Xüsusi Lokus Gücləndirilmiş Fraqment Sıralaması (SLAF-Seq)
Xidmət Təfərrüatları
Texniki sxem
İş axını
Xidmət Üstünlükləri
Yüksək marker kəşf səmərəliliyi- Yüksək məhsuldarlıqlı ardıcıllıq texnologiyası SLAF-Seq-ə bütün genomda yüz minlərlə teq aşkarlamağa kömək edir.
Genomdan aşağı asılılıq- İstinad genomu olan və ya olmayan növlərə tətbiq oluna bilər.
Çevik sxem dizaynı- Tək fermentli, ikili fermentli, çox fermentli həzm və müxtəlif növ fermentlər, hamısı müxtəlif tədqiqat məqsədi və ya növlərini təmin etmək üçün seçilə bilər.Optimal ferment dizaynını təmin etmək üçün silisiumda ilkin qiymətləndirmədən istifadə edilir.
Effektiv enzimatik həzm- Formal eksperimenti sabit və etibarlı edən şəraitin optimallaşdırılması üçün ilkin sınaq aparılmışdır.Fraqment toplama səmərəliliyi 95%-dən çox ola bilər.
Bərabər paylanmış SLAF etiketləri- SLAF teqləri bütün xromosomlarda maksimum dərəcədə bərabər paylanır və 4 kb üçün orta hesabla 1 SLAF əldə edir.
Təkrarların effektiv qarşısının alınması- SLAF-Seq məlumatlarında təkrarlanan ardıcıllıq, xüsusilə buğda, qarğıdalı və s. kimi təkrarlanma səviyyəsi yüksək olan növlərdə 5%-dən aşağıya endirilir.
Geniş təcrübə-Bitkilər, məməlilər, quşlar, həşəratlar, su orqanizmləri və s. əhatə edən yüzlərlə növ üzrə 2000-dən çox qapalı SLAF-Seq layihəsi.
Öz-özünə hazırlanmış bioinformatik iş axını- SLAF-Seq üçün inteqrasiya olunmuş bioinformatik iş axını BMKGENE tərəfindən yekun çıxışın etibarlılığını və dəqiqliyini təmin etmək üçün hazırlanmışdır.
Xidmət Xüsusiyyətləri
| Platforma | Kons.(ng/gl) | Ümumi (ug) | OD260/280 |
| Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(Cild>15μl) | 1.6-2.5 |
Tövsiyə olunan ardıcıllıq strategiyası
Ardıcıllıq dərinliyi: 10X/Tag
| Genom ölçüsü | Tövsiyə olunan SLAF Teqləri |
| < 500 Mb | 100K və ya WGS |
| 500 Mb - 1 Gb | 100 K |
| 1 Gb -2 Gb | 200 K |
| Nəhəng və ya mürəkkəb genomlar | 300 - 400K |
| Tətbiqlər
| Tövsiyə Əhali miqyası
| Ardıcıllıq strategiyası və dərinliyi
| |
| Dərinlik
| Etiket nömrəsi
| ||
| GWAS
| Nümunə sayı ≥ 200
| 10X
|
görə genom ölçüsü
|
| Genetik Təkamül
| Hər birinin fərdləri alt qrup ≥ 10; ümumi nümunələr ≥ 30
| 10X
| |
Tövsiyə olunan Nümunə Çatdırılması
Konteyner: 2 ml sentrifuqa borusu
Əksər nümunələr üçün etanolda saxlamamağı tövsiyə edirik.
Nümunələrin etiketlənməsi: Nümunələr aydın şəkildə etiketlənməlidir və təqdim edilmiş nümunə məlumat forması ilə eyni olmalıdır.
Göndərmə: Quru buz: Nümunələr əvvəlcə torbalara yığılmalı və quru buzda basdırılmalıdır.
Xidmət iş axını
Nümunə QC
Pilot təcrübə
SLAF-eksperiment
Kitabxana Hazırlığı
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satışdan sonrakı xidmətlər
1. Xəritənin nəticəsinin statistikası
2. SLAF markerinin inkişafı
3. Variasiya annotasiyası
| il | Jurnal | IF | Başlıq | Tətbiqlər |
| 2022 | Təbiət rabitəsi | 17.694 | Ağac pionunun giga-xromosomlarının və giga-genomunun genomik əsasları Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
| 2015 | Yeni Fitoloq | 7.433 | Evcilləşdirmə izləri aqronomik əhəmiyyət kəsb edən genomik bölgələri birləşdirir soya paxlası | SLAF-GWAS |
| 2022 | Qabaqcıl Araşdırmalar Jurnalı | 12.822 | Gossypium barbadense-nin G. hirsutum-a genom üzrə süni introgressiyaları pambıq lifinin keyfiyyətinin və məhsuldarlığının eyni vaxtda yaxşılaşdırılması üçün üstün yerləri aşkar etmək xüsusiyyətlər | SLAF - Təkamül genetikası |
| 2019 | Molekulyar Bitki | 10.81 | Əhali genomik analizi və De Novo Assambleyası alaq otlarının mənşəyini ortaya qoyur Düyü Təkamül Oyunu kimi | SLAF - Təkamül genetikası |
| 2019 | Təbiət Genetikası | 31.616 | Adi sazan, Cyprinus carpio-nun genom ardıcıllığı və genetik müxtəlifliyi | SLAF-Linkage xəritəsi |
| 2014 | Təbiət Genetikası | 25.455 | Becərilən yerfıstığının genomu paxlalı bitkilərin karyotipləri, poliploidləri haqqında məlumat verir. təkamül və məhsulun əhliləşdirilməsi. | SLAF-Linkage xəritəsi |
| 2022 | Bitki Biotexnologiyası Jurnalı | 9.803 | ST1-in identifikasiyası toxum morfologiyasının avtostopla bağlı seçimini ortaya qoyur və soyanın əhliləşdirilməsi zamanı yağ tərkibi | SLAF-Marker inkişafı |
| 2022 | Beynəlxalq Molekulyar Elmlər Jurnalı | 6.208 | Buğda-Leymus mollis 2Ns üçün identifikasiya və DNT markerinin inkişafı (2D) Disomik xromosomların dəyişdirilməsi | SLAF-Marker inkişafı |
