Метабаломіка
Асаблівасці
●Не-мэтанакіраваная метабаломіка (метабаломіка выяўлення)
Немэтавая метабаломіка, заснаваная на тэхналогіі вадкаснай храматаграфіі-мас-спектрометрыі (LC-MS), дазваляе аб'ектыўна выяўляць як мага больш нізкамалекулярных метабалітаў у біялагічных узорах, такіх як клеткі, тканіны, органы або біялагічныя вадкасці. Яна праводзіць параўнальны аналіз паміж эксперыментальнымі і кантрольнымі групамі, скрынінгуе дыферэнцыяльныя метабаліты з дапамогай статыстычнага аналізу.
● Немэтавая метабаломіка ліпідаў
Выкарыстоўваючы тэхналогію вадкаснай храматаграфіі-мас-спектрометрыі (LC-MS),nМэтавая метабаломіка ліпідаў дазваляе аб'ектыўна выяўляць як мага большую колькасць ліпідных малекул у біялагічных узорах, уключаючы клеткі, тканіны, органы або біялагічныя вадкасці.
● Шырокі-Мэтавая метабаломіка
Гэтая паслуга ідэальна спалучае перавагі высокага разрознення і шырокага пакрыцця немэтавага выкарыстання з высокай адчувальнасцю і магчымасцямі дакладнага колькаснага вызначэння мэтавай тэхналогіі MRM (маніторынг некалькіх рэакцый). Працоўны працэс выглядае наступным чынам: спачатку выкарыстоўваецца мас-спектрометрыя высокага разрознення для правядзення сканавання MS² з ультравысокім пакрыццём узораў, каб атрымаць спектры MS² "усіх" метабалітаў. Затым праводзіцца дакладная ідэнтыфікацыя метабалітаў шляхам іх аб'яднання з бібліятэкай MS² высокага разрознення (якая ахоплівае больш за 25 000 метабалітаў, з некалькімі стандартнымі спектрамі MS² высокага разрознення для кожнага метабаліту). Далей інфармацыя аб іённых парах MRM здабываецца з мас-спектраў для стварэння спецыяльнай бібліятэкі для ўзораў. Нарэшце, для дакладнага колькаснага вызначэння выкарыстоўваецца трайная квадрупольная мас-спектрометрыя з тэхналогіяй MRM.
● Мэтавая метабаломіка
Мэтавая метабаломіка факусуецца на некалькіх мэтавых злучэннях або ўсіх/частковых метабалітах, якія ўдзельнічаюць у пэўным шляху. Выкарыстоўваючы стандартныя рэчывы, яна ўстанаўлівае метад выяўлення з высокай спецыфічнасцю, высокай адчувальнасцю і добрай паўтаральнасцю для колькаснага вызначэння і аналізу мэтавых злучэнняў. Для абсалютнай колькаснай ацэнкі выкарыстоўваецца знешні стандарт у спалучэнні з унутраным стандартам, прычым лінейнасць стандартнай крывой дасягае больш за 0,99, а адчувальнасць дасягае ўзроўню нг/мл.
Перавагі
●Пашыраная платформа выяўлення
-Абсталяваны першакласнымі мас-спектрометрамі высокага разрознення і патройнымі квадрупольнымі мас-спектрометрамі, што дазваляе адначасова выяўляць і аналізаваць тысячы метабалітаў.
●Комплексныя базы дадзеных
- Публічныя базы дадзеных: ахопліваюць METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas і Lipidmaps, якія ахопліваюць больш за 500 000 метабалітаў.
- УнутранаяБаза дадзеных, прысвечаная канкрэтным раслінам: змяшчае больш за 25 000 метабалітаў, у тым ліку першасныя і другасныя метабаліты.
- УнутранаяБаза дадзеных, прысвечаная жывёлам/медыцынскім прэпаратам: уключае больш за 12 000 метабалітаў.
●Строгая сістэма кантролю якасці
-Строгі кантроль якасці, які ахоплівае стабільнасць прыбора, рэшткі рэчываў, кантроль якасці, аналіз узораў PCA і карэляцыйны аналіз для забеспячэння надзейнай якасці дадзеных.
●Высокая здольнасць выяўляць метабаліты
- Не-Мэтавая метабаломіка: выяўляе ў сярэднім больш за 4200 метабалітаў за адзін аналіз, што ідэальна падыходзіць для вывучэння невядомых метабалітаў ва ўзорах і ідэнтыфікацыі метабалітаў у складаных узорах.
- Шырокі-Мэтавая метабаломіка (расліна): выяўляе ў сярэднім больш за 2410 метабалітаў за адзін прагон, уключаючы першасныя і другасныя метабаліты.
- Шырокі-Мэтавая метабаломіка (жывёлы): выяўляе ў сярэднім больш за 1250 метабалітаў за адзін прагон.
- Мэтавая метабаломіка: панэлідлянекалькі катэгорый метабалітаў.
●Усебаковы аналіз
-Прапануе больш за 10 аналітычных элементаў і больш за 20 дыяграм візуалізацыі.
●Прадуманае пасляпродажнае абслугоўванне
-Забяспечвае пасляпродажныя кансультацыі і падтрымку ў інтэрпрэтацыі канчатковай справаздачы.
