Секвенаванне метатранскрыптомаў
Асаблівасці сэрвісу
● Дэплецыя рРНК з наступнай падрыхтоўкай накіраванай бібліятэкі мРНК.
● Секвенаванне на Illumina NovaSeq.
Перавагі абслугоўвання
●Вывучыце змены складаных мікробных супольнасцей:Гэта адбываецца на транскрыпцыйным узроўні і дазваляе даследаваць патэнцыйныя новыя гены.
●Тлумачэнне ўзаемадзеяння мікробнай супольнасці з гаспадаром або навакольным асяроддзем.
●Комплексны біяінфарматычны аналізГэта дае ўяўленне аб таксанамічным і функцыянальным складзе супольнасці, а таксама аналіз дыферэнцыяльнай экспрэсіі генаў.
●Пашыраная анатацыя генаў:Выкарыстанне сучасных баз дадзеных функцый генаў для атрымання інфарматыўнай інфармацыі аб экспрэсіі генаў мікробных супольнасцей.
●Пасляпродажная падтрымка:Нашы абавязацельствы распаўсюджваюцца і на завяршэнне праекта, бо мы прапануем 3-месячны пасляпродажны перыяд абслугоўвання. На працягу гэтага часу мы прапануем суправаджэнне праекта, дапамогу ў ліквідацыі непаладак і сесіі пытанняў і адказаў, каб адказаць на любыя пытанні, звязаныя з вынікамі.
Спецыфікацыі паслуг
| Платформа секвенавання | Стратэгія секвенавання | Рэкамендаваныя дадзеныя | Кантроль якасці дадзеных |
| Illumina NovaSeq | ПЭ150 | 12 Гб | Q30≥85% |
Патрабаванні да ўзораў
| Канцэнтрацыя (нг/мкл) | Агульная колькасць (мкг) | Аб'ём (мкл) | АД260/280 | АД260/230 | РІН |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Працоўны працэс абслугоўвання
Дастаўка ўзораў
Будаўніцтва бібліятэкі
Секвенаванне
Аналіз дадзеных
Пасляпродажнае абслугоўванне
Уключае наступны аналіз:
● Кантроль якасці дадзеных секвенавання
● Зборка транскрыптаў
● Таксанамічная анатацыя і колькасць
● Функцыянальная анатацыя і багацце
● Колькасная ацэнка экспрэсіі і дыферэнцыяльны аналіз
Таксанамічнае размеркаванне кожнага ўзору:
Бэта-аналіз разнастайнасці: UPGMA
Функцыянальная анатацыя – багацце GO
Дыферэнцыяльная таксанамічная колькасць – LEFSE
Даведайцеся пра дасягненні, якія дасягаюцца дзякуючы паслугам метатранскрыптомнага секвенавання BMKGene, з дапамогай спецыяльна адабранай калекцыі публікацый.
Lu, Z. et al. (2023) «Кіслотная талерантнасць бактэрый, якія ўтылізуюць лактат, з парадку Bacteroidales спрыяе прафілактыцы ацыдозу рубца ў коз, адаптаваных да дыеты з высокім утрыманнем канцэнтратаў».Харчаванне жывёл, 14, с. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Сонг, З. і інш. (2017) «Вызначэнне асноўнай функцыянальнай мікрабіёты ў традыцыйнай цвёрдафазнай ферментацыі з дапамогай высокапрадукцыйных ампліконаў і метатранскрыптомнага секвенавання».Межы ў мікрабіялогіі, 8 (ліпень). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/ПОЎНЫ.
Ван, У. і інш. (2022) «Новыя мікавірусы, выяўленыя ў выніку метатранскрыптомічнага даследавання фітапатагеннага грыба Alternaria»,Вірусы, 14(11), с. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Вэй, Дж. і інш. (2022) «Паралельны метатранскрыптомны аналіз выяўляе дэградацыю другасных метабалітаў раслін жукамі і іх кішачнымі сімбіёнтамі».Малекулярны Экалогія, 31 (15), стар. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
