Kiçik RNT ardıcıllığı-Illumina
Xüsusiyyətləri
● Kitabxananın hazırlanmasından əvvəl RNT-nin ölçüsü seçimi
● miRNA proqnozu və onların hədəfləri ətrafında mərkəzləşdirilmiş bioinformatik analiz
Xidmət Üstünlükləri
●Hərtərəfli bioinformatika analizi:həm tanınmış, həm də yeni miRNA-ların identifikasiyasına, miRNA-ların hədəflərinin identifikasiyasına və müvafiq funksional annotasiyaya və çoxsaylı verilənlər bazası (KEGG, GO) ilə zənginləşdirməyə imkan verir.
●Ciddi Keyfiyyətə Nəzarət: biz nümunə və kitabxananın hazırlanmasından tutmuş ardıcıllıq və bioinformatikaya qədər bütün mərhələlərdə əsas nəzarət nöqtələrini həyata keçiririk.Bu dəqiq monitorinq ardıcıl yüksək keyfiyyətli nəticələrin çatdırılmasını təmin edir.
●Satışdan sonra dəstək: Bizim öhdəliyimiz 3 aylıq satış sonrası xidmət müddəti ilə layihənin tamamlanmasından kənara çıxır.Bu müddət ərzində biz nəticələrlə bağlı istənilən sualları həll etmək üçün layihənin təqibi, problemlərin aradan qaldırılması üçün yardım və sual-cavab sessiyaları təklif edirik.
●Geniş Ekspertiza: müxtəlif tədqiqat sahələrində 100-dən çox növü əhatə edən çoxsaylı sRNA layihələrini uğurla başa vurma təcrübəsi ilə komandamız hər bir layihəyə zəngin təcrübə gətirir.
Nümunə Tələbləri və Çatdırılma
| Kitabxana | Platforma | Tövsiyə olunan məlumatlar | Data QC |
| Ölçü seçildi | Illumina SE50 | 10M-20M oxuyur | Q30≥85% |
Nümunə tələbləri:
Nukleotidlər:
| Kons.(ng/μl) | Məbləğ (μg) | Saflıq | Dürüstlük |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Zülal və ya DNT ilə çirklənmə məhduddur və ya yoxdur. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; məhdud və ya əsas yüksəklik yoxdur |
● Bitkilər:
Kök, gövdə və ya ləçək: 450 mq
Yarpaq və ya toxum: 300 mq
Meyvə: 1,2 q
● Heyvan:
Ürək və ya bağırsaq: 450 mq
Daxili orqanlar və ya beyin: 240 mq
Əzələ: 600 mq
Sümüklər, saçlar və ya dərilər: 1,5 q
● Buğumayaqlılar:
Həşəratlar: 9 q
xərçəngkimilər: 450 mq
● Tam qan: 2 boru
● Hüceyrələr: 106 hüceyrələr
● Serum və Plazma:6 ml
Tövsiyə olunan Nümunə Çatdırılması
Konteyner:
2 ml sentrifuqa borusu (qalay folqa tövsiyə edilmir)
Nümunə etiketləmə: Qrup+təkrar, məsələn, A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Göndərmə:
1.Quru buz: Nümunələr torbalara yığılmalı və quru buzda basdırılmalıdır.
2.RNAstabil borular: RNT nümunələri RNT stabilizasiya borusunda (məsələn, RNAstable®) qurudula və otaq temperaturunda göndərilə bilər.
Xidmət İş Akışı
Təcrübə dizaynı
Nümunə çatdırılması
RNT çıxarılması
Kitabxana tikintisi
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Bioinformatika
miRNT-nin identifikasiyası: strukturu və dərinliyi
miRNT-nin diferensial ifadəsi – iyerarxik klasterləşmə
Diferensial şəkildə ifadə olunan miRNA-ların hədəfinin funksional annotasiyası
Seçilmiş nəşrlər toplusu vasitəsilə BMKGene'nin sRNA sıralama xidmətləri ilə asanlaşdırılan tədqiqat irəliləyişlərini araşdırın.
Chen, H. et al.(2023) 'Virus infeksiyaları Panax notoginseng-də saponin biosintezini və fotosintezini maneə törədir', Bitki Fiziologiyası və Biokimyası, 203, səh.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. və başqaları.(2023) "FYVE domeni tərkibli protein FREE1 bitkisi miRNT biogenezini repressiya etmək üçün mikroprosessor komponentləri ilə birləşir", EMBO hesabatları, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'MikroRNT Ame-Bantam-3p Bal arısında Çoxlu Epidermal Böyümə Faktoruna bənzər Domenlər 8 Genini (megf8) hədəf alaraq sürfə pupa inkişafına nəzarət edir, Apis mellifera', Beynəlxalq Molekulyar Elmlər Jurnalı, 24(6), səh. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'MiRNA və Ətin Keyfiyyəti ilə Əlaqədar Genlərin İnteqrasiya Təhlili Gga-MiR-140-5p'nin Toyuqlarda əzələdaxili yağ çökməsinə təsir etdiyini ortaya qoyur', Hüceyrə Fiziologiyası və Biokimya, 46(6), səh. 2421-2433.doi: 10.1159/000489649.
