Прадукты

Секвенаванне ДНК/РНК – нанапорны секвенар

ONT-секвенаванне — гэта тэхналогія секвенавання электрычных сігналаў адной малекулы ў рэжыме рэальнага часу, заснаваная на нанапорах. Прынцып секвенавання на кожнай платформе аднолькавы. Двухланцуговая ДНК/РНК звязваецца з нанапорыстым бялком, убудаваным у біяплёнку, і размотваецца пад уздзеяннем маторнага бялку. Пад дзеяннем розніцы напружання з абодвух бакоў біяплёнкі ланцугі ДНК/РНК праходзяць праз канал нанапор з пэўнай хуткасцю. З-за адрозненняў у хімічных уласцівасцях розных асноў у ланцугу ДНК/РНК, калі адна аснова або малекула ДНК праходзіць праз канал нанапор, гэта выклікае змяненне розных электрычных сігналаў. Шляхам выяўлення і супастаўлення гэтых сігналаў можна вылічыць адпаведныя тыпы асноў і завяршыць выяўленне паслядоўнасці ў рэжыме рэальнага часу.

Звяжыцеся з намі

Падрабязнасці паслугі

Вынік дэманстрацыі

Асаблівасці паслугі

Платформа	Памер бібліятэкі	Тэарэтычны выхад дадзеных (на ячэйку)	Аднабазавая дакладнасць	Прыкладанні
Нанапоры	8 кб, 10 кб, 20 кб, ультрадоўгія, кДНК-ПЦР	70-90 Гбіт/сота	85-92%	SV-выклік, De novo, поўнапамернае секвенаванне, Iso-Seq, анатацыя генаў, выяўленне метылявання ДНК

Перавагі абслугоўвання

● Больш за 5 гадоў вопыту працы на платформе секвенавання PacBio з тысячамі завершаных праектаў з рознымі відамі.
● BMKGENE з'яўляецца афіцыйным партнёрам Oxford Nanopore з падвойнай платформай сертыфікацыі РНК/ДНК.
● Існуюць асноўныя мадэлі секвенатараў з поўным абсталяваннем і дастатковай прапускной здольнасцю секвенавання.
● На аснове платформы Nanopore больш за 10 даследаванняў Denovo па жывёлах і раслінах былі апублікаваныя ў міжнародна вядомых часопісах.

Патрабаванні да ўзораў

Тып узору

Сума

Канцэнтрацыя (Qubit ®)

Аб'ём

Чысціня

Іншыя

Геномная ДНК

Залежыць ад патрабаванняў да дадзеных

≥20 нг/мкл

≥15 мкл

АД260/280=1,7-2,2;

АД260/230 ≥ 1,5;

Выразны пік пры 260 нм, без забруджванняў

Канцэнтрацыю трэба вымяраць з дапамогай кубіта і кубіта/нанапоры ≤ 2

Агульная РНК

≥1,2 мкг

≥100 мкг/мкл

≥15 мкл

АД260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; без забруджванняў

Значэнне RIN ≥7,5

Працоўны працэс абслугоўвання

Падрыхтоўка ўзору

Будаўніцтва бібліятэкі

Секвенаванне

Аналіз дадзеных

Рэалізацыя праекта

Папярэдняе: Гатовыя бібліятэкі Illumina

Далей: Секвенаванне фрагментаў з узмоцненым спецыфічным локусам (SLAF-Seq)

Ацэнка якасці дадзеных узору ДНК

Табліца 1. Статыстыка па чыстых дадзеных.

БМКІД	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	чыстыN50Len	чыстыN90Len	чыстыMeanLen	cleanMaxLen	чыстаеСярэдняеЯкасць
ДНК_BMK01	1 218 239	26.37	1 121 736	25,90	28 014	15 764	23 090	143 181	9

Ацэнка якасці дадзеных узору РНК

Табліца 1. Статыстыка па чыстых дадзеных.

Назва файла	Ідэнтыфікатар кліента	Нумар прачытанага	БазавыNum	Н50	Сярэдняя даўжыня	Максімальная даўжыня	Сярэдні Q-бал
RNA_BMK001	C2	8 947 708	4 047 230 083	398	452	129 227	Пытанне 12