Платформа для масавага сегрэгантнага аналізу складаецца з аднаэтапнага стандартнага аналізу і пашыранага аналізу з індывідуальнай наладай параметраў. BSA - гэта метад, які выкарыстоўваецца для хуткай ідэнтыфікацыі генетычных маркераў, звязаных з фенатыпам. Асноўны працоўны працэс BSA ўключае: 1. выбар дзвюх груп асобін з надзвычай супрацьлеглымі фенатыпамі; 2. аб'яднанне ДНК, РНК або SLAF-секвенавання (распрацавана Biomarker) усіх асобін для фарміравання двух груп ДНК; 3. ідэнтыфікацыю дыферэнцыяльных паслядоўнасцей у параўнанні з эталонным геномам або паміж імі, 4. прагназаванне кандыдатных звязаных рэгіёнаў з дапамогай алгарытму ED і SNP-індэксу; 5. Функцыянальны аналіз і ўзбагачэнне генаў у кандыдатных рэгіёнах і г.д. Таксама даступныя больш паглыбленыя метады здабывання дадзеных, у тым ліку скрынінг генетычных маркераў і распрацоўка праймераў.
