-
Секвенаванне імунапрэцыпітацыі храмаціну (ChIP-seq)
ChIP-Seq забяспечвае агульнагеномнае прафіляванне ДНК-мішэняў для мадыфікацыі гистонов, фактараў транскрыпцыі і іншых бялкоў, звязаных з ДНК.Ён спалучае ў сабе селектыўнасць імунапрэцыпітацыі храмаціну (ChIP) для аднаўлення спецыфічных комплексаў бялок-ДНК з магутнасцю секвенавання новага пакалення (NGS) для высокапрадукцыйнага секвенавання адноўленай ДНК.Акрамя таго, паколькі комплексы бялок-ДНК здабываюцца з жывых клетак, сайты звязвання можна параўноўваць у розных тыпах клетак і тканінах або ў розных умовах.Прымяненне вар'іруюцца ад рэгуляцыі транскрыпцыі да шляхоў развіцця да механізмаў захворвання і далей.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Секвенаванне бісульфіту ўсяго геному
Метыляванне ДНК на пятай пазіцыі ў цытазіне (5-mC) аказвае фундаментальны ўплыў на экспрэсію генаў і клеткавую актыўнасць.Ненармальныя мадэлі метилирования былі звязаны з некалькімі станамі і захворваннямі, такімі як рак.WGBS стаў залатым стандартам для вывучэння агульнагеномнага метилирования з раздзяленнем адной базы.
Платформа: Illumina NovaSeq6000
-
Аналіз на транспазазу-даступны хромацін з высокай прапускной здольнасцю секвенавання (ATAC-seq)
ATAC-seq - гэта высокапрадукцыйны метад секвенавання для аналізу даступнасці храмаціну па ўсім геному, што важна для глабальнага эпігенетычнага кантролю экспрэсіі генаў.Адаптары секвенирования ўстаўляюцца ў адкрытыя ўчасткі храмаціне з дапамогай гіперактыўнай транспозазы Tn5.Пасля ПЦР-ампліфікацыі будуецца бібліятэка секвенавання.Усе адкрытыя ўчасткі храмаціну могуць быць атрыманы ў пэўных прасторава-часавых умовах, не абмяжоўваючыся толькі участкамі звязвання фактару транскрыпцыі або пэўнай мадыфікаванай гістоннай вобласцю.
-
Секвенаванне бісульфітаў паменшанага прадстаўлення (RRBS)
Даследаванне метилирования ДНК заўсёды было гарачай тэмай у даследаванні хвароб і цесна звязана з экспрэсіяй генаў і фенатыпічнымі рысамі.RRBS - гэта дакладны, эфектыўны і эканамічны метад для даследавання метилирования ДНК.Ўзбагачэнне абласцей промотора і CpG-астраўкоў шляхам ферментатыўнага расшчаплення (Msp I), у спалучэнні з бісульфітным секвенаваннем, забяспечвае выяўленне метилирования ДНК з высокім дазволам.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