Спецыфікацыі паслуг
| Рашэнне | Платформа | Рэкамендаваныя біялагічныя паўторы |
|---|---|---|
| Немэтавая метабаломіка | УВЭЖХ-ТОФ-МС (Waters Xevo G2-XS QTof) | Узор раслін і мікробаў: ≥ 6 Узор жывёл: ≥ 10 Клінічны ўзор: ≥ 30 Усе біялагічныя паўторныя ўзоры аналізаваліся незалежна. |
| Шырока мэтавая метабаломіка | Вада Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | Узор расліны: ≥ 3 |
| Мэтавая метабаломіка | Звышвысокапрадукцыйная вадкасная хроматографія (UHPLC-QQQ-MS) (AB Sciex QTRAP 6500+) ГХ-МС (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977) | Узор расліны: ≥ 3 Узор жывёл: ≥ 6 |
Патрабаванні да ўзораў
Ці адпавядаюць вашы ўзоры нашым крытэрыям? Націсніце тут, каб атрымаць нашыапошнія патрабаванні да ўзораў.
Працоўны працэс абслугоўвання
Збор узораў
Экстракцыя метабалітаў
Збор дадзеных
Аналіз дадзеных
Дастаўка дадзеных
1. Фонавы шум і нізкая якасць апрацоўкі неапрацаваных дадзеных
2. Ацэнка якасці дадзеных
2.1 Аналіз галоўных кампанент
2.2 Ацэнка ўзнаўляльнасці
3. Анатацыя метабалітаў
3.1 Анатацыя базы дадзеных KEGG
3.2 Анатацыя базы дадзеных HMDB
3.3 Анатацыя базы дадзеных Lipidmaps
4. Аналіз дадзеных групавання ўзораў (біялагічныя паўторы≥3)
4.1 Аналіз галоўных кампанент групы
4.2 Дыскрымінантны аналіз з выкарыстаннем метаду артаганальных частковых найменшых квадратаў (OPLS-DA)
4.3 Групавы дыферэнцыяльны аналіз метабалітаў
5. Дыферэнцыяльны адбор метабалітаў (біялагічныя паўторы≥3)
5.1 Аналіз дыферэнцыяльных змен у кратнасці
5.2 Дыяграма дыферэнцыяльнага метабалітнага вулкана
5.3 Дыферэнцыяльная цеплавая карта кластэрызацыі метабалітаў
5.4 Дыяграма карэляцыі дыферэнцыяльных метабалітаў
5.5 Дыферэнцыяльны графік Z-балаў метабалітаў
5.6 Дыферэнцыяльны аналіз метабалітных радарных дыяграм
5.7 Дыферэнцыяльны графік метабалітаў
5.8 Дыферэнцыяльная скрынкавая дыяграма метабалітаў
5.9 Дыферэнцыяльны метабаліт KEGG, функцыянальная анатацыя і аналіз узбагачэння
5.10 Аналіз ROC-крывой
5.11 Дыферэнцыяльная кластэрызацыя метабалітаў па k-сярэдніх
5.12 Дыяграма Вена дыферэнцыяльных метабалітаў
1. Ацэнка якасці дадзеных
↑Cаналіз арэляцый(Тэставы ўзор/ўзор кантролю якасці)
↑Аналіз галоўных кампанентаў ↑Аналіз кластэрызацыі метабалітаў
2. Анатацыя метабалітаў
↑Анатацыя базы дадзеных KEGG↑Анатацыя базы дадзеных HMDB
↑Анатацыя базы дадзеных Lipidmaps
3. Аналіз дадзеных групавання ўзораў (біялагічныя паўторы≥3)
↑Аналіз галоўных кампанент групы(2D/3D)
↑Артаганальны дыскрымінантны аналіз з выкарыстаннем метаду найменшых квадратаў (OPLS-DA)
4. Дыферэнцыяльны адбор метабалітаў (біялагічныя паўторы≥3)
↑Аналіз дыферэнцыяльных змен у кратнасці↑Дыферэнцыяльны графік вулкана метабалітаў
↑Дыферэнцыяльная цеплавая карта кластэрызацыі метабалітаў↑Дыферэнцыяльны графік карэляцыі метабалітаў
↑Графік Z-паказчыка дыферэнцыяльнага метабаліту↑Дыферэнцыяльны аналіз радарнай дыяграмы метабалітаў
↑Дыферэнцыяльны графік метабалітаўДыферэнцыяльная скрынкавая дыяграма метабалітаў
↑Функцыянальная анатацыя і аналіз узбагачэння дыферэнцыяльнага метабаліту KEGG
↑Аналіз ROC-крывой↑Дыферэнцыяльная кластэрызацыя метабалітаў k-сярэдніх
↑ Дыферэнцыяльны метабаліт Дыяграма Венна
Ван Х, Ван Д, Лю Х, Чжан Х, Чэнь Г, Сюй М, Шэнь Х, Ю К. BEL1-падобны гомеадаменны транскрыпцыйны фактар SAWTOOTH1 (MdSAW1) у Malus domestica павышае талерантнасць трансгенных яблынь і Arabidopsis да лішку цынку ў стрэсе. Int J Biol Macromol. 2025 май;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 2025 сакавік 10. PMID: 40074134.
Айн Ку, Хусейн Х.А., Рахман Л., Чжан Ку, Рэхман А., Хусейн С., Удзін С., Імран А. Інтэрактыўны ўплыў зялёных наначасціц, апасродкаваных Moringa oleifera, і арбускулярных мікарызных грыбоў на рост, структуру каранёвай сістэмы і паглынанне пажыўных рэчываў у кукурузы (Zea mays L.). Plant Physiol Biochem. 2025 верасень;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 2025 мая 24. PMID: 40441096.
Ван Х, Луо Дж, Ван К, Чжан К, Чжао Т, Лю Ю, Лі Т, Лю Х, Цзян Дж. Жасманат актывуе модуль, падобны на SlJAZ2/3-SlMYC3, які рэгулюе паглынанне K+ у рэакцыі памідораў на стрэс з нізкім узроўнем K+. J Integr Plant Biol. Жнівень 2025 г.;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 28 мая 2025 г. PMID: 40432500.
