ØВысокі вопыт: больш за 200 000 узораў былі апрацаваны ў BMK, якія ахопліваюць розныя тыпы ўзораў, у тым ліку культуры клетак, тканіны, вадкасці арганізма і г.д., і больш за 7 000 праектаў mRNA-Seq, зачыненых, ахопліваючы розныя вобласці даследаванняў.
ØСтрогая сістэма кантролю якасці: асноўныя пункты кантролю якасці на ўсіх этапах, уключаючы падрыхтоўку пробы, падрыхтоўку бібліятэкі, секвенаванне і біяінфарматыку, знаходзяцца пад пільным кантролем для атрымання высакаякасных вынікаў.
ØНекалькі баз дадзеных даступныя для анатавання функцый і даследаванняў па ўзбагачэнні для дасягнення розных мэтаў даследавання.
ØПасляпродажнае абслугоўванне: пасляпродажнае абслугоўванне дзейнічае на працягу 3 месяцаў пасля завяршэння праекта, уключаючы наступныя дзеянні па праектах, ліквідацыю непаладак, пытанні і адказы па выніках і г.д.
Бібліятэка | Стратэгія паслядоўнасці | Рэкамендуемыя даныя | Кантроль якасці |
Poly A узбагачаны | Illumina PE150 | 6 Гб | Q30≥85% |
Нуклеатыды:
Чысціня | Цэласнасць | Сума |
OD260/280≥1,7-2,5 OD260/230≥0,5-2,5Абмежаванае забруджванне бялку або ДНК або яго адсутнасць на гелі. | Для раслін: RIN≥6,5;Для жывёл: RIN≥7;28S/18S≥1,0;абмежаваны або зусім адсутнічае вышыня зыходнай лініі | Канц.≥30 НГ/мкл;Аб'ём ≥ 10 мкл;Усяго ≥ 1,5 мкг |
Тканіна: Вага (сухая):≥1 г
*Для тканіны менш за 5 мг мы рэкамендуем адправіць флэш-замарожаную (у вадкім азоте) узор тканіны.
Завісь клетак:Колькасць клетак = 3×106- 1×107
*Мы рэкамендуем адпраўляць замарожаныя лізат клетак.У выпадку, калі колькасць ячэек менш за 5×105, рэкамендуецца флэш-замарожванне ў вадкім азоте, што з'яўляецца пераважным для мікраэкстракцыі.
Узоры крыві:Аб'ём≥1 мл
Мікраарганізмы:Маса ≥ 1 г
Кантэйнер: цэнтрыфужная прабірка 2 мл (фальга не рэкамендуецца)
Маркіроўка ўзору: група+рэплік, напрыклад, A1, A2, A3;B1, B2, B3 ... ...
Адпраўка:
Біяінфарматыка
Эўкарыёт Рабочы працэс аналізу паслядоўнасці мРНК
Біяінфарматыка
ØКантроль якасці сырых дадзеных
ØЭталоннае выраўноўванне геному
ØАналіз структуры транскрыптаў
ØКолькаснае вызначэнне выразаў
ØАналіз дыферэнцыяльных выразаў
ØАнатацыя і ўзбагачэнне функцыі
1.Крывая насычэння дадзеных мРНК
2.Дыферэнцыяльны аналіз выразаў-Вулкан сюжэт
3.Анатацыя KEGG на DEG
4.Класіфікацыя GO па DEG