Доўгае некадавальнае секвеніраванне-Illumina
Перавагі абслугоўвання
●Сумесны аналіз мРНК і lncRNA: спалучаючы колькасную ацэнку транскрыптаў мРНК з вывучэннем lncRNA і іх мішэняў, можна атрымаць глыбокі агляд рэгулятарнага механізму, які ляжыць у аснове клеткавага адказу.
●Шырокі вопыт: Наша каманда прыўносіць багаты вопыт у кожны праект, маючы паслужны спіс апрацоўкі больш за 23 000 узораў у BMK, якія ахопліваюць розныя тыпы ўзораў і праекты lncRNA.
●Строгі кантроль якасці: Мы ўкараняем асноўныя кантрольныя кропкі на ўсіх этапах, ад падрыхтоўкі ўзору і бібліятэкі да секвеніравання і біяінфарматыкі. Такі дбайны маніторынг гарантуе нязменна высокую якасць вынікаў.
●Пасляпродажная падтрымка: Наша прыхільнасць распаўсюджваецца і на 3-месячны перыяд пасляпродажнага абслугоўвання. У гэты час мы прапануем назіранне за праектам, дапамогу ў ліквідацыі непаладак і сеансы пытанняў і адказаў для адказу на любыя пытанні, звязаныя з вынікамі.
Узоры патрабаванняў і пастаўка
| Бібліятэка | Платформа | Рэкамендуемыя дадзеныя | КК даных |
| рРНК збедненая накіраваная бібліятэка | Illumina PE150 | 10-16 Гб | Q30≥85% |
Нуклеатыды:
| Канц. (нг/мкл) | Колькасць (мкг) | Чысціня | Сумленнасць |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Забруджванне бялком або ДНК на гелі абмежавана або адсутнічае. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; абмежаванае павышэнне зыходнага ўзроўню або яго адсутнасць |
● Расліны:
Корань, сцябло або пялёстак: 450 мг
Лісце або насенне: 300 мг
Садавіна: 1,2 г
● Жывёла:
Сэрца або кішачнік: 450 мг
Вантробы або мозг: 240 мг
Мышцы: 600 мг
Косткі, валасы або скура: 1,5 г
● Членістаногія:
Казуркі: 9г
Ракападобныя: 450 мг
● Суцэльная кроў:2 трубкі
● Вочкі: 106 вочак
● Сыроватка і плазма: 6 мл
Рэкамендаваны ўзор дастаўкі
Кантэйнер: цэнтрыфужная прабірка аб'ёмам 2 мл (фальга не рэкамендуецца)
Прыклад маркіроўкі: група+рэплікацыя, напрыклад, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Адгрузка:
1. Сухі лёд: Узоры трэба спакаваць у пакеты і закапаць у сухі лёд.
2. Прабіркі для стабілізацыі РНК: узоры РНК можна высушыць у прабірцы для стабілізацыі РНК (напрыклад, RNAstable®) і адправіць пры пакаёвай тэмпературы.
Працэдура абслугоўвання
Дызайн эксперыменту
Дастаўка ўзору
Вылучэнне РНК
Будаўніцтва бібліятэкі
Секвеніраванне
Аналіз дадзеных
Пасляпродажнае абслугоўванне
Біяінфарматыка
Аналіз дыферэнцыяльнай экспрэсіі генаў (DEG).
Колькасная ацэнка экспрэсіі lncRNA - кластарызацыі
Ўзбагачэнне генаў-мішэняў lncRNA
Сумесны аналіз становішча мРНК і lncRNA - графік Circos (сярэдняе кола - мРНК, а ўнутранае кола - lncRNA)
Даследуйце дасягненні, якія спрыяюць паслугі эквівалентнасці lncRNA BMKGene, праз падабраную калекцыю публікацый.
Джы, Х. і інш. (2020) «Ідэнтыфікацыя, функцыянальнае прагназаванне і праверка ключавой lncRNA звязаных з халодным стрэсам lncRNAs у печані пацукоў», Навуковыя даклады 2020 10:1, 10(1), стар. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Цзя, З. і інш. (2021) «Інтэграцыйны транскрыптамічны аналіз раскрывае імунны механізм штаму карпа, устойлівага да CyHV-3», Frontiers in Immunology, 12, с. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Ван, XJ і інш. (2022) «Вызначэнне прыярытэтаў на аснове інтэграцыі Multi-Omics канкуруючых эндагенных сетак рэгуляцыі РНК пры мелкоклеточном раку лёгкага: малекулярныя характарыстыкі і кандыдаты ў лекі», Frontiers in Oncology, 12, с. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Сяо, Л. і інш. (2020) «Генетычнае разбіранне сеткі суэкспрэсіі генаў, якая ляжыць у аснове фотасінтэзу ў Populus», Plant Biotechnology Journal, 18 (4), стар. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Чжэн Х. і інш. (2022) «Глабальная сетка рэгулявання дысрэгуляванай экспрэсіі генаў і анамальнай метабалічнай перадачы сігналаў у імунных клетках у мікраасяроддзі хваробы Грейвса і тырэяідыту Хасімота», Frontiers in Immunology, 13, с. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
