Гатовыя бібліятэкі Illumina
Асаблівасці
●Платформы:Illumina NovaSeq 6000 і NovaSeq X Plus
●Рэжымы секвенавання:ПЭ150 і ПЭ250
●Кантроль якасці бібліятэк перад секвенаваннем
●Кантроль якасці і дастаўка дадзеных секвенавання:дастаўка справаздачы аб кантролі якасці і неапрацаваных дадзеных у фармаце fastq пасля дэмультыплексавання і фільтрацыі счытванняў Q30
Перавагі абслугоўвання
●Універсальнасць паслуг секвенавання:Кліент можа выбраць паслядоўнасць па дарожцы, праточнай ячэйцы або па колькасці неабходных дадзеных (частковая паслядоўнасць дарожкі).
●Шырокі вопыт працы з платформай секвенавання Illumina:з тысячамі закрытых праектаў з рознымі відамі.
●Дастаўка справаздачы аб кантролі якасці секвенавання:з паказчыкамі якасці, дакладнасцю дадзеных і агульнай прадукцыйнасцю праекта секвенавання.
●Працэс секвенавання ў сталым узросце:з кароткім часам выканання.
●Строгі кантроль якасціМы ўкараняем строгія патрабаванні да кантролю якасці, каб гарантаваць атрыманне пастаянна высокай якасці.
Прыклады платформаў
| Платформа | Праточная ячэйка | Рэжым секвенавання | Адзінка | Арыенціровачны аб'ём вытворчасці |
| NovaSeq X | 10B (8 палос) | ПЭ150 | Аднапалосны рух Частковая паласа | 375 Гб / лінія |
| 25B (8 палос) | ПЭ150 | Аднапалосны рух Частковая паласа | 1000 Гбіт/лінію | |
| NovaSeq 6000 | Праточная ячэйка SP (2 паласы) | ПЭ250 | Праточная ячэйка Аднапалосны рух Частковая паласа | 325-400 млн чытанняў / завулак |
| Праточная ячэйка S4 (4 паласы) | ПЭ150 | Праточная ячэйка Аднапалосны рух Частковая паласа | ~800 Гбіт/лінію |
Патрабаванні да ўзораў
| Аб'ём дадзеных (X) | Канцэнтрацыя (кПЦР/нМ) | Аб'ём | |
| Частковае паслядоўнасць паласы руху
| X ≤ 10 Гб | ≥ 1 нМ | ≥ 25 мкл |
| 10 Гб < X ≤ 50 Гб | ≥ 2 нМ | ≥ 25 мкл | |
| 50 Гб < X ≤ 100 Гб | ≥ 3 нМ | ≥ 25 мкл | |
| X > 100 Гб | ≥ 4 нМ | ≥ 25 мкл | |
| Паслядоўнасць палос | Пер Лейн | ≥ 1,5 нМ / бібліятэчны пул | ≥ 25 мкл / бібліятэчны пул |
Акрамя канцэнтрацыі і агульнай колькасці, таксама патрабуецца адпаведная пікавая карціна.
Заўвага: Для секвенавання дарожак бібліятэк з нізкай разнастайнасцю патрабуецца ўключэнне PhiX для забеспячэння надзейнага выкліку асноў.
Мы рэкамендуем адпраўляць папярэдне аб'яднаныя ў пулы бібліятэкі ў якасці ўзораў. Калі вам патрабуецца, каб BMKGENE выконваў аб'яднанне бібліятэк у пулы, звярніцеся да
патрабаванні бібліятэкі для частковага паслядоўнасці паласы руху.
Памер бібліятэкі (карта пікаў)
Асноўны пік павінен знаходзіцца ў межах 300-450 пар асноў.
Бібліятэкі павінны мець адзін асноўны пік, не забруджваць адаптарамі і не мець дымераў праймераў.
Калі ласка, звяжыцеся з намі, калі вашы ўзоры не адпавядаюць патрабаванням да зыходнага матэрыялу.
Працоўны працэс абслугоўвання
Кантроль якасці ў бібліятэцы
Секвенаванне
Кантроль якасці дадзеных
Рэалізацыя праекта
Справаздача аб кантролі якасці бібліятэкі
Справаздача аб якасці бібліятэкі прадастаўляецца перад секвенаваннем, ацэнкай колькасці бібліятэкі і фрагментацыі.
Справаздача аб кантролі якасці секвенавання
Табліца 1. Статыстыка па дадзеных секвенавання.
| Ідэнтыфікатар узору | БМКІД | Неапрацаваныя чытанні | Неапрацаваныя дадзеныя (б.п.) | Чыстыя чытанні (%) | К20 (%) | К30 (%) | ЗК (%) |
| C_01 | БМК_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | БМК_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Малюнак 1. Размеркаванне якасці па чытаннях у кожнай выбарцы
Малюнак 2. Размеркаванне базавага кантэнту
Малюнак 3. Размеркаванне прачытанага змесціва ў дадзеных секвенавання
