olan bir neçə əsas parametr təyin etməklə inteqrasiya olunmuş analiz iş axınının tez bir zamanda təqdim edilməsinə imkan verir. Bu platforma yüksək performanslı hesablama serverində yerləşdirilib ki, bu da çox məhdud vaxtda yüksək səmərəli məlumat təhlilini təmin edir. Fərdiləşdirilmiş məlumatların çıxarılması standart analiz, o cümlədən mutasiya olunmuş gen sorğusu, PCR primer dizaynı və s. əsasında mümkündür.
-
mRNT (İstinad)
Transkriptom genom genetik məlumatı ilə bioloji funksiyanın proteomu arasındakı əlaqədir. Transkripsiya səviyyəsinin tənzimlənməsi orqanizmlərin ən vacib və ən geniş öyrənilən tənzimləmə rejimidir. Transkriptom ardıcıllığı transkriptomu istənilən vaxtda və ya istənilən şəraitdə tək bir nukleotidə qədər dəqiq bir qətnamə ilə ardıcıllaşdıra bilər. Gen transkripsiyasının səviyyəsini dinamik şəkildə əks etdirə, eyni zamanda nadir və normal transkriptləri müəyyən edə və kəmiyyətləndirə, həmçinin nümunəyə xas transkriptlərin struktur məlumatlarını təmin edə bilər.
Hazırda transkriptom ardıcıllıqla müəyyənləşdirmə texnologiyası aqronomiya, tibb və digər tədqiqat sahələrində, o cümlədən heyvan və bitki inkişafının tənzimlənməsi, ətraf mühitə uyğunlaşma, immun qarşılıqlı təsiri, gen lokalizasiyası, növlərin genetik təkamülü və şiş və genetik xəstəliklərin aşkarlanması sahələrində geniş istifadə olunur.
-
Metagenomika (NGS)
Bu analiz platforması, illərlə təcrübəyə əsaslanaraq, metagenomik məlumatların təhlili üçün nəzərdə tutulmuşdur. Məlumatların emalı, növ səviyyəli tədqiqatlar, gen funksiyası səviyyəli tədqiqatlar, metagenom binninqi və s. daxil olmaqla, tez-tez tələb olunan müxtəlif metagenomik təhlilləri özündə birləşdirən inteqrasiya olunmuş iş axınından ibarətdir. Bundan əlavə, standart analiz iş axınında gen və növ sorğusu, parametrlərin təyini, fərdiləşdirilmiş rəqəmlərin yaradılması və s. daxil olmaqla, fərdiləşdirilmiş məlumatların çıxarılması alətləri mövcuddur.
-
LncRNA
Uzun kodlaşdırmayan RNT-lər (lncRNA), uzunluğu 200 nt-dən çox olan və zülalları kodlaşdıra bilməyən bir növ transkriptdir. Toplanan dəlillər göstərir ki, lncRNA-ların əksəriyyəti funksional olma ehtimalı çox yüksəkdir. Yüksək məhsuldarlıqlı ardıcıllıq texnologiyaları və bioinformatik analiz vasitələri bizə lncRNA ardıcıllıqlarını və yerləşdirmə məlumatlarını daha səmərəli şəkildə aşkar etməyə imkan verir və vacib tənzimləyici funksiyalara malik lncRNA-ları kəşf etməyimizə kömək edir. BMKCloud, müştərilərimizə sürətli, etibarlı və çevik lncRNA analizi əldə etmək üçün lncRNA ardıcıllıq analiz platforması təqdim etməkdən qürur duyur.
-
GWAS
Genom-genom assosiasiya tədqiqatı (GWAS) spesifik xüsusiyyətlərlə (fenotip) əlaqəli genetik variantları (genotip) müəyyən etməyi hədəfləyir. GWA tədqiqatları çox sayda fərdlərin bütün genomunu keçən genetik markerləri araşdırır və populyasiya səviyyəsində statistik təhlil yolu ilə genotip-fenotip əlaqələrini proqnozlaşdırır. Bütün genom ardıcıllığı bütün genetik variantları potensial olaraq aşkar edə bilər. Fenotipik məlumatlarla birləşdirilərək, GWAS, fenotiplə əlaqəli SNP-ləri, QTL-ləri və namizəd genləri müəyyən etmək üçün emal edilə bilər ki, bu da müasir heyvan/bitki yetişdirməsini güclü şəkildə dəstəkləyir. SLAF, genom- ...
