Секвеніраванне метатранскрыптому
Асаблівасці абслугоўвання
● Знясіленне рРНК з наступнай накіраванай падрыхтоўкай бібліятэкі мРНК.
● Секвеніраванне на Illumina NovaSeq.
Перавагі абслугоўвання
●Вывучыце змены складаных мікробных супольнасцей:Гэта адбываецца на ўзроўні транскрыпцыі і даследуюць патэнцыйныя новыя гены.
●Тлумачэнне ўзаемадзеяння мікробнай супольнасці з гаспадаром або навакольным асяроддзем.
●Комплексны біяінфарматычны аналіз: Гэта дае інфармацыю пра таксанамічны і функцыянальны склад супольнасці, а таксама пра дыферэнцыяльны аналіз экспрэсіі генаў.
●Шырокая генная анатацыя:Выкарыстанне сучасных баз дадзеных функцый генаў для інфарматыўнай інфармацыі аб экспрэсіі генаў мікробных супольнасцей.
●Пасляпродажная падтрымка:Нашы абавязацельствы распаўсюджваюцца не толькі на завяршэнне праекта, але і на 3-месячны перыяд пасляпродажнага абслугоўвання. У гэты час мы прапануем назіранне за праектам, дапамогу ў ліквідацыі непаладак і сеансы пытанняў і адказаў для адказу на любыя пытанні, звязаныя з вынікамі.
Спецыфікацыі абслугоўвання
| Платформа секвенирования | Стратэгія паслядоўнасці | Рэкамендаваны даныя | Кантроль якасці дадзеных |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12 Гб | Q30≥85% |
Узоры патрабаванняў
| Канцэнтрацыя (нг/мкл) | Агульная колькасць (мкг) | Аб'ём (мкл) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1,8-2,0 | 1,0-2,5 | ≥6,5 |
Працэдура абслугоўвання
Дастаўка ўзораў
Будаўніцтва бібліятэкі
Секвеніраванне
Аналіз дадзеных
Пасляпродажнае абслугоўванне
Уключае наступны аналіз:
● Кантроль якасці дадзеных паслядоўнасці
● Асамблея стэнаграмы
● Таксанамічная анатацыя і колькасць
● Функцыянальная анатацыя і дастатак
● Колькасная ацэнка выразаў і дыферэнцыяльны аналіз
Таксанамічнае размеркаванне кожнага ўзору:
Бэта-аналіз разнастайнасці: UPGMA
Функцыянальная анатацыя – багацце GO
Дыферэнцыяльная таксанамія багацця - LEFSE
Азнаёмцеся з дасягненнямі, якія спрыяюць паслугі секвеніравання метатранскрыптамікі BMKGene, праз падабраную калекцыю публікацый.
Лу, З. і інш. (2023) «Талерантнасць да кіслот утылізуючых лактат бактэрый атрада Bacteroidales спрыяе прафілактыцы ацыдозу рубца ў коз, адаптаваных да дыеты з высокім утрыманнем канцэнтратаў»,Харчаванне жывёл, 14, с. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Песня, З. і інш. (2017) "Раскрыццё асноўнай функцыянальнай мікрабіёты ў традыцыйнай цвёрдацельнай ферментацыі з дапамогай высокапрадукцыйных ампліконаў і метатранскрыптамічнага секвеніравання",Межы ў мікрабіялогіі, 8(ЛІПЕНЯ). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/ПОЎНЫ.
Wang, W. і інш. (2022) «Новыя мікавірусы, выяўленыя ў метатранскрыптамічным даследаванні фітапатагеннага грыба альтэрнарыя»,Вірусы, 14(11), с. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. і інш. (2022) «Паралельны аналіз метатранскрыптама выяўляе дэградацыю другасных метабалітаў раслін жукамі і іх кішачнымі сімбіёнтамі»,Малекулярны Экалогія, 31 (15), стар. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
