прадукты

Секвенирование ДНК/РНК - нанапоравы секвенсор

Секвеніраванне ДНК/РНК - нанапоравы секвенсор, паказаны малюнак

ONT секвенирование - гэта тэхналогія секвенирования электрычнага сігналу адной малекулы ў рэжыме рэальнага часу на аснове нанапор, прынцып секвенирования для кожнай платформы аднолькавы.Двухцепочечная ДНК/РНК будзе звязвацца з нанапорістым бялком, убудаваным у біяплёнку і раскручвацца пад кіраўніцтвам маторнага бялку, пад дзеяннем рознасці напружання з абодвух бакоў біяплёнкі ланцугі ДНК/РНК праходзяць праз бялковы канал нанапоры пры пэўным стаўка.З-за адрозненняў у хімічных уласцівасцях розных асноў на ланцугу ДНК/РНК, калі адна аснова або малекула ДНК праходзіць праз канал нанапор, гэта прывядзе да змены розных электрычных сігналаў.Выяўляючы гэтыя сігналы і адпавядаючы ім, можна вылічыць адпаведныя базавыя тыпы і завяршыць выяўленне паслядоўнасці ў рэжыме рэальнага часу.

Звяжыцеся з намі

Падрабязнасці абслугоўвання

Дэманстрацыйны вынік

Абслугоўванне Дэталі Асаблівасці

Платформа	Памер бібліятэкі	Тэарэтычны выхад даных (на ячэйку)	Аднабазавая дакладнасць	Прыкладанні
Нанапор	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, кДНК-ПЦР	70-90 Гб/ячэйку	85-92%	Выклік SV, De novo, поўнаметражнае секвеніраванне, Iso-Seq, анатацыя гена, выяўленне метылявання ДНК

Перавагі абслугоўвання

● Больш за 5 гадоў вопыту работы на платформе секвенирования PacBio з тысячамі закрытых праектаў з рознымі відамі.
● BMKGENE з'яўляецца афіцыйным партнёрам Oxford Nanopore з двухплатформеннай сертыфікацыяй РНК/ДНК.
● Існуюць асноўныя мадэлі секвенсераў з поўным абсталяваннем і дастатковай прапускной здольнасцю секвенсора.
● На аснове платформы Nanopore больш за 10 даследаванняў Denovo пра жывёл і расліны былі апублікаваны ў сусветна вядомых часопісах.

Узоры патрабаванняў

Тып выбаркі

Сума

Канцэнтрацыя (Qubit®)

Аб'ём

Чысціня

Іншыя

Геномная ДНК

Залежыць ад патрабаванняў да дадзеных

≥20нг/мкл

≥15 мкл

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Ясны пік пры 260 нм, без забруджванняў

Канцэнтрацыю трэба вымяраць кубітам і кубітам/нанапорам ≤ 2

Агульная РНК

≥1,2 мкг

≥100 мкг/мкл

≥15 мкл

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；без забруджванняў

Значэнне RIN ≥7,5

Працэс абслугоўвання

Падрыхтоўка пробы

Будаўніцтва бібліятэкі

Секвеніраванне

Аналіз дадзеных

Здача праекта

Папярэдняя: Секвенирование ДНК/РНК - Illumina Sequencer

далей: Паслядоўнасць узмоцненых фрагментаў канкрэтнага локуса (SLAF-Seq)

Ацэнка якасці дадзеных узору ДНК

Табліца 1. Статыстыка чыстых дадзеных.

БМКІД	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	чыстыN50Len	чыстыN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
ДНК_БМК01	1 218 239	26.37	1 121 736	25.90	28 014	15 764	23 090	143,181	9

Ацэнка якасці даных узору РНК

Табліца 1. Статыстыка чыстых дадзеных.

Імя файла	Ідэнтыфікатар кліента	ReadNum	BaseNum	N50	Сярэдняя даўжыня	Максімальная даўжыня	MeanQscore
РНК_БМК001	C2	8 947 708	4 047 230 083	398	452	129,227	Q12