-
Nanopore Tammetrajlı transkriptomika
Orqanizmlərdə mürəkkəb və dəyişkən alternativ izoformlar gen ifadəsini və zülal müxtəlifliyini tənzimləmək üçün vacib genetik mexanizmlərdir. Transkript strukturlarının dəqiq müəyyən edilməsi gen ifadəsinin tənzimlənməsi nümunələrinin dərindən öyrənilməsi üçün əsasdır. Nanopore ardıcıllıq platforması transkriptomik tədqiqatı izoform səviyyəsinə uğurla çatdırmışdır. Bu analiz platforması, həm gen səviyyəsində, həm də transkript səviyyəsində keyfiyyət və kəmiyyət təhlillərinə nail olan istinad genomu əsasında Nanopore platformasında yaradılan RNT-Seq məlumatlarını təhlil etmək üçün hazırlanmışdır.
-
sirk-RNT
Dairəvi RNT (circRNA), son zamanlarda inkişaf, ətraf mühit müqaviməti və s. ilə əlaqəli tənzimləyici şəbəkələrdə mühüm rol oynadığı aşkar edilmiş kodlaşdırmayan RNT növüdür. Xətti RNT molekullarından, məsələn, mRNT, lncRNT-dən fərqli olaraq, sirkRNT-nin 3′ və 5′ ucları dairəvi bir quruluş yaratmaq üçün birləşir ki, bu da onları ekzonukleazın həzmindən qoruyur və əksər xətti RNT-lərdən daha sabitdir. SirkRNT-nin gen ifadəsinin tənzimlənməsində müxtəlif funksiyalara malik olduğu aşkar edilmişdir. SirkRNT, miRNT-yə rəqabətli şəkildə bağlanan ceRNT kimi çıxış edə bilər ki, bu da miRNT süngəri kimi tanınır. SirkRNT ardıcıllıq analiz platforması sirkRNT strukturu və ifadə analizini, hədəf proqnozunu və digər RNT molekulları ilə birgə analizi gücləndirir.
-
BSA
Toplu Seqreqant Analiz platforması bir mərhələli standart analizdən və xüsusi parametr qəbulu ilə inkişaf etmiş analizdən ibarətdir. BSA, fenotiplə əlaqəli genetik markerləri tez bir zamanda müəyyən etmək üçün istifadə edilən bir texnikadır. BSA-nın əsas iş axını aşağıdakıları əhatə edir: 1. Son dərəcə əks fenotiplərə malik iki qrup fərd seçmək; 2. Bütün fərdlərin DNT-sini, RNT-sini və ya SLAF-seq-ni (Biomarker tərəfindən hazırlanmışdır) iki DNT toplu halına gətirmək üçün birləşdirmək; 3. istinad genomuna və ya aralarındakı diferensial ardıcıllıqları müəyyən etmək, 4. ED və SNP-indeks alqoritmi ilə namizəd əlaqəli bölgələri proqnozlaşdırmaq; 5. Namizəd bölgələrdəki genlərin funksional analizi və zənginləşdirilməsi və s. Genetik marker müayinəsi və praymer dizaynı da daxil olmaqla məlumatların daha inkişaf etmiş şəkildə çıxarılması da mövcuddur.
-
Amplikon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platforması, standartlaşdırılmış əsas analiz və fərdiləşdirilmiş analizi özündə birləşdirən mikrob müxtəlifliyi layihəsinin təhlili sahəsində illərlə təcrübə ilə hazırlanmışdır: əsas analiz mövcud mikrob tədqiqatlarının əsas təhlil məzmununu əhatə edir, təhlil məzmunu zəngin və əhatəlidir və təhlil nəticələri layihə hesabatları şəklində təqdim olunur; Fərdiləşdirilmiş təhlilin məzmunu müxtəlifdir. Fərdiləşdirilmiş tələbləri həyata keçirmək üçün nümunələr seçilə və parametrlər əsas təhlil hesabatına və tədqiqat məqsədinə uyğun olaraq çevik şəkildə təyin edilə bilər. Windows əməliyyat sistemi, sadə və sürətli.
